综述:非编码 RNA 在癌症干细胞调控中作为 “起搏器” 的作用:一篇综述文章

《Journal of the Egyptian National Cancer Institute》:Role of noncoding RNA as a pacemaker in cancer stem cell regulation: a review article

【字体: 时间:2025年03月25日 来源:Journal of the Egyptian National Cancer Institute 2.1

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  本文聚焦非编码 RNA(ncRNA)对癌症干细胞(CSCs)的调控作用,探讨其潜在治疗价值,值得关注。

  

癌症干细胞研究背景

癌症是全球主要死因,传统癌症治疗手段如手术、化疗和放疗常面临高失败率与复发问题。癌症干细胞(CSCs)理论的出现为解释这一现象提供了新视角。CSCs 是肿瘤中一小部分具有干细胞特性的细胞,它们拥有自我更新、分化和多能性,在肿瘤发展和复发中扮演关键角色。CSCs 的分子信号通路异常,像 JAK/STAT、Wnt、NF-κB 和 PI3K/Akt/mTOR 等通路,这些通路的失调影响了 CSCs 的自我更新、增殖、存活和分化。
人体基因组约 90% 转录为 RNA,但仅有 1.5 - 2.0% 是蛋白质编码基因,其余大部分为非编码 RNA(ncRNA)。ncRNA 根据转录本大小可分为小于 200bp 的小 ncRNA,如 Piwi 相关 RNA(piRNAs)、微小 RNA(miRNA)和小核仁 RNA(snoRNAs),以及大于 200bp 的长链非编码 RNA(lncRNA)。越来越多研究表明 lncRNA 参与肿瘤相关通路,在 CSCs 中发挥重要作用。本综述旨在探索 ncRNA 在不同癌症 CSCs 中的功能,以及其潜在的治疗应用。

癌症干细胞的发现

1997 年,科学家成功从白血病患者体内提取出表面标记为 CD34+但 CD38-的独特白血病细胞,这些细胞能在 NOD/SCID 小鼠体内引发肿瘤,这一发现开启了癌症干细胞的研究大门。随后,实体肿瘤 CSCs 在乳腺癌(CD44+CD24-/lowLin-)中被识别,之后又在结直肠癌、脑癌等多种癌症中分离得到。

癌症干细胞与正常干细胞的区别

癌症干细胞(CSCs)和正常干细胞(NSCs)都具备自我更新和分化能力。NSCs 能不对称分裂,产生新的干细胞和祖细胞,在个体一生中维持干细胞群体。NSCs 分为胚胎干细胞(ESCs)和成体干细胞(ASCs),ESCs 位于囊胚内细胞团,具有多能性,可分化为成熟机体的各种细胞;ASCs 则是组织特异性细胞,能产生特定组织的有限种类细胞。诱导多能干细胞(iPS)是通过将组织特异性细胞转化为类似 ESCs 的细胞,在研究正常发育、疾病进展和测试新疗法方面具有重要意义。
虽然 CSCs 和 NSCs 有相似之处,但 CSCs 是肿瘤发生和复发的根源。研究 NSCs 有助于理解 CSCs 的本质,为癌症治疗提供新的方向。

癌症干细胞的起源

关于 CSCs 的起源有多种理论。一种理论认为 CSCs 源于已存在的干细胞,这些 NSCs 经过多次肿瘤形成和转移相关的突变后转化为 CSCs;另一种理论提出 CSCs 起源于祖细胞或前体细胞,这些半分化细胞在胎儿和成人组织中频繁分裂,基因突变更容易积累,从而引发肿瘤;还有理论认为 CSCs 可能由成熟分化细胞去分化产生,获得干细胞样特征。这些理论表明,多种遗传改变可能参与了细胞向干细胞样细胞的转化过程,组织中的许多细胞可能具有致瘤潜力。

