新种发现！红树林根际土壤中分离出 Thioclava kandeliae sp. nov.

《Current Microbiology》：Thioclava kandeliae sp. nov., Isolated from the Rhizosphere Soil of Mangrove Plant Kandelia candel

来自未知研究团队从红树林根际土壤分离菌株 CPCC 100088T，鉴定为 Thioclava 新物种。

　　从红树林中桐花树（Kandelia candel）的根际土壤样本里，分离出了一株革兰氏染色阴性、无运动性、好氧的细菌，命名为菌株 CPCC 100088^T。菌株 CPCC 100088^T在 15 - 37°C、pH 6.0 - 9.0 以及 0 - 7%（w/v）NaCl 存在的条件下均能生长，最适宜生长条件为 28 - 32°C、pH 6.0 - 7.0 且无 NaCl。该菌株的过氧化氢酶和氧化酶活性呈阳性。主要呼吸醌为 Q - 10，主要极性脂质是磷脂酰乙醇胺（Phosphatidylethanolamine）和磷脂酰甘油（Phosphatidylglycerol），主要脂肪酸为 C_16:0和总和特征 8（C_18:1ω7^c/C_18:1ω6^c）。菌株 CPCC 100088^T与太平洋硫棒菌（Thioclava pacifica）DSM 10166^T和海洋硫棒菌（Thioclava marina）11.10 - 0 - 13^T的 16S rRNA 基因序列相似性最高，为 96.4%，与硫棒菌属（Thioclava）其他成员的相似性为 95.5 - 95.8% 。在基于 16S rRNA 基因或全基因组构建的系统发育树中，菌株 CPCC 100088^T位于副球菌科（Paracoccaceae）的硫棒菌属系统发育分支内。菌株 CPCC 100088^T的全基因组大小为 4.3 Mbp，G + C 含量为 61.3%。基于全基因组序列的数字 DNA - DNA 杂交（dDDH）和平均核苷酸同一性（ANI）值（分别为 19.6% 和 74.4%）低于物种界定阈值。基于表型和基因型数据，研究人员提议菌株 CPCC 100088^T代表硫棒菌属的一个新物种，命名为 Thioclava kandeliae sp. nov.，模式菌株为 CPCC 100088^T（= I07B - 00821^T = KCTC 32191^T）。