《Scientific Reports》:Multi-omic biomarkers associated with multiple sclerosis: from Mendelian randomization to drug prediction
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本研究通过孟德尔随机化(Mendelian Randomization, MR)分析和贝叶斯共定位分析,鉴定出EVI5、OGA和TNFRSF14为多发性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)的潜在治疗靶点,为开发新型免疫疗法提供科学依据
多发性硬化症(Multiple Sclerosis, MS)是一种主要影响中枢神经系统的自身免疫性疾病,其发病机制复杂,涉及遗传、免疫调节、环境等多种因素。目前,MS的治疗面临诸多挑战,包括药物副作用、治疗反应率差异等问题。为探索新的
治疗靶点,长春中医药大学的研究人员开展了一项基于多组学分析的研究,旨在通过
孟德尔随机化分析和
贝叶斯共定位分析,鉴定与MS相关的潜在治疗靶点,并预测相关药物,研究成果发表于《Scientific Reports》。
研究背景
多发性硬化症(MS)是一种常见的中枢神经系统自身免疫性疾病,全球范围内发病率存在显著差异。MS的发病机制复杂,涉及遗传、饮食、免疫调节和环境因素等多方面。目前,MS的治疗选择有限,且存在药物副作用、治疗反应率差异等问题。因此,探索新的治疗靶点对于改善MS患者的预后具有重要意义。
研究方法
研究人员采用孟德尔随机化(Mendelian Randomization, MR)分析和贝叶斯共定位分析,结合多组学分析方法,鉴定与MS相关的潜在治疗靶点。研究首先利用两个大规模的血浆蛋白定量性状位点(plasma protein quantitative trait locus, pQTL)数据集进行两样本孟德尔随机化分析,筛选出与MS相关的血浆蛋白。随后,通过贝叶斯共定位分析验证这些蛋白的编码基因与MS之间的关联。此外,研究人员还进行了全表型关联研究(Phenome-wide association study, PheWAS),分析这些基因的表型关联,并通过蛋白质相互作用网络(Protein-protein interaction, PPI)分析、基因本体论(Gene Ontology, GO)分析和KEGG通路分析,探索这些基因的生物学功能和潜在的药物靶点。
研究结果
在孟德尔随机化分析中,研究人员发现冰岛队列中有88种血浆蛋白与MS相关,英国生物银行(UK Biobank)队列中有122种血浆蛋白与MS相关。其中,尿卟啉原III合成酶(UROS)和谷胱甘肽S转移酶θ2B(GSTT2B)是两个数据集中共同的阳性蛋白。在贝叶斯共定位分析中,EVI5(PPH4 = 0.9800)、O-GlcNAcase(OGA)(PPH4 = 0.8569)和肿瘤坏死因子受体超家族成员14(TNFRSF14)(PPH4 = 0.8904)被鉴定为与MS显著相关的基因。此外,研究人员还发现EVI5在胎盘、肝脏、睾丸等组织中表达较高;OGA主要在骨髓中表达;TNFRSF14主要在十二指肠中表达。通过PPI网络分析、GO分析和KEGG通路分析,研究人员进一步揭示了这些基因的生物学功能和潜在的药物靶点。
研究结论
本研究通过孟德尔随机化分析和贝叶斯共定位分析,鉴定出EVI5、OGA和TNFRSF14为MS的潜在治疗靶点。这些基因在MS的发病机制中可能发挥重要作用,为开发新型免疫疗法提供了科学依据。此外,研究人员还预测了与这些靶点相关的药物,为MS的治疗提供了新的思路。未来的研究将进一步验证这些靶点的生物学功能,并探索其在MS治疗中的应
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