微塑料促进大肠杆菌耐药性发展:机制、影响与防控新挑战

《Applied and Environmental Microbiology》:Effects of microplastic concentration, composition, and size on Escherichia coli biofilm-associated antimicrobial resistance

【字体: 时间:2025年03月21日 来源:Applied and Environmental Microbiology 3.9

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  该研究揭示微塑料(MPs)对大肠杆菌耐药性的影响,为应对 AMR 危机提供关键依据。

  

引言

全球塑料的广泛使用与不当处置,已成为环境和公共卫生领域的重大难题。自 1964 年起,塑料使用量增长了 20 倍,预计到 2060 年,全球未妥善管理的垃圾将达到每年 155 - 265 兆吨。在此背景下,微塑料(MPs)的检出率显著上升。MPs 是指尺寸在微米到毫米范围的难溶性合成颗粒或聚合物基质,形状规则或不规则,主要来源于化妆品、药品中的聚乙烯(PE)、聚丙烯(PP)和聚苯乙烯(PS)等,同时现有塑料的降解也会产生二次 MPs。因其来源多样,表面化学性质不同,MPs 在环境中呈现出多种形状和尺寸,如颗粒、纤维和碎片等,且极难控制。
MPs 已广泛渗透到地球的各类生态系统中,从海底峡谷到珠穆朗玛峰顶峰都有它们的踪迹。废水更是成为 MPs 和其他人为废弃物的重要储存库,MPs 凭借其微小尺寸、浮力和疏水性,能够在废水处理过程中存活并扩散到周围环境,在水生环境的沉积物和地表水中积累,进而与周围生物相互作用,对人类健康产生潜在影响。
与此同时,全球范围内细菌对抗生素的耐药性(AMR)问题日益严重。AMR 的产生受到多种因素影响,包括抗生素的过度使用与滥用、卫生条件差以及废水中抗生素残留造成的环境污染等。近年来研究发现,MPs 可能在 AMR 发展中发挥重要作用,它能够通过生物膜形成,容纳微生物群落、化学污染物以及含有抗菌耐药基因(ARGs)的遗传物质,ARGs 可在细菌群落中通过水平基因转移传递给致病菌。然而,目前对于 MPs 的性质(组成、大小、浓度等)如何影响 AMR 发展,以及它们与不同抗生素之间的相互作用,了解还十分有限。
在感染率高且塑料废弃物多的地区,如资源匮乏地区,理解 AMR 与 MPs 之间的相互作用尤为关键。这些地区传染病治疗困难,加上废水处理不足,可能导致 MPs 浓度升高,进而使弱势群体中 AMR 病例增加。因此,深入探究 MPs 与 AMR 发展的基本相互作用迫在眉睫。本研究旨在探讨不同 MPs 特征,包括浓度、表面组成、大小和表面积,对大肠杆菌(Escherichia coli)体外对氨苄青霉素、环丙沙星、强力霉素和链霉素耐药性发展的影响。这些抗生素属于广谱抗生素,代表不同类别,且常见于废水系统。研究重点考察 MPs 各特征对细菌生长、抗生素特异性 AMR 以及多药耐药性(MDR)的影响,并探究 AMR 发展差异背后的潜在机制,尤其是生物膜形成机制。研究结果有助于理解废水监测数据,为废物管理和疾病负担研究提供重要参考。