癌症干细胞的特征

CSCs 具有高干性,这源于其高表达干细胞基因,并且能够形成细胞球。传统的化疗和放疗难以根除 CSCs,因为它们高表达抗凋亡蛋白和多药耐药转运体 ABC。CSCs 是癌症对传统疗法产生耐药性的主要原因。此外,CSCs 在 Notch、Hedgehog(HH)和 Wnt 等多种信号通路中存在异常。众多研究尝试通过靶向 CSC 特异性标记、相关信号通路和微环境来消除 CSCs,但由于 CSCs 的异质性,单一 CSC 标记难以有效区分 CSCs 和非 CSCs,抑制单一信号通路也无法显著影响所有 CSCs,这些靶向策略存在一定局限性。

癌症干细胞的信号通路

调控 CSCs 的分子信号通路出现异常,影响其自我更新、增殖、存活和分化。评估干细胞特性的方法包括检测细胞表面蛋白(如 CD44 和 CD133)、细胞内标记(如醛脱氢酶 ALDH)、干性相关基因(如 OCT4 和 SOX2)以及进行表型测试(如肿瘤球形成和体内连续肿瘤移植)。主要的 CSC 信号通路包括 JAK/STAT、Wnt、NF-κB 和 PI3K/Akt/mTOR 等。
  • JAK/STAT 信号通路:当细胞因子(如白细胞介素和干扰素)与受体结合,会激活 JAK/STAT 信号通路。受体寡聚化使 JAK 蛋白磷酸化,进而磷酸化 STAT 蛋白,使其二聚化并进入细胞核启动靶基因转录。该通路在维持胚胎干细胞自我更新、造血和神经发生中起作用。前列腺癌干细胞中与 JAK/STAT 信号相关的基因表达升高,阻断 CSCs 中的 STAT3 可抑制其增殖和肿瘤球形成,降低神经元中干细胞基因的表达。在白血病 CSCs 中,JAK/STAT 信号持续激活,使用 JAK1/2 抑制剂可降低 CSCs 的存活率。
  • Wnt 信号通路:Wnt 信号通路参与 CSCs 的调控,它包含经典通路(涉及 β -catenin、TCF 和 LEF)、非经典通路(独立于 β -catenin)和非经典 Wnt - 钙通路。经典 Wnt 通路与干细胞的扩增和维持有关,参与祖细胞的增殖和分化。SAM68 通过 Wnt β -catenin 通路特异性靶向 CSCs,驱虫药 Niclosamide 可抑制 Wnt β -catenin 通路,对卵巢 CSCs 具有抗癌作用。
  • Notch 信号通路:Notch 受体家族有四个成员(Notch 1 - 4),能与五种不同配体相互作用。Notch 通路相关的关键 CSC 标记包括 CD133、Musashi - 1、CD44 等。在不同癌症中,Notch 的表达水平不同,如在脑、胰腺肿瘤和乳腺癌中,Notch 1、2 和 3 水平升高,而在结直肠癌中表达降低。在乳腺癌中,Notch 基因的作用因肿瘤分子亚型而异,Notch1 可促进 HER2 转录,增加乳腺和乳腺癌 CSCs;Notch2 和 Notch3 有助于祖细胞向腔上皮细胞转化,Notch3 还能增强侵袭能力;Notch4 在乳腺癌 CSC 群体中占主导,存在于基底细胞中。Notch 信号激活与上皮 - 间质转化(EMT)相关,可促进肿瘤转移。
  • PI3K/Akt/mTOR 信号通路:PI3K 信号通路在多种癌症中过度活跃,对 CSCs 的肿瘤发展和干性调节至关重要。PTEN 是肿瘤生长的重要抑制因子,其基因改变会导致细胞抗凋亡和迁移能力增强。抑制该通路可减轻卵巢癌和肺癌细胞的化疗耐药性和干性,是胶质母细胞瘤的潜在治疗靶点。

