人类活动梯度下中食肉动物犬瘟热病毒的系统发育结构与感染生态相关性研究

《Microbiology Spectrum 3.7》：Canine distemper virus phylogenetic structure and ecological correlates of infection in mesocarnivores across anthropogenic land use gradients

本研究通过分析2019-2022年美国东南部13州270例中食肉动物（浣熊、赤狐、灰狐、臭鼬）尸检样本，揭示犬瘟热病毒（CDV）感染率高达58.5%，并首次建立包含地表不透水性（imperviousness）、降水量和海拔的广义线性模型（GLM）。研究发现CDV毒株在密西西比河东西两岸呈现显著地理分化，城市开发区域感染风险提升2.8倍（P<0.01），为野生动物疾病监测提供了重要靶向区域。该成果发表于《Microbiology Spectrum》，对理解人兽共患病（zoonosis）在城市化进程中的传播规律具有里程碑意义。

　　

ABSTRACT
研究聚焦人类活动对野生动物-家养动物-人类界面传染病的影响，通过分析270例中食肉动物尸检样本，发现58.5%的个体感染犬瘟热病毒（CDV）。Ripley's K空间分析显示阳性病例呈现显著聚集性（P<0.01）。广义线性模型（GLM）揭示地表不透水性（β=0.1588，P=0.0047）、降水量（β=0.0098，P=0.0004）与感染风险呈正相关，而海拔（β=-0.2851，P=0.0004）呈负相关。

INTRODUCTION
人类活动通过改变宿主密度（host density）和行为（如种间接触）显著影响疾病传播。CDV作为副黏病毒科（Paramyxoviridae）麻疹病毒属（Morbillivirus）成员，可感染40余种食肉动物。研究特别关注浣熊（Procyon lotor）等城市适应种（synanthropic species）在城市化梯度（urbanization gradient）中的传播作用。

MATERIALS AND METHODS
样本来自东南野生动物疾病合作研究组（SCWDS），通过组织病理学、直接荧光抗体（DFA）和免疫组化（IHC）确诊CDV。采用R 4.2.0进行空间分析和GLM建模，AIC准则筛选最优模型。对32例阳性样本进行H基因（~1200bp）测序，IQtree构建系统发育树（GTR+F+G4模型）。

RESULTS

1. 空间分布：阳性病例在13州呈聚集性，浣熊占比最高（182/270）。空间自相关分析显示病例在<50km尺度显著聚集（K-function P<0.05）。
2. 风险模型：成年个体感染风险是幼体的1.7倍（OR=1.72）。城市区域（不透水面>30%）感染概率达68%，显著高于乡村（32%）。
3. 遗传进化：32个毒株分为东西两大支系，仅2个东部样本（GA/NC）与西部毒株聚类。密西西比河西岸毒株具有64.6%的bootstrap支持率。

DISCUSSION

1. 城市化效应：城市资源聚集导致浣熊密度达5.44只/km²（乡村2.24只/km²），促进CDV传播。
2. 气候影响：降水量每增加100mm，感染风险上升15%（95%CI:9-21%），可能与气溶胶传播（aerosol transmission）增强有关。
3. 物种差异：灰狐感染率最高（OR=3.21），推测与其灌木栖息偏好（shrub cover utilization）相关。
4. 地理屏障：密西西比河使东西部毒株遗传分化（F_ST=0.32），但存在跨河传播案例，提示野生动物/宠物运输可能打破地理隔离。

研究创新性提出"城市热岛-疾病热点"耦合模型，为野生动物疫病早期预警提供理论依据。未来需结合GPS追踪和群体基因组学（population genomics）深入解析CDV传播动力学。