新发现！二斑叶螨中新型 α nudivirus 的基因组与系统发育特征

研究人员通过 RNA-seq 在二斑叶螨中发现新型 TuNV，其基因组和系统发育特征有助于理解 nudivirus 的多样性与进化。

　　Nudiviruses（Nudiviridae 科）是一类多样的有包膜、杆状病毒，具有双链 DNA 基因组，能感染多种昆虫和甲壳类动物。它们在农业生物防治以及水产养殖和昆虫饲养的疾病方面都具有重要意义。在这项研究中，研究人员从二斑叶螨（Tetranychus urticae Koch，蜱螨亚纲：叶螨科）的 RNA 测序（RNA-seq）数据中发现了一种新型且差异显著的 nudivirus 的四个片段。该病毒的序列仅在部分螨转录组中被检测到。组装后的片段总长度为 100780bp，包含 122 个注释的开放阅读框（ORF），其中包括所有 28 个保守的 nudivirus 核心基因。基于 17 个选定的 nudivirus 核心基因预测氨基酸序列进行的系统发育分析表明，该病毒属于 Alphanudivirus 属，位于一个包含从跳蚤转录组中鉴定出的 nudivirus 的进化枝中。通过对片段特异性连接的核心基因比对进行系统发育分析，进一步证实了这一分类地位。实际上，该病毒被命名为二斑叶螨 α nudivirus（TuNV）。转录谱分析显示，基因组片段和病毒基因之间的转录活性水平存在差异。在所有片段的 nudivirus 基因中，穿插着节肢动物基因的同源物以及几个独特的基因。这种基因组和系统发育特征的研究增强了人们对节肢动物宿主中 nudivirus 多样性和进化的理解。