编辑推荐:
为探究唾液酸化在肺腺癌(LUAD)中的作用机制,研究人员筛选相关生物标志物,发现芦丁曲克芦丁可靶向 EGLN3 抑制 LUAD 发展。
在癌症的世界里,肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)是一种常见且棘手的恶性肿瘤。它如同隐藏在身体里的 “定时炸弹”,常常在悄无声息中发展,等到出现胸痛、咳嗽、血痰等症状时,很多患者已处于晚期,这使得临床治疗难度大增,5 年生存率仅约 15%。目前,虽然针对 LUAD 的诊断和治疗方法不断发展,像靶向免疫疗法给部分患者带来了希望,但大多数患者会对靶向治疗产生耐药性,预后依旧很差。而唾液酸化作为一种重要的糖基化修饰,其在 LUAD 中的具体作用机制却尚不明确,这就像迷雾一样笼罩着科研人员,也促使他们迫切地想要揭开其中的奥秘,找到新的治疗靶点和方法。
为了解开这个谜团,华北理工大学的研究人员展开了一系列深入的研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为 LUAD 的防治带来了新的曙光。
在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们从公共数据库(UCSC-XENA 数据库、Gene Expression Omnibus 数据库等)下载了大量 LUAD 患者的基因表达数据和临床信息,同时获取了 109 个唾液酸化相关基因(SRGs)。通过生物信息学分析,如合并数据集、去除批次效应、进行单变量 Cox 回归分析等,筛选出与 LUAD 预后相关的 SRGs。还利用细胞实验,包括细胞培养、转染、RNA 提取和实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、蛋白质免疫印迹(Western blot)等,来验证基因的功能和药物的作用。
研究结果主要包括以下几个方面:
- 唾液酸化相关亚组的差异:通过单变量 Cox 回归分析,研究人员发现 LUAD 整合数据集中有 26 个 SRGs 与预后相关。基于这些 SRGs,他们将 LUAD 患者分为两个唾液酸化相关亚组,即 Cluster A 和 Cluster B。进一步分析发现,Cluster A 患者的生存率更高,免疫浸润程度也更高,且两个亚组在肿瘤微环境方面存在明显差异。Cluster A 主要涉及磷脂酰肌醇信号系统、血管平滑肌收缩等通路,而 Cluster B 主要参与葡萄糖代谢、戊糖磷酸途径等。
- 预后模型的构建与验证:研究人员利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归分析确定了 6 个预后 SRG 特征,并构建了风险预后模型。该模型能够有效预测 LUAD 患者的生存情况,且通过单变量和多变量 Cox 回归分析发现,T3 分期和风险评分是独立的预后因素。此外,他们还构建了列线图来预测患者 1 年、3 年和 5 年的生存率,校准曲线显示该模型具有较高的准确性。
- EGLN3 基因的功能研究:研究发现 EGLN3 基因在 LUAD 细胞、癌组织和患者血液中均高表达。通过 RNA 干扰技术敲低 EGLN3 后,A549 和 PC-9 细胞的增殖、迁移、侵袭和克隆形成能力均受到显著抑制,同时唾液酸水平也降低。这表明 EGLN3 在 LUAD 的发展中起着重要作用。
- 芦丁曲克芦丁的作用探究:通过分子对接筛选出靶向 EGLN3 的药物芦丁曲克芦丁(Troxerutin)。实验表明,芦丁曲克芦丁对 PC-9 细胞的抑制作用更强,能显著降低 EGLN3 蛋白水平,抑制 LUAD 细胞的增殖、迁移、侵袭和克隆形成能力,诱导细胞凋亡,还可降低细胞周期中 G2 期的比例。
研究结论和讨论部分指出,该研究确定了 6 个与唾液酸化相关的预后基因,构建的预后模型能有效预测 LUAD 患者的风险。EGLN3 被证实是与唾液酸化相关的生物标志物,芦丁曲克芦丁可通过下调 EGLN3 表达和唾液酸生成,抑制肺癌细胞的多种恶性行为。然而,研究也存在一些局限性,如模型的准确性和实用性需要在更大样本中验证,体外实验不能完全模拟体内环境,芦丁曲克芦丁可能存在脱靶效应等。尽管如此,这项研究仍为 LUAD 的未来诊断和靶向治疗提供了新的思路和参考,为后续研究指明了方向,有望推动 LUAD 治疗领域的进一步发展。
娑撳娴囩€瑰宓庢导锔炬暩鐎涙劒鍔熼妴濠団偓姘崇箖缂佸棜鍎禒锝堥樋閹活厾銇氶弬鎵畱閼筋垳澧块棃鍓佸仯閵嗗甯扮槐銏狀洤娴f洟鈧俺绻冩禒锝堥樋閸掑棙鐎芥穱鍐箻閹劎娈戦懡顖滃⒖閸欐垹骞囬惍鏃傗敀
10x Genomics閺傛澘鎼isium HD 瀵偓閸氼垰宕熺紒鍡氬劒閸掑棜椴搁悳鍥╂畱閸忋劏娴嗚ぐ鏇犵矋缁屾椽妫块崚鍡樼€介敍锟�
濞嗐垼绻嬫稉瀣祰Twist閵嗗﹣绗夐弬顓炲綁閸栨牜娈慍RISPR缁涙盯鈧鐗哥仦鈧妴瀣暩鐎涙劒鍔�
閸楁洜绮忛懗鐐寸ゴ鎼村繐鍙嗛梻銊ャ亣鐠佹彃鐖� - 濞e崬鍙嗘禍鍡毿掓禒搴n儑娑撯偓娑擃亜宕熺紒鍡氬劒鐎圭偤鐛欑拋鎹愵吀閸掔増鏆熼幑顔垮窛閹貉傜瑢閸欘垵顫嬮崠鏍掗弸锟�
娑撳娴囬妴濠勭矎閼崇偛鍞撮摂瀣鐠愩劋绨版担婊冨瀻閺嬫劖鏌熷▔鏇犳暩鐎涙劒鍔熼妴锟