材料与方法

  1. 菌株和培养条件:实验选用E. coli MG1655(ATCC 700926)。所有液体培养均在溶原肉汤(Miller,LB)培养基中,于 180 rpm、37°C 振荡培养。实验开始前,先将 MPs 加入培养基中 48 h,使生物膜充分附着并成熟,之后再添加亚抑制水平的氨苄青霉素、环丙沙星、强力霉素和链霉素。
  2. 生长曲线数据:将野生型(WT)E. coli MG1655 在含有不同浓度(100、500、1,000、2,000、4,000、5,000、10,000 和 15,000 个塑料 /μL)10 μm 直径 PS 球体的 LB 培养基中培养,分别在 0、1 和 24 h 取样。样品一式三份接种在 LB 琼脂平板上,测定不同时间点的菌落形成单位(CFU/mL)。为补偿附着在 MP 表面的细胞,在涡旋前后分别进行平板接种,培养 24 h 后计数 CFU。
  3. 抗生素和 MP 敏感性测试:为确定细菌的初始基线最低抑菌浓度(MIC),先将细胞在含有微粒(MPs 或玻璃)的无药培养基中振荡培养,直至通过共聚焦显微镜观察到大量生物膜生长(约 48 h)。同时设置未添加 MPs 的细胞作为对照。将微粒涡旋 1 min 并离心,使表面生物膜释放,此时培养液中同时含有生物膜和浮游细胞。采用肉汤微量稀释法在 96 孔板中测定 MIC,具体操作是将含有抗生素的培养基 100 μL 进行两倍稀释至下一列,再取 10 μL 样品细胞加入各孔,在 37°C 静态培养箱中培养 24 h,随后用分光光度计在 600 nm 处测定光密度,并与阴性对照(LB)比较。在传代实验中,每 24 h 测量一次 MIC。
  4. MP - 抗生素传代实验:为测试长期暴露于 MPs 对耐药性的影响,设置不同处理组,分别在含有 MPs、抗生素、MPs 和抗生素的培养基中传代细胞,同时设置仅含培养基的对照组。对于对照组和仅含抗生素组,在初始 48 h 生长后,将饱和液体培养物(达到生长极限的培养物)每天以 1:100 的比例稀释到新鲜的含抗生素或不含抗生素的培养基中,标记为传代实验的第 0 天。抗生素添加量为第 0 天测量的初始 MIC 的 40%,处于亚抑制水平。对于含有 MPs 的实验组,在第 0 天计算 MIC 时包含生物膜细胞。在 MPs 实验组中,每次 24 h 暴露后,涡旋样品使部分生物膜细胞释放到上清液中,然后将 MPs 离心(若为 10 μm)或静置(5 - 10 min)使 MPs 沉淀,取上清液(保留 40 μL 用于传代和 MIC 测定),再向含有剩余生物膜的 MPs 的同一培养管中加入 4 mL 新鲜培养基和 40 μL 上清液,整个实验过程中生物膜和浮游细胞始终在同一 MPs 上进行传代。所有组每 2 天进行一次抗生素敏感性测试。
  5. 生物膜和浮游细胞特异性敏感性测试:为测定仅浮游细胞或仅生物膜细胞(附着在 MP 表面的细胞)的 MIC 变化,对上述连续传代实验进行改进。将 WT 细胞与 40 个 MP/mL(500 μm 直径 PS 球体)在 37°C 振荡培养 48 h,去除未附着细胞的上清液,其 MIC 作为 “浮游细胞” 的基线 MIC。向剩余 MPs 中加入新鲜无细胞培养基,涡旋后去除含有释放生物膜细胞的上清液,其 MIC 作为 “生物膜细胞” 的基线 MIC。在后续实验中,浮游细胞的上清液(涡旋前)每天转移到含有新鲜 MPs 的新鲜培养基中;生物膜细胞则每天去除上清液,将 MPs 重悬于新鲜培养基中涡旋,释放的生物膜细胞用于 MIC 测定,涡旋后的样品不再回加至实验体系。在测定细胞 MIC 时,浮游细胞直接取当天的上清液,生物膜细胞则通过取出上清液,将 MPs 重悬于 1 mL 新鲜培养基中涡旋释放细胞,取 350 μL 细胞悬液测量光密度(OD)。由于浮游细胞和生物膜细胞浓度不同,需将浮游细胞培养物稀释至与生物膜细胞 OD 值一致,再进行 MIC 测定。
