生物信息学助力非洲抗菌药物耐药性监测：喀麦隆的创新实践与突破

《BMC Microbiology》：Enable, empower, succeed: a bioinformatics workshop Harnessing open web-based tools for surveillance of bacterial antimicrobial resistance

为解决资源受限地区抗菌药物耐药性（AMR）监测难题，研究人员开展生物信息学培训研究，提升了参与者技能，意义重大。

　　在全球范围内，抗菌药物耐药性（Antimicrobial Resistance，AMR）正成为一个日益严峻的公共卫生问题，如同一场没有硝烟的战争，威胁着人类的健康。据预测，如果不加以有效控制，到 2050 年，AMR 每年将导致 1000 万人死亡，经济损失高达 1000 亿美元。在非洲的西部撒哈拉以南地区，情况更为糟糕，每 10 万人中就有 27.3 人受到影响 ，这里的监测和控制措施却常常受到诸多限制。

面对这一困境，基因组学研究本应成为 “破局” 的关键武器。通过它，人们可以深入了解 AMR 的产生、传播机制，进而制定有效的遏制策略。在资源匮乏的非洲，基因组学研究的开展却困难重重，其中最突出的问题就是专业人才的短缺，这就像是在战场上缺少了精锐的士兵，使得相关研究难以顺利推进。

为了填补这一空白，喀麦隆的研究机构 —— 研究与专业知识中心和生物诊断中心（Research Institute of the Centre of Expertise and Biological Diagnostic of Cameroon，CEDBCAM-RI）的研究人员挺身而出，开展了一项极具意义的研究。他们举办了一场为期三天的生物信息学研讨会（Bioinformatics workshop），旨在利用便捷易用的网络工具，提升当地研究人员在基因组学研究方面的能力，为 AMR 监测提供有力支持。这项研究成果发表在《BMC Microbiology》杂志上。

在研究方法上，研究人员采用了多种关键技术。首先，精心设计了研讨会的课程，课程内容涵盖生物信息学概念、工具使用和数据解读等多个方面，且基于成人学习原则和主动学习方法进行设计。其次，在全球范围内邀请了经验丰富的培训师，这些培训师来自 H3ABioNet、Wellcome Connecting Science 等机构，为参与者提供专业指导。此外，还挑选了一系列免费、易用且适合参与者水平的网络工具，如 Basic Local Alignment Search Tool（BLAST）、CSIPhylogeny 等，让参与者能够利用这些工具进行实际操作。

研究结果令人欣喜。在技能发展和知识保留方面，参与者在研讨会前后的信心调查结果显示出巨大变化。在研讨会前，大部分参与者对识别下一代测序技术或工作流程、使用网络生物信息学工具分析遗传数据等方面缺乏信心，很多人在相关能力的评分中较低。在研讨会后，参与者的信心大幅提升，几乎所有参与者都对识别下一代技术或工作流程充满信心，在使用 NCBI BLAST 等工具进行数据分析以及解读计算机模拟预测分析等方面，多数参与者也表现出更高的信心水平。在参与者反馈和参与度方面，参与者对研讨会的内容、授课方式和整体体验都非常满意。他们认为互动式的学习方式以及使用免费网络工具的实践练习，极大地提高了他们的参与度和理解能力。所有参与者都给予了在线讲座和课程材料较高的评分，并且表示希望继续参加中级水平的研讨会，还期待将生物信息学方法应用到当前和未来的研究项目中。

在研究结论和讨论部分，此次研讨会成功地为参与者提供了关键的生物信息学技能和知识，显著提升了他们在基因组学和生物信息学各个方面的信心水平，这对于在资源受限地区开展 AMR 监测意义非凡。与传统的面对面研讨会相比，本次采用的混合式培训方法具有诸多优势，如培训师的位置更灵活、成本更低，且参与者可以持续访问研讨会材料和资源。利用免费的网络工具也是在资源受限地区开展 AMR 基因组监测的可行途径，它让参与者在不受机构资源限制的情况下获得了必要的技能。然而，研究也存在一些局限性。例如，网络连接不稳定可能会影响学习效果；研讨会时间较短，无法深入探讨更高级的主题；远程交流的效果不如面对面交流，语言障碍也在一定程度上影响了参与者的理解。针对这些问题，研究人员提出了一些建议，如利用当地集群基础设施进行更复杂的生物信息学分析、开展长期培训项目、加强评估和影响评估、推广 Train-the-Trainer（TtT）框架以及促进培训的包容性等。

总的来说，这项研究不仅为喀麦隆乃至其他资源受限地区的研究人员提供了宝贵的生物信息学技能，还为全球范围内对抗 AMR 的斗争提供了可借鉴的模式和经验，为未来的研究和实践指明了方向，对实现全球健康和可持续控制 AMR 具有重要意义。