靶向SARS-CoV-2主蛋白酶与刺突蛋白的糖酵解抑制剂:分子对接、药效分析及分子动力学模拟研究
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时间:2025年03月17日
来源:In Silico Pharmacology
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新冠肺炎(COVID-19)疫情持续威胁全球健康,来自未知机构的研究人员通过虚拟筛选、分子对接和分子动力学(MD)模拟技术,发现氟代脱氧葡萄糖叶酸(FDGF)和N-(2-氟-3-(6-O-糖基丙基-氮霉素))能双重抑制病毒主蛋白酶和刺突蛋白RBD-ACE2结合,结合能分别达-8.6/-7.1 kcal/mol和-9.9/-7.5 kcal/mol,为开发抗新冠病毒代谢干预疗法提供新策略。
冠状病毒感染(COVID-19)被世界卫生组织列为2020年全球卫生紧急事件,促使科学家持续探索有效治疗方案。致病因子SARS-CoV-2依赖病毒蛋白与宿主代谢重编程完成复制。本研究创新性探索糖酵解抑制剂作为双功能抗病毒剂,重点靶向病毒复制关键元件——主蛋白酶(Mpro)和介导细胞入侵的刺突蛋白(S蛋白)。这类抑制剂既能干扰病毒蛋白功能,又可阻断宿主糖酵解通路。通过虚拟筛选结合分子对接技术,氟代脱氧葡萄糖叶酸(FDGF)和N-(2-氟-3-(6-O-糖基丙基-氮霉素))展现出显著结合活性,与Mpro的结合能分别为-8.6和-7.1 kcal/mol,与刺突蛋白受体结合域(RBD)-ACE2复合物的结合能达-9.9和-7.5 kcal/mol。后续分子动力学(MD)模拟证实了复合物体系的稳定性,为开发靶向病毒-宿主互作网络的抗COVID-19药物奠定理论基础。
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