伊朗 2020 - 2023 年鲤疱疹病毒 3 型基因型的分子特征与系统发育分析：揭示西亚地区病毒多样性

为防控鲤疱疹病毒 3 型（CyHV - 3），伊朗研究人员分析其基因型，发现多种变异，助力了解病毒分布。

　　在全球水产养殖蓬勃发展的当下，鲤鱼作为重要的养殖鱼类，为人们提供了丰富的蛋白质来源。然而，一种名为鲤疱疹病毒 3 型（CyHV - 3）的病毒却成为了鲤鱼养殖产业的巨大威胁。CyHV - 3 引发的锦鲤疱疹病毒病（KHVD）具有高传染性，能导致鲤鱼和锦鲤大量死亡，给养殖户带来惨重的经济损失。自 1996 年在英国被首次检测到后，它迅速在全球蔓延，已在至少 40 个国家出现，严重影响了全球水产养殖的可持续发展。

在伊朗，鲤鱼养殖占据着重要地位，是当地暖水鱼养殖的主要品种。但由于缺乏完善的卫生基础设施和疾病防控措施，CyHV - 3 的威胁更为严峻。为了深入了解 CyHV - 3 在伊朗的流行情况，来自伊朗德黑兰大学、沙希德?查姆兰大学等机构的研究人员开展了一项研究，相关成果发表在《Scientific Reports》上。

研究人员采用了多种关键技术方法。在样本采集方面，从伊朗胡齐斯坦省、吉兰省和马赞达兰省的 342 个疑似患病鲤鱼养殖场，采集了锦鲤（Koi cyprinus carpio）、普通鲤鱼（cyprinus carpio）等多种鱼类的样本。检测环节，利用 PCR 技术对采集的组织样本进行 CyHV - 3 检测，通过扩增胸苷激酶基因（TK）和聚合酶基因等特定基因片段，判断样本是否感染病毒。对于基因型分析，运用 PCR 扩增特定基因区域，结合测序技术确定病毒基因型，并使用 MEGA7 软件构建系统发育树，探究病毒之间的进化关系。同时，对鳃组织进行组织病理学研究，观察病毒感染后的病理变化。

研究结果如下：

• 病毒感染情况：对 342 个养殖场的分子检测显示，85 个养殖场感染了 KHV。其中，吉兰省和马赞达兰省的感染率较高，分别为 84.70% 和 15.29%。在不同月份中，4 - 5 月吉兰省、5 - 6 月马赞达兰省的感染率较高，8 月、1 月和 2 月未检测到感染。此外，部分养殖场还同时感染了鲤鱼水肿病毒（CEV）。
• 基因型分析：基于 TK 基因和 Sph I - 5 基因的分析，鉴定出亚洲 1 型（A1）和亚洲 2 型（A2）两种基因型。其中，A1 基因型存在于部分样本中，其 SphI 基因和 TK 基因具有特定的序列特征，如 SphI 基因在 209 位为 C 核苷酸，588 - 586 位缺失 AAC 基序等；A2 基因型也有相应的特征序列。基于标记 I 和标记 II 的分析，发现了 J 株（I++II+）、中间株（I++II?）和一种新基因型（I++II??）。新基因型在标记 II 上有 5 - bp 的缺失，这是首次发现的该标记区域的新变异。
• 系统发育分析：通过对 TK 基因构建系统发育树，发现伊朗的病毒株与亚洲和欧洲已报道的菌株聚类在一起，表明它们在进化上的相关性。部分伊朗菌株与欧洲菌株有共同祖先，而部分菌株处于亚洲和欧洲菌株之间的中间位置，还有个别菌株与其他菌株距离较远。
• 组织病理学分析：对感染 KHV 的鲤鱼鳃组织进行组织病理学检查，发现鳃丝次级鳃小片融合、鳃丝 clubbing，存在大量坏死的呼吸上皮细胞，以及轻度增生性和淋巴细胞浆细胞性鳃炎，还观察到核内包涵体和核膜边缘化染色质。

研究结论和讨论部分指出，全球 CyHV - 3 基因型的分布尚未完全明确。此次研究表明，CyHV - 3 在伊朗所在的西亚地区呈现出高度的多样性，至少有三种不同的菌株（I++II+、I++II?和I++II??）在传播。由于观赏鱼贸易的增加，未来可能会出现更多的变异株。因此，持续的监测、严格的生物安全和检疫措施对于控制这种具有重要经济影响的病原体的传播至关重要。该研究数据有助于深入了解 CyHV - 3 基因型在西亚 - 东亚地区的地理分布，为防控 CyHV - 3 提供了重要的理论依据和数据支持。