《Scientific Reports》:Transcriptome profiles of leaves and roots of Brassica napus L. in response to antimony stress
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为探究油菜对锑(Sb)胁迫的响应,研究人员开展相关研究,发现 75mg/L Sb 或为适应浓度,明确关键基因及通路。
在城市工业化快速发展的进程中,重金属污染问题愈发严重。像镉(Cd)、铅(Pb)、锑(Sb)等重金属,因矿产资源的过度开发、冶炼以及不合理排放,在大气、水体和土壤中广泛分布,对生态环境和生物健康造成了极大威胁。其中,锑作为一种重要的战略资源,在半导体、电池等领域应用广泛,但它在环境中的不当积累却给植物生长带来了诸多困扰。植物一旦受到锑胁迫,生长发育往往会受到抑制,而目前对于油菜这一全球重要的油籽作物在应对锑胁迫方面的研究还十分有限,其具体的分子机制更是知之甚少。
为了深入了解油菜对锑胁迫的响应机制,湖南人文科技学院农业与生物技术学院等研究机构的研究人员展开了一系列研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为后续抗锑油菜品种的选育以及污染土壤的植物修复提供了重要的理论依据。
在这项研究中,研究人员主要运用了以下关键技术方法:首先,采用水培实验,选取多个油菜商业品种,设置不同浓度的 Sb (III) 处理组,模拟真实的污染环境,观察油菜在不同锑浓度下的生长情况;其次,运用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)技术测定油菜各组织中的锑积累量,利用相关试剂盒检测抗氧化酶(如超氧化物歧化酶 SOD、过氧化物酶 POD、过氧化氢酶 CAT)活性和丙二醛(MDA)含量等生理指标;最后,借助转录组测序(RNA-seq)技术,分析不同处理组油菜根和叶组织中的差异表达基因(DEGs),并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,探究这些基因的功能和参与的代谢通路,还利用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)对 RNA-seq 数据进行验证。
研究结果如下:
- 锑积累与生理指标变化:研究人员发现,随着 Sb 浓度的增加,不同油菜品种整株植物中的 Sb 积累量呈现先上升后下降的趋势。在 6 个油菜品种中,XZY787、XZY512、ZYZ28 和 QY18H 在 75mg/L Sb 浓度下积累量达到峰值,FY789 在 50mg/L 时达到最大值,HYZ50 则在 25mg/L 时达到峰值,其中 XZY512 在 75mg/L 时 Sb 含量最高,为 561.42mg/kg。同时,研究人员测定了 XZY512 根和叶组织中的生理指标,发现根组织中 SOD、POD、CAT 活性和 MDA 含量随着 Sb 浓度的增加而增加,在 75mg/L 时达到峰值后下降;叶组织中 SOD 和 POD 活性变化不一致,高浓度 Sb 处理下 CAT 活性下降,MDA 含量显著降低。这表明 75mg/L Sb 可能是油菜适应的最佳浓度,超过该浓度可能会对油菜造成生理损伤。
- RNA 测序与差异表达基因分析:对 0mg/L(对照)和 75mg/L Sb 处理的根和叶组织进行 RNA 测序,共获得 80.58Gb 的 clean bases。通过筛选,在根组织(RCK_vs_RTr 比较)中鉴定出 8,802 个 DEGs,其中 4,274 个上调,4,528 个下调;在叶组织(LCK_vs_LTr 比较)中鉴定出 13,612 个 DEGs,6,653 个上调,6,959 个下调。有 2,218 个 DEGs 在根和叶组织中共享,包括 1,498 个上调基因和 720 个下调基因。
- GO 富集与 KEGG 通路分析:GO 富集分析表明,根组织中的 DEGs 主要参与氧化应激反应、对有毒物质的响应、铁离子结合和谷胱甘肽转移酶活性等功能;叶组织中的 DEGs 主要与叶绿体类囊体、光系统 II、对脱落酸的响应和叶绿素结合等功能相关。KEGG 通路分析显示,根组织中 DEGs 在谷胱甘肽代谢、植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢、ABC 转运蛋白、油菜素内酯生物合成和 MAPK 信号通路 - 植物等通路显著富集;叶组织中 DEGs 在光合生物的碳固定、光合作用、光合作用 - 天线蛋白、谷胱甘肽代谢和氧化磷酸化等通路富集。
- 抗氧化应激反应相关 DEGs 分析:在 Sb 胁迫下,油菜根和叶组织中与氧化应激反应相关的关键基因(58/64)显著上调,包括多种抗氧化基因,如谷胱甘肽过氧化物酶(GPXs)、抗坏血酸过氧化物酶(APXs)和过氧化物酶(PERs)等。同时,调节 SOD、POD 和 CAT 活性的基因在根组织中表达显著升高,与生理活性变化一致,表明这些抗氧化相关基因在应对 Sb 诱导的氧化损伤中发挥重要作用。
- 谷胱甘肽代谢和 MAPK 信号通路相关 DEGs 分析:在根组织中,鉴定出 6 组与谷胱甘肽代谢相关的 DEGs。Sb 处理后,谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)基因、部分编码 6 - 磷酸葡萄糖酸脱氢酶的基因和 L - 氨基酸合成相关基因上调,而葡萄糖 - 6 - 磷酸 1 - 脱氢酶(G6PD3)和部分谷胱甘肽 S - 转移酶(GSTF)基因下调。在 MAPK 信号通路中,多个与病原体感染、防御反应和逆境适应相关的基因,如 MEKK1、WRKY33、ACS6 等上调,同时 ABA 信号模块相关基因表达发生变化,表明这些基因在油菜应对 Sb 胁迫中起重要调节作用。
- ABCTransporter 和光合作用通路相关 DEGs 分析:在根组织中,发现 15 个 ABC 基因参与 ABC 转运蛋白通路,其中 ABCB 亚家族 9 个基因上调,ABCC 亚家族 4 个基因(除 ABCC9 和 ABCC4)下调。在叶组织中,光合作用通路相关基因显著下调,包括光系统 I 反应中心、光系统 II 受体侧、光合电子传递、Cytb6/f 复合体和 F 型 ATP 酶等基因,说明 Sb 胁迫对油菜叶片光合作用造成严重破坏。
研究结论与讨论部分指出,油菜对 Sb 胁迫的响应涉及复杂的调控网络。75mg/L Sb 可能是油菜适应的阈值浓度,超过该浓度会影响油菜的生长和抗氧化系统。根组织中,Sb 胁迫主要影响与氧化应激、谷胱甘肽代谢、ABC 转运蛋白和 MAPK 信号通路相关的基因表达;叶组织中,主要影响光合作用相关基因。这些研究结果不仅揭示了油菜应对 Sb 胁迫的分子机制,还为利用油菜进行土壤锑污染的植物修复提供了理论支持,同时为后续选育抗锑油菜品种奠定了基础,具有重要的科学意义和应用价值。
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