多组学及分子对接揭示十溴二苯醚(BDE-209)致人类神经毒性机制

《Neurotoxicity Research》:Mechanistic Analysis of Decabromodiphenyl Ether-Induced Neurotoxicity in Humans Using Network Toxicology and Molecular Docking

【字体: 时间:2025年03月25日 来源:Neurotoxicity Research 2.9

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  为探究 BDE-209 神经毒性机制,研究人员开展网络毒理学及分子对接研究,发现其或抑制 GluN2B 致神经毒性。

  《十溴二苯醚(BDE-209)致人类神经毒性机制的深入探究》
在现代生活中,各种化学物质广泛应用,其中十溴二苯醚(BDE-209)作为一种常用的添加型阻燃剂,大量存在于纺织品、塑料等产品里。然而,这种物质却隐藏着巨大的危害。它被认定为持久性有机污染物,能在环境中远距离传输,不仅对野生动物产生不良影响,如导致斑马鱼后代神经行为改变、两栖动物发育迟缓、鱼类甲状腺功能紊乱等,还严重威胁人类健康,与内分泌失调、生殖发育问题以及神经毒性紧密相关。尽管已有研究表明 BDE-209 可能对人类具有神经毒性,但具体的作用机制却一直模糊不清。为了揭开这一谜团,来自土耳其凡于斯屈达尔大学(Van Yuzuncu Yil University)的研究人员 Fuat Karaku?和 Burak Kuzu 开展了一项极具意义的研究,相关成果发表在《Neurotoxicity Research》上。

研究人员运用了多种先进的技术方法来深入探究 BDE-209 致神经毒性的机制。在研究过程中,他们利用网络毒理学、多层次生物信息学方法以及分子对接分析等手段。首先从多个数据库获取 BDE-209 潜在靶点和神经毒性相关靶点信息,通过构建靶点网络筛选出关键靶点,接着运用基因 - 基因相互作用分析、通路富集分析等挖掘潜在机制,最后通过分子对接评估 BDE-209 与关键靶点的结合亲和力。

研究结果主要体现在以下几个方面:

  1. BDE-209 的神经毒性预测:通过计算模型预测,BDE-209 具有较高的穿越血脑屏障(BBB)的可能性,能够渗透进入中枢神经系统(CNS),进而引发神经毒性,其神经毒性概率高达 0.94,BBB 穿透分类为 +++,表明穿越 BBB 的概率在 0.9 - 1.0 之间,同时根据 Deep-PK 结果计算的 logPS 值为 -0.38,暗示其对 CNS 具有潜在的渗透性。
  2. 确定潜在靶点:研究人员整合多个数据库的数据,共筛选出 2756 个神经毒性靶点和 7534 个与神经毒性相关的差异表达基因(DEGs),通过维恩图分析,发现其中 1290 个重叠靶点与人类神经毒性潜在相关。同时,从相关数据库中挖掘出 3050 个与 BDE-209 相关的靶点,再次通过维恩图确定了 294 个可能与 BDE-209 诱导的人类神经毒性相关的潜在靶点。
  3. 基因 - 基因相互作用和通路富集分析:对 294 个潜在靶点进行基因 - 基因相互作用分析,发现这些基因主要与细胞对化学应激的反应相关,其中共表达(42.43%)和物理相互作用(38.69%)占主导。通路富集分析表明,这些靶点与 “化学突触传递”“神经系统” 以及 N - 甲基 - D - 天冬氨酸(NMDA)受体相关通路显著关联。
  4. 构建 PPI 网络并确定关键靶点:将 294 个潜在靶点映射到 PPI 网络中,通过 MCODE 算法以及其他多种算法分析,确定了 14 个与 BDE-209 诱导的神经毒性密切相关的枢纽靶点,进一步分析得到 4 个关键靶点,分别为 CaMK-IIα(钙 / 钙调蛋白依赖性蛋白激酶 IIα)、PSD-95(盘状大同源物 4)、GluR-1(谷氨酸受体 1)和 GluN2B(谷氨酸受体离子型,NMDA 2B)。这些关键靶点主要参与 NMDA 受体的解锁、谷氨酸结合和激活过程。
  5. 分子对接结果:分子对接分析显示,BDE-209 与 PSD-95 和 GluR-1 具有中等结合亲和力,与 GluN2B 的结合亲和力相对较高,结合能为 -8.99 kcal/mol ,均方根偏差(RMSD)为 0.42 ? ,表明结合构象可靠。与 NMDA 受体选择性抑制剂艾芬地尔(Ifenprodil)相比,BDE-209 对 GluN2B 的抑制作用与之相近。

综合研究结果和讨论部分可知,该研究明确了 BDE-209 具有神经毒性,其可能通过抑制 GluN2B,降低含 GluN2B 的 NMDA 受体的激活,进而阻碍兴奋性神经传递,破坏突触的增强和可塑性,最终导致神经毒性。这一研究成果意义重大,不仅为深入理解 BDE-209 的神经毒性机制提供了关键线索,也为评估其对人类健康的风险提供了重要依据,有助于制定更为合理的安全指南,对保护人类健康具有重要的指导作用。然而,研究中采用的计算机模拟方法存在一定局限性,如深度学习框架对新型化学实体性质预测可能不准确,BBB 通透性预测未考虑主动转运机制,靶点预测资源存在准确性问题等。未来的研究需要结合实验验证,特别是针对 BDE-209 和 GluN2B 的实验,以进一步确认这些计算预测结果,完善对 BDE-209 神经毒性机制的认识。

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