解析陆地棉中棉113基因组：揭示重要农艺性状及短季适应的遗传奥秘

研究人员解析陆地棉（Gossypium hirsutum L.）中棉 113 基因组，发现重要农艺性状相关变异，意义重大。

　　

棉花（Gossypium hirsutum L.）是一种具有全球经济重要性的关键异源多倍体作物。在此，研究人员呈现了优质品种中棉 113 从端粒到端粒的基因组组装结果。

利用包括 PacBio HiFi、牛津纳米孔技术（ONT）超长读长测序和 Hi-C 等技术，该组装在连续性和完整性方面超越了以往的基因组，解析出 26 个着丝粒区域、52 个端粒区域、5S rDNA 簇以及核仁组织区。

研究人员发现了一个在系统发育上较新的、特定于陆地棉的 D08 染色体着丝粒重定位现象，这涉及到祖先着丝粒的失活以及一个独特的、基于卫星重复序列的着丝粒的形成。基因组分析评估了关键农艺性状的有利等位基因聚集情况，并揭示了一种早熟单倍型，它源自一个 11 Mb 的近着丝粒倒位，该倒位在陆地棉驯化早期就已演化形成。

这项研究揭示了陆地棉短季适应性的基因组起源，可能涉及从原始驯化品种中导入的倒位，随后在现代育种计划中发生单倍型分化。