解析人无机磷酸盐转运体 XPR1:运输、调控机制与疾病关联的深度探索

《Nature Communications》:

【字体: 时间:2025年03月21日 来源:Nature Communications

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  在人体中,无机磷酸盐(Pi)的稳态调节至关重要,但其跨膜转运机制尚不完全清楚,XPR1 功能及相关疾病机制也有待明确。为此,研究人员开展了对人无机磷酸盐转运体 XPR1 的研究,确定其结构和功能机制。这为理解相关疾病及治疗干预提供了理论依据。

  在生命的微观世界里,无机磷酸盐(Pi)就像一把双刃剑,对细胞起着不可或缺的作用,它参与生物能量代谢、代谢调节、细胞增殖等关键过程,是细胞活动的重要 “参与者” 。然而,当 Pi 的浓度失衡时,就会带来一系列麻烦。目前,尽管 Pi 稳态在人体生理中极为重要,但人们对细胞控制 Pi 进出的复杂机制了解并不全面。尤其是对于唯一已知的 Pi 转运蛋白 XPR1(Xenotropic and Polytropic Retrovirus Receptor 1,也称为 SLC53A1 ),它在 Pi 转运过程中的具体功能和调控机制,以及其与相关疾病的联系,都是亟待探索的谜题。为了解开这些谜团,来自美国纪念斯隆凯特琳癌症中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center)等机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Nature Communications》上,为我们理解 XPR1 的功能、相关疾病机制以及潜在治疗干预提供了重要线索。
研究人员主要运用了冷冻电镜(cryo-EM)技术和功能表征实验这两种关键方法。冷冻电镜技术能够让研究人员在接近生理状态下观察 XPR1 的分子结构,功能表征实验则通过放射性 [32P] 转运测定等方法,检测 XPR1 的 Pi 转运功能。

研究结果如下:

  1. XPR1 的功能表征:研究人员开发了细胞放射性 [32P] 转运测定法,在 hTERT RPE-1 细胞中检测到 Pi 外排信号。通过生成 XPR1 基因敲除细胞和使用抑制肽 XRBD4,证实观察到的 Pi 外排依赖于内源性 XPR1。此外,将野生型 XPR1 重新引入敲除细胞后,Pi 外排功能得以恢复,表明功能性 XPR1 存在于细胞膜上。
  2. XPR1 的结构解析:研究人员纯化了重组全长人 XPR1 蛋白,利用冷冻电镜技术确定了其在不同构象状态下的结构,分辨率在 2.5 - 3.3 ? 之间。XPR1 由 N 端 SPX 结构域和十个跨膜 α - 螺旋(TM1 至 TM10)组成,呈二聚体构象。其膜嵌入结构域可分为支架结构域(TM1 - 4)和转运结构域(TM5 - 10),两个结构域之间存在胆固醇和磷脂等分子。
  3. XPR1 的不同构象状态:研究人员获得了 XPR1 的三种不同构象状态,这些状态与 PP - InsPs 的存在和种类相关。InsP8能使细胞内 SPX 结构域刚性化,而 InsP6则不能。非生理浓度的 Pi 可能会影响 XPR1 的蛋白行为。
  4. 二聚化对 XPR1 功能的重要性:研究发现 XPR1 的二聚化由 TM1 中的 GxxxG α - 螺旋堆积基序促进,突变该基序中的甘氨酸残基会破坏二聚化,进而影响 XPR1 的转运功能。此外,还观察到一种交替的二聚体组装形式,胆固醇可能在稳定 TM1、促进二聚化方面发挥作用。
  5. 底物转运途径:在 XPR1 的转运结构域中观察到三个与 Pi 底物一致的离散密度,确定了底物转运途径。Pi 结合位点 1 靠近细胞内部,与位点 2 通过短窄隧道相连,位点 3 靠近细胞外空间。突变 Pi 结合位点的氨基酸残基会影响 XPR1 的转运功能,表明 Pi 进入底物转运途径的能力对有效转运至关重要。
  6. InsP8依赖的调控机制:InsP8与 XPR1 二聚体结合,通过四个正电荷表面形成两个结合位点,稳定 SPX 结构域并桥接相邻结构域。突变结合位点的关键残基会影响 XPR1 的转运功能,表明 InsP8与两个口袋的结合对 XPR1 的转运功能是必要的。
  7. InsP8诱导的 Pi 转运:结合 InsP8的 XPR1 存在两种功能状态,即细胞内门开放(iO)和关闭(iC)状态。在 iC 状态下,C - 末端尾巴(C - plug)阻止 Pi 进入转运途径;在 iO 状态下,C - 末端尾巴被 SPX 结构域隔离,打开转运途径入口。缺乏 SPX 结构域或 C - 末端尾巴的 XPR1 无法进入 iO 状态,表明这些区域对 XPR1 的功能至关重要。

研究结论和讨论部分指出,XPR1 是哺乳动物中唯一含 SPX 结构域的蛋白,通过结合 InsP8感知细胞内 Pi 浓度并调节 Pi 外排活性。InsP8作为 “分子胶水”,桥接不同结构域,稳定 XPR1 的特定功能状态,这一调节机制与以往认知不同,体现了 PP - InsPs 调节含 SPX 结构域蛋白功能的多样性。此外,XPR1 离子传导途径存在细胞内和细胞外两个 “门”,InsP8结合可触发细胞内门打开,但目前关于 Pi 转运仍有许多问题待解,如离子通量速率测量、门开放的耦合机制、转运驱动力以及蛋白 - 蛋白相互作用对 XPR1 功能的影响等。该研究对理解原发性家族性脑钙化(PFBC)和癌症等疾病中 Pi 稳态失调的机制具有重要意义,为开发针对这些疾病的治疗方法提供了理论基础,有助于设计能够调节 XPR1 活性的药物,为相关疾病的治疗带来新的希望。
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