基于二硫死亡的分子聚类和预后特征预测结肠癌患者生存及免疫微环境

【字体: 时间:2025年03月19日 来源:Discover Oncology 2.8

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  为探究二硫死亡(Disulfidptosis)对结肠癌影响,研究人员构建模型,发现其可预测患者生存及免疫状态,助力个性化免疫治疗。

  # 结肠癌研究新突破:二硫死亡相关分子聚类与预后模型助力精准治疗
在癌症的世界里,每一种细胞死亡方式都像是一把独特的 “钥匙”,可能开启攻克肿瘤的大门。二硫死亡,作为一种新型的程序性细胞死亡方式,与我们熟知的细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡截然不同。近年来,细胞死亡在各种疾病,尤其是恶性肿瘤中的作用备受关注,众多研究深入剖析了不同细胞死亡方式对肿瘤发生、发展的影响。然而,二硫死亡在结肠癌中扮演着怎样的角色,它又如何影响肿瘤微环境(Tumor Microenvironment,TME)和免疫反应,一直是科学界亟待探索的谜题。
结肠癌,作为全球范围内发病率和死亡率都居高不下的恶性肿瘤,给患者和医疗界带来了沉重的负担。目前,结肠癌的治疗手段多样,包括传统的手术、放化疗,以及近年来迅速发展的靶向药物和免疫治疗。尽管这些治疗方法使患者的总体生存率有所提高,但仍有许多患者的治疗效果不尽人意。因此,寻找新的生物标志物,开发更精准有效的治疗策略,成为了结肠癌研究领域的迫切需求。

在这样的背景下,赣南医学院、广东省人民医院赣州医院、南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)等机构的研究人员展开了深入研究。他们旨在通过构建与二硫死亡相关的分子聚类和预后模型,揭示二硫死亡在结肠癌中的作用机制,为结肠癌患者的个性化免疫治疗提供有力支持。该研究成果发表在《Discover Oncology》杂志上。

研究人员开展此项研究运用了多种关键技术方法。首先,从 The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取结肠癌患者的基因表达数据和临床信息,并利用 R 软件进行数据处理与转换。通过一致性聚类分析,研究人员对二硫死亡相关基因(Disulfidptosis - related genes,DRGs)进行分类,构建二硫死亡相关分子聚类。此外,借助 CIBERSORT 算法和 ESTIMATE 算法评估患者的免疫细胞浸润水平和 TME 评分。同时,运用单变量和多变量 Cox 回归分析筛选预后相关基因,构建预后模型。最后,通过免疫组化(Immunohistochemistry,IHC)验证标记基因的表达和预后价值。

研究结果


  1. DRGs 的基因突变景观:研究人员通过分析 TCGA - COAD 数据集,发现了 7 个差异表达的 DRGs。蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络显示 FLNB 是枢纽基因。在 432 例分析样本中,16.9% 的样本存在突变,其中 MYL6 突变率最低,FLNB 和 FLNA 突变率最高。同时,验证了这 7 个 DRGs 在结肠癌组织和正常组织中的表达差异显著,表明 DRGs 可能参与结肠癌的发生。
  2. 二硫死亡相关基因簇的鉴定:基于 7 个 DRGs 的表达谱,研究人员对 COAD 患者进行一致性聚类分析,将患者分为两个 DRG 簇(C1 和 C2)。C2 簇的 TME 评分显著高于 C1 簇,且两个簇中免疫细胞浸润水平存在差异,如 C1 簇中静息记忆 CD4+T 细胞、活化记忆 CD4+T 细胞等表达较强,而 C2 簇中幼稚 B 细胞和 M0 巨噬细胞高表达。此外,GSEA 分析显示 C2 簇中与肿瘤转移相关的通路,如粘着斑、间隙连接等显著富集。
  3. 基于差异表达基因(DEGs)的簇的鉴定:GO 和 KEGG 富集分析表明,DEGs 与多种细胞成分、生物学过程和分子功能相关,涉及粘着斑、白细胞跨内皮迁移、PI3K - Akt 信号通路等多个过程,进一步揭示了二硫死亡相关基因在结肠癌发生发展中的重要作用。
  4. 二硫死亡相关预后特征的开发与验证:通过单变量和 LASSO - Cox 回归分析,研究人员筛选出 10 个预后相关的 DEGs(Prognosis - related differentially expressed genes,PRDEGs),构建了预后模型。根据风险评分将患者分为高、低风险组,KM 曲线显示两组患者生存率差异显著,高风险组患者死亡风险更高。ROC 曲线显示,该模型对 1 年、3 年和 5 年生存率的预测 AUC 分别为 0.69、0.69 和 0.71,表明模型具有良好的预测效能。同时,分析发现 PRDEGs 的表达与患者预后及多种免疫细胞相关。
  5. 预后风险评分的临床相关性分析:单变量和多变量 Cox 分析表明,风险评分是影响患者预后的独立因素。进一步分析发现,风险评分与 T 分期、N 分期和 TNM 分期呈正相关,提示风险评分与肿瘤进展密切相关。
  6. 列线图的构建与校准曲线:研究人员结合风险评分和其他临床数据构建列线图,用于预测 COAD 患者 1 年、3 年和 5 年的总生存率(Overall Survival,OS)。校准曲线验证了列线图预测的准确性,ROC 曲线显示列线图的 1 年、2 年和 3 年 AUC 分别为 0.75、0.76 和 0.77,表明列线图具有较强的预测能力。
  7. 高、低风险评分亚组中 TME 和检查点的评估:CIBERSORT 算法分析显示,高风险组中调节性 T 细胞、M0 巨噬细胞和 M2 巨噬细胞升高,而静息记忆 CD4 T 细胞等下调。高风险组的 COAD 基质和 ESTIMATE 评分更高,且两组间有 9 个免疫检查点差异表达,提示不同风险组对免疫治疗的反应可能不同。
  8. 肿瘤突变负荷(TMB)的评估:突变景观图显示,高风险组的突变事件频率高于低风险组,且两组间部分基因的突变存在显著差异,这可能影响患者对免疫治疗的反应。
  9. PRDEGs 的免疫组化分析:免疫组化分析显示,FABP4、HEYL、ADAM8 等在结直肠癌和癌旁组织中差异表达,而 NOS2、CALB2 和 TIMP1 在结直肠癌中未表达。FSTL3 在癌和癌旁组织中均高表达,但单变量 Cox 回归分析表明其是与 OS 相关的唯一标记基因。KM 曲线分析显示,高表达 FABP4、低表达 ADAM8 和 FSTL3 的患者预后更好。

研究结论与意义


本研究基于 DRGs 的表达构建了相关分子聚类和预测模型,发现基于 10 个 PRDEGs 的预后特征在预测结肠癌患者生存、TME 状态和免疫反应方面表现良好。这一成果有助于为结肠癌患者提供个性化的免疫治疗策略,具有重要的临床意义。同时,研究揭示了二硫死亡相关基因在结肠癌发生发展中的作用机制,为深入理解结肠癌的生物学特性提供了新的视角,也为未来开发针对二硫死亡的靶向治疗药物奠定了理论基础。然而,该研究仍存在一定的局限性,如需要进一步在更大规模的队列中验证模型的准确性,探索二硫死亡与其他细胞死亡方式之间的相互关系等。未来的研究有望在这些方面取得突破,为结肠癌的治疗带来新的希望。
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