《Molecular Neurobiology》:Identification of Key Fatty Acid Metabolism-Related Genes in Alzheimer’s Disease
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为深入探究脂肪酸代谢在阿尔茨海默病(AD)发病机制中的作用,研究人员开展相关基因分析及药物筛选研究,揭示了DLD、ELOVL5和HMGCS1三个关键基因,为AD治疗提供了新靶点。
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种进行性神经退行性疾病,其发病机制中
脂肪酸代谢的作用尚未完全明确。研究人员利用来自GEO数据库的AD转录组测序数据,初步筛选出差异表达基因,并应用加权基因相关性网络分析(Weighted Gene Correlation Network Analysis, WGCNA)识别关键基因模块。通过将这些基因与脂肪酸代谢相关基因(FAMRGs)取交集,获得了与AD相关的脂肪酸代谢基因(AD-FAMRGs)。随后,研究人员开展了KEGG、GO以及单样本基因集富集分析(Single-sample Gene Set Enrichment Analysis, ssGSEA)。进一步运用三种机器学习算法确定关键AD-FAMRGs,进而识别出风险基因,并构建风险模型,通过受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线分析进行验证。此外,研究人员还进行了蛋白对接研究,评估关键AD-FAMRGs与Tau以及淀粉样β(amyloid beta, Aβ)蛋白之间的相互作用。为了探索潜在的治疗途径,研究人员在DrugBank数据库中搜索针对这些AD-FAMRGs的药物,并进行了
分子对接和动力学模拟。研究结果突出了三个关键AD-FAMRGs:DLD、ELOVL5和HMGCS1。功能富集分析表明它们与代谢、氧化应激以及AD发病机制相关。ZDOCK分析进一步暗示了它们与Tau和Aβ蛋白的相互作用,表明它们可能参与了AD的病理过程。ROC分析展示了这些AD-FAMRGs的预测准确性,其AUC值范围为0.764到0.876。分子对接和动力学模拟证实了预测的治疗药物与这些关键AD-FAMRGs的良好结合。研究表明脂肪酸代谢可能参与了AD的发病机制,DLD、ELOVL5和HMGCS1可能作为AD的潜在
治疗靶点。
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