解析对虾白斑综合征病毒（WSSV）感染机制：探寻对虾养殖病害防控新路径

《Molecular Genetics and Genomics》：Computational insights into host–pathogen protein interactions: unveiling penaeid shrimp and white spot syndrome virus interplay

为解决对虾白斑综合征病毒（WSSV）防控难题，研究人员开展宿主 - 病原体互作研究，揭示互作机制，为防控研究奠基。

　　白斑综合征病毒（White spot syndrome virus，WSSV）一直是对虾养殖系统中的重大威胁，尤其是对 penaeid 虾类。由于缺乏针对 WSSV 的有效控制措施，这种疾病给水产养殖业带来了严重威胁。本研究旨在通过计算机模拟方法（in silico approach）研究宿主 - 病原体互作（host–pathogen interactions，HPI），探索 WSSV 的感染机制及其对虾类的影响，从而深入了解感染和疾病进展过程。该研究聚焦于南美白对虾（Penaeus vannamei）、中国对虾（Penaeus chinensis）、斑节对虾（Penaeus monodon）、日本对虾（Penaeus japonicus）和印度对虾（Penaeus indicus）这五种对虾，研究它们与 WSSV 的相互作用。研究人员采用基于直系同源性（orthology-based ）和结构域驱动（domain-driven）的分析方法，揭示宿主与病原体之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用（protein–protein interactions，PPIs）。结果发现，这些联合策略能有效检测发病机制中的共同分子机制，揭示对病毒毒力和宿主反应至关重要的复杂 PPI 网络。WSSV 中大多数相互作用蛋白是参与 DNA 复制和增殖的即刻早期蛋白，对泛素化、转录调控和核苷酸代谢至关重要。不同种类的对虾中有大量宿主蛋白与 WSSV 相互作用（2360 - 11704 个相互作用），其中中国对虾（11704 个）和日本对虾（11458 个）的相互作用数量最多，这表明它们可能更易感染或对病毒的反应更强。宿主枢纽蛋白在信号传导、细胞过程和代谢中起着关键作用，它们在细胞质、细胞核和细胞膜间相互作用，凸显了其在 WSSV 发病机制中的重要性。这项研究为宿主 - 病原体互作提供了重要见解，为未来旨在改善对虾养殖中 WSSV 防控的研究奠定了基础。