一种预测转移性肝脏恶性肿瘤患者预后的新型 5 个差异表达基因（DEG）特征及 SPP1 的预后和治疗潜力

《International Journal of Clinical Oncology》：A novel 5-differentially expressed gene (DEG) signature predicting the prognosis in patients with metastatic liver malignancies and the prognostic and therapeutic potential of SPP1

为探究肝细胞癌（HCC）中与肝癌发生和转移相关的差异表达基因（DEG）及其预测总生存期（OS）的价值，研究人员开展相关研究。通过分析基因表达数据集和体外实验，确定 5-DEG 特征，发现 SPP1 作用关键，可为 HCC 治疗提供潜在靶点。

　　本研究旨在识别与肝细胞癌（HCC）的肝癌发生和转移相关的差异表达基因（DEGs），并探究它们在预测总生存期（OS）方面的价值。研究方法包括对基因表达数据集进行生物信息学分析，以及使用 HCC 细胞系进行体外实验。

研究人员利用 limma R 包分析了转移性和非转移性肝癌标本的基因表达谱，借助 Metascape 进行功能富集分析。基于 TCGA-LIHC 数据，运用 LASSO 算法构建了一个预后 5 基因特征。采用 Kaplan-Meier 生存分析评估这些基因与临床结局（无病间期 DFI、疾病特异性生存期 DSS、总生存期 OS 和无进展生存期 PFS ）之间的关联。在体外实验中，将针对 SPP1 的 shRNA 转染到 Huh7 和 Hep3B 细胞中，以实现 SPP1 基因的敲低。使用 CCK-8 检测法测定细胞活力，通过 Transwell 实验和划痕愈合实验评估细胞迁移能力，并利用蛋白质免疫印迹法（western blotting）评估蛋白质表达情况。

基因表达谱分析鉴定出 11 个与免疫反应、吞噬作用和细胞迁移相关的 DEGs。通过 LASSO 算法从这些 DEGs 中筛选出一个 5-DEG 特征（MASP1、MASP2、MUC1、TREM1 和 SPP1），该特征可用于预测肝癌患者的 OS。在这五个基因中，SPP1 在癌症样本中上调最为明显，并且与较差的临床结局显著相关，包括 DFI、DSS、OS 和 PFS。体外实验证实，在 Huh7 和 Hep3B 细胞中敲低 SPP1 能够显著抑制癌细胞的活力和迁移能力。蛋白质免疫印迹分析显示，敲低 SPP1 后，关键蛋白发生改变，波形蛋白（vimentin）和 Ki-67 减少，而 E - 钙粘蛋白（E-cadherin）增加。

本研究突出了 SPP1 在 HCC 发展中的关键作用，强调了其作为肝癌患者 OS 生物标志物的潜力。所鉴定出的 DEGs 可作为 OS 的预测标志物以及 HCC 治疗的潜在靶点。