儿童急性下呼吸道感染新突破：咽拭子靶向二代测序助力精准诊断

为评估 tNGS 在儿童急性下呼吸道感染（ALRTIs）病原体检测中的作用，研究发现其比传统方法更具优势，意义重大。

　　在儿童的健康世界里，急性下呼吸道感染（ALRTIs）就像一个隐藏的 “小怪兽”，给孩子们带来了不少麻烦。它不仅是导致儿童住院和死亡的重要原因，而且发病率高。传统的诊断方法，像细菌培养、抗原检测、抗体测定和核酸测试等，都存在一些不足。细菌培养虽然被视为 “黄金标准”，但耗时很长，还经常检测不出那些挑剔（生长条件苛刻）或生长缓慢的微生物；抗原和抗体检测方法虽然速度快些，可敏感性和特异性比较低，容易出现假阴性或假阳性的情况；核酸测试虽然敏感性高一点，却没办法同时检测多种病原体。而且，获取下呼吸道样本，比如支气管肺泡灌洗液（BALF），需要进行侵入性操作，这对孩子们来说有一定风险，在儿科临床应用中并不总是可行。所以，迫切需要一种更高效、准确又无创的诊断方法。

为了解决这些问题，福建医科大学附属福建省儿童医院（上海儿童医学中心福建分院）的研究人员 Di Lian、Chenye Lin 等人开展了一项关于 “咽拭子靶向二代测序（tNGS）在儿科急性下呼吸道感染临床诊断价值” 的研究，该研究成果发表在《BMC Pediatrics》上。

研究人员采用了多种关键技术方法。首先，他们收集样本，从 132 名因 ALRTIs 住院的儿童身上采集咽拭子和 BALF 样本。然后，利用 tNGS 技术对样本进行病原体检测，这种技术可以同时识别 153 种病原体，涵盖细菌、病毒、真菌和非典型病原体。同时，还采用传统检测方法，像痰培养、呼吸道病毒抗原检测、衣原体和支原体抗体检测以及尿肺炎球菌抗原检测等，与 tNGS 进行对比。最后，运用 SPSS v.23.0 软件对数据进行分析，评估 tNGS 的诊断准确性。

研究结果如下：

1. 患者特征：研究共纳入 132 名儿童，其中男性 79 名（60%），女性 53 名（40%），中位年龄 38 个月。92 名（70%）儿童有发热症状，128 名（97%）有咳嗽症状，40 名（30%）有喘息症状。大部分儿童（67%）症状持续超过 3 天。实验室检查显示，52 名（39%）儿童 C 反应蛋白（CRP）水平大于 20mg/L，56 名（42%）儿童白细胞计数（WBC）高于 10×10⁹/L，42 名（32%）儿童降钙素原（PCT）水平高于 0.5ng/mL。
2. tNGS 与传统检测方法的比较：tNGS 在 BALF 样本中检测到细菌、病毒和非典型病原体的比例分别为 89.5%（n=68）、98.2%（n=108）和 77.8%（n=63）。与传统方法相比，tNGS 对细菌和病毒的检测率显著更高（P<0.001），但在检测非典型病原体方面，二者没有统计学差异（P=0.59）。
3. 抗生素使用对 tNGS 细菌检测的影响：研究发现，使用抗生素对 tNGS 检测细菌的影响不显著（P=0.237）。在使用抗生素的 62 个样本中，60 个（96.77%）检测到细菌病原体；未使用抗生素的 6 个样本全部检测到细菌病原体。
4. 咽拭子和 BALF 病原体检测一致性分析：以 BALF 病原体检测结果为 “金标准”，咽拭子 tNGS 检测细菌、病毒和非典型病原体的敏感性分别为 95.83%、88.16% 和 92.06%，特异性分别为 55.95%、83.93% 和 100%。
5. 经济成本和侵入性分析：咽拭子采样成本明显低于 BALF 采样，且采样复杂程度、疼痛评分和并发症发生率都显著更低（P<0.05）。

研究结论和讨论部分指出，tNGS 在检测细菌和病毒病原体方面，比传统方法具有更高的检测率。咽拭子 tNGS 检测结果与 BALF 样本具有良好的一致性，而且咽拭子采样成本更低、侵入性更小、患者不适感减轻，是一种很有前景的诊断工具。不过，该研究也存在一些局限性，比如样本量相对较小，研究为单中心且时间较短，没有与目前很多临床应用中的呼吸道病毒和细菌多重聚合酶链反应（PCR）进行比较等。尽管如此，这项研究仍然为儿童 ALRTIs 的诊断提供了新的思路和方法，有望推动儿科临床诊断的发展，帮助医生更准确地判断病情，为孩子们制定更有效的治疗方案，减少不必要的医疗资源浪费，让孩子们能够更快地恢复健康。未来还需要更大规模、多中心的研究，并与多重 PCR 方法进行对比，进一步验证 tNGS 的有效性和适用性。