  6. 共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)图像采集与分析:利用共聚焦显微镜观察粒子表面的细胞。从敏感性测试实验的培养物中随机选取 500 μm 直径 PS 球体,按照 LIVE/DEAD BacLight 细菌活力检测试剂盒的操作说明进行染色。SYTO 9 用于分析活细胞,因为它能穿透所有细菌细胞膜;碘化丙啶用于计数死细胞,因其只能进入细胞膜受损的细胞。将每个塑料球放入含有 1 mL 无菌水的离心管中,加入 3 μL 染色溶液(每种染料各 1.5 μL),在室温下避光孵育 20 min。染色后的样品用倒置 CLSM(Olympus DSU 旋转盘共聚焦显微镜),以 10× 油浸物镜进行成像。先分别对单独用碘化丙啶和 SYTO 9 染色的样品进行分析,确保信号清晰无重叠。将粒子从染料中取出,悬浮在 Costar 透明圆底 96 孔板中进行成像,以保持 MP 形状。找到样品并调整亮度参数后,对每个样品进行 z 轴层扫,获取生物膜活力的三维可视化图像,扫描从球形粒子生长起始的底部开始,到顶部结束。使用 FIJI 软件对 z 轴层扫数据进行分析,将显微镜采集的.oir 文件原始数据的红色和绿色通道合并,生成三维渲染图,再通过 “图像 -> 堆栈 -> z 投影”,选择 “最大强度” 投影类型对堆栈进行合并,进一步分析图像。
  7. 生物膜形成与结晶紫染色:将E. coli接种到 3 - 5 mL 培养基中,培养至稳定期(24 h)。次日,在无菌、未处理的 24 孔板中每孔加入 400 μL LB 培养基,接种细菌后覆盖培养板,在 37°C 静置培养 48 h。培养结束后,按照 Merritt 等人的方法进行结晶紫染色,用分光光度计在 500 - 600 nm 波长处测量孔内光密度(OD),以此定量生物膜形成情况。
  8. 运动性测定:按照 Partridge 和 Harshey 的方法制作 0.3% 琼脂平板,平板厚度保持一致(20 mL),制作完成后晾干 1 h。用 P20 移液器吸取 5 μL 菌液,插入琼脂约一半深度后缓慢滴加。将平板在 30°C 培养 20 h 后,用直尺测量细胞可见生长区域的径向运动直径(单位:cm),以此评估细菌的运动性。
  9. 统计分析:采用单因素方差分析(ANOVA)评估 MIC 倍数变化的显著性。在进行 ANOVA 之前,使用 Shapiro - Wilk 检验对残差进行正态性检验,确保数据符合高斯分布。将每个变量与对照组均值进行比较,对照组根据研究内容不同而有所变化。采用 Dunnett 检验进行多重比较,并相应调整P值。最后,通过 Brown - Forsythe 和 Bartlett 检验对残差的方差齐性和潜在聚类进行检验。选择单因素方差分析是因为在残差呈正态分布的假设下,它可用于比较不同组间的平均 MIC 倍数变化,而 Shapiro - Wilk 检验证实了该假设。Dunnett 检验适用于将每组与对照组进行比较,能有效控制 I 型错误。Brown - Forsythe 和 Bartlett 检验则用于评估方差齐性,保证 ANOVA 结果的可靠性。

