印度北部查谟地区水稻鞘腐病菌多样性研究：对病害防控及育种的关键意义

为解决印度查谟地区水稻鞘腐病菌种群遗传和致病变异性信息匮乏问题，研究人员评估其形态、致病和遗传多样性，发现病菌遗传结构特征及抗性水稻基因型，为病害防控和育种提供依据。

　　水稻鞘腐病（由 Sarocladium oryzae_引起）对水稻种植构成重大威胁，可能导致严重的产量损失。尽管该病菌在田间表现出高度变异性，但印度北部查谟地区关于其种群遗传和致病变异性的信息却十分有限，这阻碍了有效病害管理方法的开发。在本研究中，研究人员对从不同且具有流行病学意义的水稻种植区域收集的 Sarocladium oryzae 进行了形态学、致病性和遗传多样性评估。研究人员依据菌落形态、微观特征和致病变异性对 Sarocladium oryzae 分离株进行分类。为深入了解遗传变异性和种群结构，研究人员使用简单序列重复区间扩增多态性（ISSR）标记对 Sarocladium oryzae 分离株进行分析，结果显示产生了 78 个多态性位点，平均多态性率为 82.97%，多态信息含量（PIC）值在 0.13 至 0.36 之间。贝叶斯聚类分析（BCA）推断出两个主要遗传群体，即查谟地区的一个群体，以及卡图阿、拉乔里和乌德汉布尔地区的另一个群体。主成分判别分析（DAPC）、分子方差分析（AMOVA）和非加权组平均法（UPGMA）系统发育分析结果与 BCA 一致，均支持将其细分为两个亚群体。AMOVA 表明，在 P≤0.01% 的水平下，群体内的遗传变异较高（79%），群体间的遗传变异较低（21%）。Nei's 基因多样性和香农信息指数在查谟群体中最高（分别为 0.288 和 0.43），其次是乌德汉布尔群体（分别为 0.244 和 0.24），而拉乔里群体的多样性最低（分别为 0.149 和 0.23），群体间的平均遗传多样性（H_t）和基因流分别为 0.318 和 1.394。此外，SJR 5、Pusa 44 和 PR 118 这三种水稻基因型对测试分离株具有抗性，可作为有效的供体应用于水稻育种计划，以培育高产且抗病的水稻品种。本研究有助于了解查谟水稻种植地区鞘腐病菌的形态学和遗传多样性，为未来研究和育种策略提供了宝贵的见解，有助于减轻高毒力分离株的影响。