《SCIENCE ADVANCES》:The conserved Spd-2/CEP192 domain adopts a unique protein fold to promote centrosome scaffold assembly
编辑推荐:
为探究 Spd-2/CEP192 蛋白如何促进 PCM 支架组装,研究发现 SP2D 促进支架组装,相关突变影响该过程。
在细胞的微观世界里,中心体扮演着极为重要的角色,它就像是细胞的 “指挥中心”,负责组织和协调细胞内的各项活动。中心体的形成过程十分复杂,当母亲中心粒(centriole)招募周围的中心粒周围物质(pericentriolar material,PCM)时,中心体便开始组装。PCM 中包含数百种蛋白质,这使得中心体能够作为主要的微管(microtubule,MT)组织中心,在众多细胞类型中发挥关键作用。然而,中心体一旦出现功能障碍,就会引发一系列人类疾病和发育障碍,比如男性不育、Mosaic Variegated Aneuploidy(MVA)综合征等。
在中心体组装过程中,Spd-2/CEP192(果蝇 / 人类命名法)蛋白起着至关重要的作用。这种蛋白含有一个特殊的 Spd-2 结构域(SP2D),由两个紧密相邻的 AspM-Spd-2-Hydin(ASH)结构域组成。尽管 ASH 结构域存在于多种与中心体、纤毛、鞭毛和高尔基体相关的蛋白质中,但它们的具体功能却一直是个谜。为了深入了解 Spd-2/CEP192 蛋白在 PCM 支架组装中的作用机制,来自国外的研究人员开展了一系列研究,相关成果发表在《SCIENCE ADVANCES》上。
研究人员主要运用了以下几种关键技术方法:一是利用晶体学和核磁共振(NMR)光谱技术解析蛋白质结构;二是构建果蝇转基因品系,通过荧光标记观察蛋白行为;三是进行蛋白质突变实验,探究突变对蛋白功能的影响;四是借助 AlphaFold 等预测工具辅助结构分析。
在研究结果方面:
- Spd-2/CEP192 蛋白结构:通过预测和实验手段,发现果蝇 Spd-2 和人类 CEP192 的 N 端部分氨基酸序列呈无序状态,C 端包含不同数量的 ASH 结构域,且 ASH 结构域多为单体,采用免疫球蛋白样折叠。不同物种的 CEP192/Spd-2 中 ASH 结构域数量有所差异,其中果蝇的 ASH1 和 ASH2 结构域、人类的 ASH4 和 ASH5 结构域共同构成最保守的 SP2D 结构域,但这些 ASH 结构域在部分物种中的位置和序列存在差异。
- DmSpd-2 不同区域功能分析:以果蝇 Spd-2 为模型,构建转基因品系表达不同形式的 GFP 融合蛋白。研究发现,果蝇 Spd-2 的 N 端区域负责将其靶向到中心粒,而 C 端区域则对 PCM 支架组装至关重要,缺少任何一端都无法挽救 Spd-2 突变导致的胚胎早期致死现象。
- SP2D 在 PCM 支架组装中的作用:构建删除不同 ASH 结构域的果蝇转基因品系,结果表明 SP2D 及其组成的 ASH1、ASH2 结构域对 Spd-2 和 PCM 支架组装不可或缺,而 ASH3 结构域则并非必需。在无 Cnn 的情况下,Spd-2 仍能形成依赖 SP2D 的残留 PCM 支架。
- SP2D 结构域的结构特征:解析人类和蜜蜂 SP2D 的晶体结构,发现二者都呈现出独特的 “延伸摇篮” 结构,由两个 ASH 结构域通过保守的相互作用界面连接而成,该结构通过内部的 “桥” 结构和保守的静电相互作用网络维持稳定。虽然人类和蜜蜂的 SP2D 结构高度相似,但内部的分子相互作用存在部分差异。
- SP2D 突变对体内 Spd-2 支架组装的影响:基于 AlphaFold2 预测果蝇 SP2D 结构,对其主要接触界面的氨基酸进行突变。结果显示,突变会影响 Spd-2 支架组装,且与人类疾病相关的 N844S 突变会降低蛋白溶解度,部分破坏蛋白折叠,进而影响其在体内的定位和功能。
- 潜在的 Spd-2 自相互作用界面:发现果蝇 SP2D 在高浓度下有形成二聚体的趋势,经 PLK1 磷酸化后,C 端区域可形成更大的分子质量物种。预测的潜在二聚体相互作用界面突变会干扰 Spd-2 形成高分子质量复合物和体内中心体支架组装,表明该界面可能对 Spd-2 支架组装具有重要意义。
研究结论和讨论部分指出,SP2D 独特的 “延伸摇篮” 结构对 Spd-2/CEP192 的支架功能至关重要。尽管目前还不清楚该结构如何具体促进有丝分裂 PCM 组装,但研究发现 Spd-2 在无 Cnn 的情况下能形成依赖 SP2D 的残留 PCM 支架,且磷酸化的 Spd-2 可能通过自身寡聚化形成高阶组装体来实现这一过程。此外,不同物种中 Spd-2/CEP192 蛋白含有的额外 ASH 结构域功能尚不明确,在果蝇中,ASH3 结构域虽对 Spd-2 功能不是必需的,但会影响其在中心体的分布。同时,研究还发现 SP2D 并非将 Spd-2 靶向中心体所必需,而是在 PCM 支架组装中发挥关键作用,未来需要进一步研究中心粒蛋白 Ana1(人类 CEP295)与 Spd-2 N 端区域的相互作用及其保守性。
总的来说,这项研究深入揭示了 Spd-2/CEP192 蛋白中 SP2D 结构域在中心体组装中的重要作用,为理解中心体相关疾病的发病机制提供了关键线索,也为后续开发相关治疗策略奠定了坚实基础。
下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究
10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!
欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书
单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析
下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》