DARLIN 小鼠模型：开启体内细胞谱系追踪研究新大门

《Nature Protocols》：DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity

研究人员开发 DARLIN 小鼠模型解决现有谱系追踪模型问题，可高效进行体内谱系追踪。

　　细胞谱系追踪是研究组织发育和体内平衡过程中细胞历史及细胞动态变化的有力工具。一种越来越受欢迎的谱系追踪方法是在特定基因组位点产生高频突变，这些突变可作为遗传条形码来标记不同的细胞谱系。然而，目前的谱系追踪小鼠模型存在条形码多样性低和单细胞谱系覆盖有限的问题。最近，研究人员开发出 DARLIN 小鼠模型，通过在特定基因组位点整合三个条形码阵列，并结合 Cas9 和末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）来提高每个条形码阵列的编辑多样性。据估计，DARLIN 理论上可产生 10¹⁸种不同的谱系条形码，并且在单细胞检测中能够在超过 70% 的细胞中恢复谱系条形码。此外，DARLIN 可通过强力霉素诱导，在特定阶段在不同组织中产生稳定的谱系条形码。在此，研究人员提供了应用 DARLIN 系统进行体内谱系追踪的详细步骤，包括条形码诱导、诱导效率评估、通过批量和单细胞测序进行条形码分析以及计算分析。该实验方案的执行时间约为 1 周用于实验数据收集，约 1 天用于运行计算分析流程。执行该方案的人员应熟悉测序文库构建和 Linux 操作系统。DARLIN 为在生理环境下研究不同组织间的谱系关系及潜在分子调控机制打开了大门。