结果

  1. MPs 在高浓度时影响细菌生长:将E. coli与 8 种不同浓度的 10 μm 直径 PS 球体 MPs 共同培养 18 h,以探究 MPs 对细菌生长的影响。在培养 1 h 后,不同浓度 MPs 处理组与野生型(WT)之间细菌生长无显著差异;但培养 24 h 后,10,000 和 15,000 个 MP/μL 的处理组 CFU/mL 显著低于 WT。值得注意的是,24 h 时涡旋样品的 CFU 计数更高,这表明 MPs 表面存在附着细胞,共聚焦成像结果也证实了这一点。
  2. 暴露于 PS MPs 增加多药耐药性:研究人员进一步探究暴露于 MPs 和亚抑制水平抗生素的细菌是否会对其他类抗生素产生耐药性,从而成为多药耐药菌。实验选用了氨苄青霉素(β - 内酰胺类抗生素)、环丙沙星(氟喹诺酮类)、强力霉素(四环素类)和链霉素(氨基糖苷类)这 4 种常见于环境中的抗生素。首先,测量单独培养于含有 MPs(500 μm 直径 PS 球体,因其易于传代)培养基中的细胞 MIC 变化,以确定在无抗生素存在时 MPs 对 AMR 的影响。结果显示,与不含 MPs 的培养基相比,含有 MPs 的培养基中细菌对上述所有抗生素的耐药性均显著增加。在 10 天的实验中,与第 0 天相比,传代后的 MPs 样品中细胞对环丙沙星、强力霉素和链霉素的 MIC 在第 10 天几乎提高了 100 倍。接着,测量在含有或不含有 MPs(500 μm 直径 PS 球体)的情况下,单独使用亚抑制水平抗生素培养的细胞 MIC。结果表明,几乎所有抗生素在添加 MPs 后,细菌的 AMR 均有所增加。例如,在相同抗生素培养条件下,添加 MPs 的培养基中细菌的 MIC 比仅含抗生素的培养基中至少高出 5 倍。其中,环丙沙星与 MPs 共同培养的细菌表现出更高水平的 MDR,其耐药性可达仅用抗生素培养的对照组的 171 倍。此外,链霉素与 MPs 共同培养的细菌对环丙沙星、强力霉素和链霉素均产生了极高水平的耐药性。在停止亚抑制抗生素暴露 5 天后,对细菌进行检测发现,在 16 种实验条件中,81.25%(13/16)在 MPs 和亚抑制抗生素中培养的细菌对相应抗生素保持或增加了耐药性;43.75%(7/16)仅在 MPs 中培养的细菌保持或增加了耐药性;而仅在亚抑制抗生素中培养的细菌,只有 18.75%(3/16)保持了耐药性,且其中两种稳定耐药的条件是在强力霉素中培养。
  3. 不同塑料特性(浓度和大小)对耐药性无显著影响:为探究不同 MPs 特征(浓度和大小)对抗生素耐药性的影响,实验以环丙沙星为研究对象,因其在上述研究中耐药性变化最为显著。在亚抑制环丙沙星条件下,研究 MPs 浓度对环丙沙星耐药性发展的影响。分别使用 500 μm 直径 PS 球体(40 和 100 个 MP/mL)和 10 μm 直径 PS 珠子(1,000、500、100 和 10 个 MP/μL),结果发现各 MPs 浓度处理组与不含 MPs 的对照组(仅含亚抑制水平环丙沙星)以及 WT 相比,环丙沙星 MIC 倍数变化均有显著差异;但不同 MPs 浓度之间,环丙沙星 MIC 变化无显著差异。不过,较大直径珠子的绝对 MIC 值最高可达 3.713 ± 0.66 μg/mL 环丙沙星,超过临床和实验室标准协会(CLSI)定义的临床断点(1 μg/mL)三倍以上;较小珠子的绝对 MIC 值最高为 2.508 ± 4 μg/mL 环丙沙星。研究还考察了 PS MPs 大小和表面积对 MIC 的影响,选用 5 μm(100 个 MP/μL)、10 μm(100 个 MP/μL)和 500 μm(40 个 MP/μL)直径的球体,结果表明不同大小 MPs 之间 MIC 差异无统计学意义,但含有 MPs 和抗生素的细胞绝对 MIC 值始终高于仅含抗生素的对照组和 WT,且均高于临床断点。
  4. 塑料成分影响抗生素耐药性:研究不同塑料成分对环丙沙星耐药性发展和程度的影响,对比了 PS、PE 和 PP 这三种常见塑料类型。实验结果显示,暴露 10 天后,所有不同 MP 成分处理组的 MIC 均显著高于仅暴露于亚抑制水平环丙沙星的 MPs-free 对照组。PS 样品的绝对 MIC 值(1.65 ± 0.572 μg/mL)与 PE(0.743 ± 0.36 μg/mL)、PP(0.528 ± 0.162 μg/mL)以及仅环丙沙星对照组(0.20625 ± 0.04 μg/mL)有显著差异,且 PS MPs 的绝对 MIC 值高于环丙沙星 - E. coli临床断点(1 μg/mL)。有趣的是,三种塑料样品的 AMR 增长速率在倍数变化方面相似。
  5. PS 相比玻璃更易增加耐药性和生物膜形成:比较 PS MP 和玻璃球体(500 μm 直径,40 个 MP/μL)对耐药性发展的差异,以确定塑料底物是否具有特殊作用。实验中,微粒均暴露于亚抑制水平环丙沙星,并与仅含亚抑制环丙沙星的对照组比较。结果显示,10 天研究结束时,PS 塑料球体的绝对 MIC 值显著高于玻璃球体和抗生素对照组;不过,二者的耐药性增长倍数变化无统计学差异。通过共聚焦显微镜观察发现,玻璃表面的细菌生长量明显减少,且大部分为死细胞;而 PS 表面则布满活细胞,细菌在其表面均匀定植。这表明 PS 比玻璃更有利于细菌形成生物膜,进而导致更高的耐药性。
  6. 暴露于 MPs 会筛选出更易形成生物膜的细菌:观察到 PS MPs 表面形成了大量生物膜后,进一步探究生物膜在其中的作用。利用结晶紫染色法检测生物膜形成情况,该方法可使生物膜可见并定量。将在含或不含 MPs、不同抗生素及对照组中培养 10 天的细菌,去除 MPs 和痕量抗生素后,在 24 孔 PS 培养板中培养 48 h,用 0.1% 结晶紫溶液定量生物膜形成。同时,采用 0.3% 软琼脂平板法检测细菌的游泳运动性,因为细菌运动性与生物膜形成密切相关,运动性受损通常与生物膜形成增加有关。结果显示,所有含 MPs 培养的样品生物膜生长均显著高于不含 MPs 的样品,表现为更高的 OD 读数和更多染色的表面附着细胞;而不含 MPs 培养的细菌运动直径显著大于含 MPs 培养的细菌,表明暴露于 MPs 的细菌运动性受损。为评估生物膜和浮游细胞对 AM

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