高耐药性肺炎克雷伯菌在巴西社区获得性感染中的流行情况

《Scientific Reports》：High proportions of multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae isolates in community-acquired infections, Brazil

本研究聚焦于巴西社区获得性肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）感染的耐药性问题，揭示了其在社区获得性血流感染（CA-BSI）和社区获得性尿路感染（CA-UTI）中的耐药特征及临床差异，为应对日益严峻的耐药形势提供了重要依据。

　　肺炎克雷伯菌是导致血流感染和尿路感染的重要病原菌，近年来其耐药性问题日益突出，给公共卫生带来巨大挑战。为了深入了解巴西社区获得性肺炎克雷伯菌感染的临床特征和耐药情况，巴西的研究人员开展了一项研究。他们对65株社区获得性肺炎克雷伯菌（包括24株CA-BSI菌株和41株CA-UTI菌株）进行了详细的抗药性测试、β-内酰胺酶和毒力基因评估、荚膜基因分型以及分子分型分析。研究发现，社区获得性肺炎克雷伯菌的多药耐药（MDR）率为24.6%，碳青霉烯耐药率为4.6%。CA-BSI菌株的耐药性更强，超广谱β-内酰胺酶（ESBL）产生菌和MDR菌株的比例显著高于CA-UTI菌株。此外，研究还揭示了高克隆多样性，多数MDR菌株（81.3%）和高致病性菌株（2/3）属于人类高危大流行克隆株。这些发现强调了巴西社区获得性感染中高耐药性肺炎克雷伯菌的高流行率，以及CA-BSI与CA-UTI在耐药性上的显著差异，为制定针对性的防控策略提供了重要参考。该研究发表在《Scientific Reports》上。

研究人员采用的关键技术方法包括：抗药性测试（Vitek? 2系统和磁珠法）用于评估菌株对多种抗生素的敏感性；聚合酶链反应（PCR）技术用于检测β-内酰胺酶基因和毒力基因；荚膜基因分型通过wzi基因测序实现；分子分型则结合了脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）技术，以分析菌株的克隆关系。样本队列来源于巴西萨尔瓦多的两家私立三级医院（CA-BSI样本）和联邦大学药学院临床分析实验室（CA-UTI样本）。

研究背景

肺炎克雷伯菌是一种广泛存在于自然环境和人体肠道中的革兰氏阴性菌，它是全球范围内引起血流感染和尿路感染的重要病原菌。近年来，随着抗生素的广泛使用，肺炎克雷伯菌的耐药性问题日益严重，尤其是多药耐药（MDR）菌株和碳青霉烯耐药菌株的出现，给临床治疗带来了巨大挑战。社区获得性感染是指患者在入院前或入院48小时内发生的感染，与医院获得性感染相比，其病原菌来源更复杂，耐药情况也有所不同。因此，了解社区获得性肺炎克雷伯菌的耐药性和临床特征对于制定有效的防控策略和治疗方案至关重要。

研究方法

研究人员从巴西萨尔瓦多的两家私立三级医院收集了24株社区获得性血流感染（CA-BSI）的肺炎克雷伯菌样本，以及从联邦大学药学院临床分析实验室收集了41株社区获得性尿路感染（CA-UTI）的样本。他们对这些样本进行了详细的抗药性测试，包括对多种抗生素的敏感性评估，使用Vitek? 2系统和磁珠法进行检测。此外，研究人员还通过PCR技术检测了β-内酰胺酶基因和毒力基因，以了解菌株的耐药机制和毒力特征。荚膜基因分型通过wzi基因测序实现，用于分析菌株的荚膜类型。分子分型则结合了脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）技术，以分析菌株的克隆关系。

研究结果

临床特征

研究发现，CA-BSI患者年龄较大，男性比例更高，且合并症较多，尤其是肾脏疾病。CA-BSI的感染源多为继发性，其中尿路是最常见的感染源。在CA-BSI患者中，有29.2%的患者出现了严重的菌血症，50.0%的患者出现了系统性并发症，如严重脓毒症或脓毒性休克。值得注意的是，CA-BSI患者的粗死亡率为25.0%，其中50.0%的死亡患者患有肾脏疾病。

耐药性分析

所有社区获得性肺炎克雷伯菌的多药耐药（MDR）率为24.6%，碳青霉烯耐药率为4.6%。CA-BSI菌株的耐药性更强，对头孢菌素、妥布霉素、碳青霉烯类、呋喃妥因和复方磺胺甲噁唑的耐药率显著高于CA-UTI菌株。CA-BSI菌株中ESBL产生菌的比例为37.5%，远高于CA-UTI菌株的9.8%。此外，所有ESBL产生菌均携带blaCTX?M?1、blaCTX?M?9或blaKPC?like基因。碳青霉烯酶基因blaKPC?like和blaNDM?like仅在CA-BSI菌株中检出。

毒力特征

研究人员发现，CA-BSI和CA-UTI菌株的毒力特征相似，大多数菌株被归类为经典肺炎克雷伯菌（cKp）。然而，有1株CA-BSI菌株和2株CA-UTI菌株表现出高致病性肺炎克雷伯菌（hvKp）的生物标志物。这些hvKp菌株携带了多种毒力相关基因，如peg-344、iroB、iucA、prmpA等。

分子分型

分子分型结果显示，肺炎克雷伯菌具有高度的克隆多样性。PFGE分析揭示了49种不同的脉冲型，而MLST分析则鉴定出43种不同的序列型（ST）。值得注意的是，多数MDR菌株（81.3%）属于人类高危大流行克隆株，如ST11、ST15、ST101、ST258、ST307和ST6852。此外，ST6852是首次在本研究中被鉴定出的新序列型。

研究结论与讨论

本研究揭示了巴西社区获得性肺炎克雷伯菌感染的耐药性和临床特征。研究结果表明，CA-BSI与CA-UTI在临床表现和耐药性上存在显著差异，CA-BSI患者年龄较大、男性比例更高、合并症更多，且耐药性更强。此外，研究还发现高克隆多样性，多数MDR菌株和高致病性菌株属于人类高危大流行克隆株。这些发现强调了巴西社区获得性感染中高耐药性肺炎克雷伯菌的高流行率，以及CA-BSI与CA-UTI在耐药性上的显著差异，为制定针对性的防控策略提供了重要参考。鉴于社区获得性耐药菌株的传播可能对公共卫生构成严重威胁，研究人员呼吁加强监测和预防措施，尤其是在巴西，目前缺乏针对社区获得性感染的全面耐药监测系统。