非编码 RNA(ncRNA)概述

1958 年,弗朗西斯?克里克提出中心法则,揭示了 DNA 到蛋白质的合成过程。过去人们认为蛋白质是遗传信息的主要功能终产物,而如今研究发现,哺乳动物和其他复杂生物体基因组中有很大一部分转录为 ncRNA,许多 ncRNA 会经过剪接和进一步加工。
2001 年,在线虫中发现的 lin - 4 和 let - 7 等小 RNA 开启了 ncRNA 研究的新时代,这些 ncRNA 没有蛋白质编码区域,但在生长发育中具有关键功能。ncRNA 根据转录本大小分为小 ncRNA 和 lncRNA,小 ncRNA 包括 piRNAs、miRNA 和 snoRNAs 等。

miRNA 与 CSCs 的关系

miRNA 是长度为 20 - 25 个核苷酸的小 RNA,通过与 mRNA 的 3` 端碱基配对调控翻译过程。miRNA 的生物发生始于细胞核,由 RNA 聚合酶 II 转录生成初级 miRNA(pri - miRNA),经 Drosha 核酸内切酶切割形成约 70 个核苷酸的前体 miRNA(pre - miRNA),再转运到细胞质中,由 dicer - 1 核酸内切酶进一步切割,最终形成成熟 miRNA。
研究发现 miRNA 异常表达与肿瘤进展相关。许多 miRNA 在干细胞功能中起关键作用,例如在小鼠模型中,缺乏参与 pre - miRNA 加工的 Dicer - 1 会导致动物发育过程中过早死亡,胚胎内干细胞数量减少。在 CSCs 中,miRNA 可作为肿瘤发生、转移、分化和 EMT 的抑制因子或激活剂。let - 7 家族通过靶向多个通路在癌症发展中起重要作用,其在 CSCs 中的表达低于亲本细胞,能抑制乳腺癌细胞分裂和乳腺球形成;miR - 21 在多种癌症和 CSCs 中高表达,与缺氧诱导因子(HIF - 1α)共同调节乳腺癌 CSCs 的增殖;miR - 26 可抑制多梳蛋白 EZH2,影响 CSCs 的血管生成、侵袭和自我更新能力;miR - 34a 能降低 CSC 基因的表达,抑制肿瘤增殖,还可通过影响凋亡和自我更新通路抑制 CSCs 的自我更新特性;miR - 200 家族成员在癌症进展中也发挥重要作用,如 miR - 200c 可下调与 CSC 和 EMT 表型相关的基因。

lncRNA 与 CSCs 的关系

许多 lncRNA 在癌症 CSCs 的不同发育阶段发挥调控作用。如 lncRNA ROR 在多种癌症中上调,它靶向多能干细胞表型的重要转录因子 SOX2、OCT4 和 NANOG,影响 DNA 和干细胞的自我更新,与胃癌 CSC 的分化和自我更新相关;HOTAIR 转录自 HOXC 基因簇的反义链,在多种癌症中上调,与肿瘤转移有关,能增强 CSCs 的自我更新能力,敲除 HOTAIR 可抑制肿瘤生长;H19 是母系表达基因,与雌激素调节有关,异常表达会促进多种癌症发展,增加肿瘤的致瘤性和肝转移能力;LINC01426 在肺腺癌中上调,影响 Shh 泛素化,激活肺 CSCs 中的 Hedgehog 通路,促进细胞增殖和迁移;LINC01106 可诱导结直肠癌细胞的增殖、迁移和干细胞样表型;SCIRT 调节与自我更新和细胞周期相关的基因转录,抑制乳腺癌 CSCs 的迁移;FGF13AS1 通过反馈环抑制乳腺癌细胞的糖酵解活性和干细胞样特性。

snoRNA 与 CSCs 的关系

越来越多证据表明 snoRNA 在癌症发展中具有重要作用,其突变和异常表达与癌症相关,可能成为癌症的生物标志物或潜在治疗靶点。在白血病中,C/D 盒 snoRNA 参与癌融合基因 AML1 - ETO 诱导的自我更新过程,敲低相关 snoRNA 可破坏白血病细胞的克隆形成能力,延缓白血病的发生;在肺癌 CSCs 中,SNORA3、SNORA43 和 SNORD78 等 snoRNA 上调,与患者生存率呈负相关,沉默 SNORA42 可抑制 CSCs 的自我更新和肿瘤形成能力;在卵巢 CSCs 中,SNORD89 高表达,与患者不良预后相关,敲除 SNORD89 可逆转其促进 CSCs 增殖、侵袭和迁移的作用;在结直肠癌中,SNORD1C 通过激活 Wnt 信号通路维持干细胞特性和对 5 - FU 的耐药性,敲低 SNORD1C 可抑制细胞增殖和迁移,促进细胞凋亡。

