《Molecular Biomedicine》:M6A-modified BFSP1 induces aerobic glycolysis to promote liver cancer growth and metastasis through upregulating tropomodulin 4
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为探究 m6A 修饰的 BFSP1 在肝癌中的作用,研究人员开展相关研究,发现其促进肝癌进展,为肝癌治疗提供新策略。
肝癌,作为一种原发性恶性肿瘤,严重威胁着人类健康,在全球范围内,它占原发性肝癌病例的 80% 以上,还是癌症相关死亡的第二大主因。当前,尽管有手术切除、靶向治疗等多种治疗手段,但治疗效果仍不尽人意。因此,深入探究肝癌发病和转移的潜在机制,对早期诊断和干预意义重大。
在众多与癌症相关的研究方向中,RNA N6 - 甲基腺苷(m6 A)修饰成为焦点。m6 A 是真核生物中常见的 RNA 修饰,其异常调节与癌症进展紧密相连。有氧糖酵解作为癌细胞获取能量的主要方式,也在癌症发展中扮演着重要角色。此前研究发现,串珠丝结构蛋白 1(BFSP1)是肝癌中与 m6 A 相关的基因,但 m6 A 修饰的 BFSP1 对有氧糖酵解的影响以及在肝癌进展中的调控机制尚不明确。
基于此,西安交通大学第二附属医院的研究人员开展了一系列研究,相关成果发表在《Molecular Biomedicine》上。
研究人员采用了多种关键技术方法。他们收集了 30 例肝癌患者的样本(这些患者经组织学确诊为肝癌,接受了手术切除,且临床和随访数据完整等),还培养了多种细胞系,包括人肝永生化细胞系 THLE-2 和肝癌细胞系 HepG2、Hep3B、SNU-449、MHCC97-H 等。实验中运用了细胞转染技术,将构建的 sh-METTL3、sh-YTHDF1、sh-BFSP1、sh-TMOD4 等载体转入肝癌细胞。此外,qPCR、Western blotting 用于检测基因和蛋白表达水平,Co-IP 分析、免疫荧光染色探究蛋白间相互作用,ECAR 和 OCR 分析评估细胞代谢,还有 MeRIP-qPCR、RIP 分析等用于研究 m6 A 修饰相关机制,最后构建裸鼠异种移植瘤模型进行体内实验。
下面来看看具体的研究结果:
BFSP1 在肝癌中上调 :研究人员分析了肝癌组织和细胞中 BFSP1 的表达水平,发现其在肝癌组织和细胞系中均上调。而且,BFSP1 高表达的患者预后较差。这表明 BFSP1 与肝癌的发生发展存在关联。
BFSP1 影响肝癌细胞的有氧糖酵解 :通过构建 sh-BFSP1 和 pcDNA-BFSP1 载体并转染肝癌细胞,研究发现敲低 BFSP1 会降低肝癌细胞的细胞外酸化率(ECAR)、增加耗氧率(OCR),减少丙酮酸、乳酸含量,降低己糖激酶 2(HK2)、磷酸果糖激酶 1(PFK1)、丙酮酸激酶 M2(PKM2)的活性以及葡萄糖摄取,抑制糖酵解相关蛋白表达,抑制细胞活力和侵袭能力;而过表达 BFSP1 则产生相反效果。这说明 BFSP1 具有促进肝癌细胞恶性表型的潜力。
BFSP1 与 TMOD4 相互作用并促进其表达 :免疫荧光、Co-IP 和 GST pull down 分析表明,BFSP1 与原肌球调节蛋白 4(TMOD4)在细胞质中共定位且直接相互作用。同时,TMOD4 在肝癌患者肿瘤组织和细胞系中也上调,并且 BFSP1 和 TMOD4 相互促进表达。
TMOD4 敲低逆转 BFSP1 过表达对肝癌细胞的影响 :将 pcDNA-BFSP1 和 / 或 sh-TMOD4 转染到肝癌细胞中,结果显示 TMOD4 敲低可逆转 BFSP1 过表达对有氧糖酵解、细胞活力和侵袭能力的促进作用。这进一步证实了 BFSP1 通过与 TMOD4 相互作用诱导有氧糖酵解并促进肝癌细胞侵袭。
METTL3 通过 m6 A 修饰上调 BFSP1 表达 :预测和实验结果表明,BFSP1 mRNA 存在多个 m6 A 修饰位点,甲基转移酶样 3(METTL3)与 BFSP1 表达正相关,且能结合 BFSP1 mRNA,敲低 METTL3 会抑制 BFSP1 mRNA 表达和总 RNA 的 m6 A 水平。此外,YTH 结构域家族蛋白 1(YTHDF1)与 BFSP1 结合,敲低 YTHDF1 会抑制 BFSP1 表达。这说明 METTL3 通过 YTHDF1 依赖的方式诱导 BFSP1 m6 A 修饰,促进其转录。
METTL3 增强 BFSP1 稳定性并促进肝癌细胞的有氧糖酵解和侵袭 :实验表明,敲低 METTL3 或 YTHDF1 会缩短 BFSP1 mRNA 的半衰期。过表达 METTL3 和 YTHDF1 会促进肝癌细胞的 ECAR 水平、降低 OCR 水平,敲低 BFSP1 则可逆转这些效果。这表明 METTL3 介导的 BFSP1 mRNA m6 A 修饰通过 YTHDF1 依赖的方式增强 BFSP1 稳定性,促进肝癌细胞的有氧糖酵解和侵袭。
METTL3 通过激活有氧糖酵解诱导肝癌细胞的活力和侵袭 :使用 2 - 脱氧葡萄糖(2-DG)处理发现,其可减弱 BFSP1 或 METTL3 过表达对有氧糖酵解的促进作用,以及对细胞活力和侵袭能力的影响。这说明 METTL3 通过激活有氧糖酵解诱导肝癌细胞的活力和侵袭。
METTL3 促进肝癌的进展和转移 :在裸鼠体内实验中,过表达 METTL3 会促进肝癌细胞在小鼠体内的肿瘤生长和肺转移,敲低 BFSP1 则可逆转这些效果。这表明 METTL3 通过上调 BFSP1 的 m6 A 水平加速肝癌的恶性进展和肺转移。
综合研究结果和讨论部分,此次研究发现 BFSP1 在肝癌中上调,它与 TMOD4 共同影响肝癌细胞的活力、侵袭和有氧糖酵解。METTL3 以 YTHDF1 依赖的方式增强 BFSP1 mRNA 的稳定性,促进肝癌细胞的有氧糖酵解。体内实验也证实了 METTL3 通过上调 BFSP1 的 m6 A 修饰促进小鼠肝癌肿瘤生长。虽然该研究存在一定局限性,如仅在细胞和肝癌异种移植模型中验证,BFSP1/TMOD4 轴作为临床指标还需进一步验证等,但它仍为揭示 BFSP1 调节肝癌进展和转移的分子机制提供了新视角,表明 BFSP1 在肝癌治疗中可能具有潜在价值,为未来肝癌研究提供了新的思路和方向。
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