Identification and functional characterization of key biomarkers in diffuse large B-cell lymphoma: emphasis on STYX as a prognostic marker and therapeutic target

《Hereditas》：Identification and functional characterization of key biomarkers in diffuse large B-cell lymphoma: emphasis on STYX as a prognostic marker and therapeutic target

为解决弥漫大 B 细胞淋巴瘤（DLBC）分子机制不明、缺乏有效生物标志物的问题，研究人员开展 DLBC 关键生物标志物的识别与功能研究，发现 SP3 等 5 个基因有潜在价值，STYX 可作预后标志物和治疗靶点，为 DLBC 诊疗提供新方向。

　　

弥漫大 B 细胞淋巴瘤研究：新生物标志物与治疗靶点的探索

在血液肿瘤的世界里，弥漫大 B 细胞淋巴瘤（Diffuse large B-cell lymphoma，DLBC）是一种常见且棘手的疾病。它是最常见的非霍奇金淋巴瘤（Non-Hodgkin lymphoma，NHL）亚型，约占所有 NHL 病例的 30 - 40%。DLBC 具有侵袭性强、临床异质性大的特点，即便采用标准的免疫化疗方案 R-CHOP（利妥昔单抗、环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和泼尼松）治疗，仍有高达 40% 的患者会复发或出现难治性疾病。这让医生们在面对 DLBC 患者时，常常面临治疗困境，因为目前对 DLBC 的分子机制了解并不完全，缺乏可靠的生物标志物来帮助进行精准的风险分层、预后判断和治疗决策。

为了攻克这些难题，来自天津科技大学、沙特国王大学、新疆医科大学第一附属医院等机构的研究人员展开了深入研究，相关成果发表在《Hereditas》杂志上。

研究人员采用了多种技术方法来探索 DLBC 的奥秘。他们从公共数据库（如 Gene Expression Omnibus，GEO）获取 DLBC 和正常组织的基因表达谱数据，利用 R 包 DESeq 等工具筛选差异表达基因（Differentially expressed genes，DEGs） 。通过 Venn 图分析找出不同数据集间的共同 DEGs，再借助 GEPIA2 数据库、cBioPortal 数据库、GSCA 平台等进行基因表达验证、突变分析、甲基化分析、生存分析、免疫浸润分析和药物敏感性分析。在细胞实验方面，培养了多种 DLBC 细胞系和正常 B 淋巴细胞细胞系，运用定量实时荧光定量 PCR（Quantitative real-time PCR，RT-qPCR）技术检测基因和 miRNA 表达，还进行了 STYX 基因敲低实验以及细胞增殖、集落形成和伤口愈合等功能实验。

在研究结果部分，首先是重叠 DEGs 的识别。基于严格的筛选标准，研究人员从 GSE32018 和 GSE56315 数据集分别鉴定出 500 个 DEGs，经 Venn 图分析发现 5 个重叠 DEGs，分别是 SP3、CSNK1A1、STYX、SIRT5 和 MGEA5，其中前 4 个基因在 DLBC 样本中上调，MGEA5 下调。

接着是对 DEGs 的多方面分析。利用 GEPIA2 数据库验证发现，这些基因在 DLBC 样本和正常组织中的表达趋势与之前一致，且在 DLBC 不同阶段表达相对稳定，提示可作为稳定的生物标志物。突变分析表明，仅 CSNK1A1 存在 2.7% 的突变频率，为错义突变，不过该突变对患者生存结局无显著影响。甲基化分析显示，DEGs 的启动子甲基化水平与 mRNA 表达呈负相关，但甲基化水平对患者生存无显著影响。而生存分析发现，高 STYX 表达与 DLBC 患者较差的总生存期显著相关，意味着 STYX 可能是有价值的预后生物标志物。

在细胞系实验中，RT-qPCR 结果证实了 DLBC 细胞系中相关 DEGs 的表达变化，并且通过 ROC 曲线分析发现，SP3、CSNK1A1、STYX 和 SIRT5 具有较高的诊断潜力，MGEA5 诊断效能相对较弱。免疫细胞和药物敏感性相关性分析表明，SP3 与多种免疫细胞浸润正相关，CSNK1A1 与 NK T 细胞等负相关，且二者都与药物敏感性相关，提示它们在调节肿瘤免疫和治疗反应中起重要作用，STYX 等基因也与部分药物敏感性存在关联。此外，研究人员还鉴定出 9 种与 DEGs 相关的 miRNA，且它们在 DLBC 细胞系中均上调。基因富集分析显示，DEGs 参与了内吞作用、代谢、突触功能等关键生物过程和信号通路。

STYX 基因敲低和功能实验进一步揭示了 STYX 的重要作用。敲低 STYX 基因后，U2932 细胞的增殖、集落形成能力显著下降，而伤口愈合能力增强，表明 STYX 在维持 DLBC 细胞的增殖、克隆形成和迁移能力中发挥关键作用。

综合来看，该研究全面分析了 DLBC 中 5 个重要的 DEGs，验证了它们在多个队列中的表达情况，凸显了其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。尽管研究存在一定局限性，如依赖公共数据集、缺乏自有队列验证和体内实验模型等，但这些发现仍为 DLBC 的诊疗提供了新的思路和方向。未来，若能在更大规模的临床样本和体内模型中进一步验证，有望为 DLBC 患者带来更精准有效的治疗策略，改善患者的预后和生活质量。