piRNA 与 CSCs 的关系

piRNA 是一类与 PIWI 蛋白相互作用的小非编码 RNA,在果蝇中首次被发现。人类有四种 PIWI 蛋白(PIWIL1 - 4),它们高度保守。piRNA 的表达变化与多种恶性肿瘤的发展和扩散相关。piR - 823 影响血液系统恶性肿瘤、胃癌、结直肠癌和食管鳞状细胞癌的发展;piR - 004800 通过调节 PI3K/AKT/mTOR 通路影响肿瘤细胞的增殖和存活;piR - Hep1 在肝癌中上调,激活 PI3K/AKT 通路;在乳腺癌 CSCs 中,piR - 823 过表达促进细胞增殖和干性基因表达,piR - 2158 过表达则抑制细胞增殖、迁移和侵袭,降低 CSC 标记物的表达;PIWIL2 的下调会导致细胞凋亡增加,抑制癌细胞的增殖和侵袭。

非编码 RNA 作为有前景的治疗靶点

ncRNA 的异常表达与癌症等多种疾病相关,癌症细胞与正常细胞的 miRNA 表达谱存在差异,且肿瘤中存在具有自我更新能力的 CSC 亚群。ncRNA 的异常表达与 CSC 的调控相关,使其成为 CSC 治疗的重要潜在靶点。针对 ncRNA 的治疗策略主要有两种:一是使用 miRNA 模拟物或表达载体恢复肿瘤抑制性 ncRNA 的功能,如 miR - 34a 模拟物可阻断细胞周期 G1 期,增强 caspase - 3 激活,抑制 bcl - 2、Notch 和 HMGA2,在胰腺癌中抑制癌细胞增殖和肿瘤球形成;二是使用锁定核酸(LNA antimiRs)、微小 LNA 抗 miR、antagomirs、miRNA 海绵和 siRNA 等方法阻断致癌 ncRNA 的活性,如 antagomiR - miR - 21 可下调 miR - 21 的表达,抑制肿瘤生长。然而,由于 lncRNA 的结构复杂,存在于细胞核中,更易降解,其作用机制也不太明确,因此将这些策略应用于 lncRNA 治疗比 miRNA 更具挑战性,但通过 RNA 干扰下调 lncRNA 功能是常用的方法。

使用非编码 RNA 作为癌症治疗面临的挑战

目前,使用 ncRNA 作为癌症治疗面临诸多挑战。其中关键问题是如何将寡核苷酸安全、有效地递送至恶性组织。未修饰的寡核苷酸易被免疫系统攻击,在循环中不稳定;而对其进行修饰虽可能提高靶向亲和力和稳定性,但需要额外的递送系统。选择递送系统时需要考虑多种因素,如对血清核酸酶的抗性、逃避先天免疫反应的能力、避免与血清蛋白和非靶细胞的非特异性相互作用、防止肾脏清除、从循环中释放进入靶组织、促进细胞摄取以及整合到 RNA 干扰或其他相关细胞机制中。近年来研究发现,miRNA 可包裹在多囊泡体中,以细胞外囊泡(外泌体)的形式释放到细胞外环境,外泌体在靶向结直肠癌 CSCs 方面展现出潜力,但仍需深入研究其在不同癌症中的功能。此外,ncRNA 治疗还存在脱靶问题,miRNA 能靶向多个 mRNA,模型系统中的靶点在临床应用中可能并不适用;lncRNA 由于机制不明且组织特异性强,面临的挑战更大。

结论

越来越多证据表明,具有自我更新和分化能力的 CSCs 在癌症的发生、发展和转移中起着关键作用。近期研究发现,ncRNA 通过作为癌症促进剂或抑制剂调节 CSC 的进展。本综述详细讨论了 CSCs 与不同类型 ncRNA 之间的关系,以及将 ncRNA 作为癌症潜在靶向治疗的优缺点。然而,该领域仍有许多调节机制有待揭示,需要进一步深入研究,以更好地理解 ncRNA 在癌症治疗中的作用,为癌症治疗开辟新的道路。

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