研究人员运用了多种技术方法。首先,从反刍动物基因组数据库中提取 77 种反刍动物的 SLAM 序列,进行系统发育分析和序列比对,以探究它们之间的进化关系;接着,使用软件预测山羊 SLAM 与 PPRV H 的相互作用以及蛋白结构,分析关键氨基酸位点;然后,构建表达不同反刍动物 SLAM 的 293T 细胞系;之后,用 rPPRV - GFP 感染细胞,通过观察合胞体形成、检测 GFP 表达、测定病毒滴度等实验来评估 SLAM 介导 PPRV 感染的能力;最后,运用统计学方法对实验数据进行分析。
SLAM 基因的系统发育分析:通过分析 77 种反刍动物 SLAM 基因的编码序列(CDS),构建的系统发育树将反刍动物分为六个家族,即鼷鹿科(Tragulidae)、麝科(Moschidae)、鹿科(Cervidae)、叉角羚科(Antilocapridae)、长颈鹿科(Giraffidae)和牛科(Bovidae)。该树与基于全基因组数据的进化关系有显著相似性,表明 SLAM 基因相似性能部分反映反刍动物的进化关系。
SLAM 与 PPRV H 蛋白相互作用的氨基酸分析:基于麻疹病毒 H 蛋白和人 SLAM 蛋白的晶体结构,构建 PPRV H - 山羊 SLAM 蛋白复合物模型,发现 SLAM 与 PPRV H 相互作用的位点都在 V 区域。对 77 种反刍动物 SLAM 蛋白的比较分析显示,多数参与相互作用的氨基酸保守,但在 72、91、126 和 130 位存在差异。选取代表性物种构建模型,发现它们的 SLAM 整体结构相似,预测与 PPRV H 相互作用的氨基酸位于 V 区域的等效位置,推测这些物种的 SLAM 可能像山羊 SLAM 一样介导 PPRV 感染。
表达反刍动物 SLAM 蛋白的细胞系构建:合成来自 Java 鼷鹿、长颈鹿、林麝、白尾鹿、叉角羚和山羊的 SLAM 基因,并构建表达这些 SLAM 的 293T 细胞系。经检测,这些细胞系均表达 SLAM 和 Cherry 蛋白,且 SLAM 定位在细胞膜,表明这些细胞系适合用于评估不同反刍动物 SLAM 支持 PPRV 感染的能力。
研究结论和讨论部分指出,PPRV 的地理分布不断扩大,对新宿主的适应能力给防控带来挑战。此次研究通过对 77 种反刍动物 SLAM 受体的分析,从细胞层面深入了解了 PPRV 的潜在宿主范围。发现多数反刍动物 SLAM 在与病毒 H 蛋白相互作用的区域高度保守,且表达不同反刍动物 SLAM 的细胞能有效介导 PPRV 感染和复制,这意味着 PPRV 的潜在宿主可能比之前认为的更广泛。不过,研究也存在一些局限,如部分物种 SLAM 基因测序结果有核苷酸缺失,尚未构建细胞系评估其对 PPRV 感染的影响。但总体而言,该研究为监测易感宿主提供了重要依据,对全球消灭 PPRV 的工作有着积极的推动作用,有助于制定更全面、有效的防控策略,保护反刍动物的健康,促进畜牧业的稳定发展。