新型 MBT LipidART 模块检测大肠杆菌和肺炎克雷伯菌对粘菌素耐药性的性能评估

【字体: 时间:2025年03月17日 来源:European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 3.7

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  研究人员评估 MBT LipidART 模块检测大肠杆菌和肺炎克雷伯菌粘菌素耐药性,其对大肠杆菌检测效果更好。

  在当今医疗领域,细菌耐药性问题愈发严峻,尤其是碳青霉烯耐药(CR)的革兰氏阴性杆菌(GNB)感染,治疗起来困难重重。这类细菌中,产碳青霉烯酶(CP)的 GNB,特别是携带金属 -β- 内酰胺酶(MBL)的菌株,更是让人头疼。在斯洛文尼亚,产碳青霉烯酶的肠杆菌科细菌(CPE)的流行率不断攀升,其中产 MBL 的菌株占比很高,在 2022 年新检测出的 CPE 患者中,携带 MBL 和 OXA - 48 的菌株占比达到了 51%。
面对这一困境,粘菌素成为治疗 CPE 感染的最后一道防线之一。然而,传统的参考肉汤微量稀释(BMD)法检测粘菌素耐药性需要耗费一天时间才能出结果,这对于急需精准治疗方案的患者来说,时间太过漫长。为了更快地检测出粘菌素耐药性,研究人员一直在努力探索新的方法。

在此背景下,来自卢布尔雅那大学医学院微生物学和免疫学研究所的 Julija Germ 和 Mateja Pirs 开展了一项研究,旨在评估基于 MALDI Biotyper? Sirius 系统的 MBT LipidART 模块,通过分析脂质 A 谱在负离子模式下快速检测大肠杆菌(EC)和肺炎克雷伯菌(KPN)对粘菌素耐药性的性能。该研究成果发表在《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》杂志上。

研究人员在开展研究时,用到了几个主要关键的技术方法。首先,他们使用 MALDI TOF MS(Microflext LT,Bruker Daltonics,德国)对收集的菌株进行鉴定。然后,采用 Sensititre? FRCOL BMD 平板(Thermo Scientific,美国),按照 EUCAST 标准,对粘菌素敏感性进行重复测试。对于 MBT LipidART 模块检测,研究人员根据制造商的说明,使用 MBT Lipid XtractTM试剂盒从过夜培养的细菌中提取脂质 A,再用 DHB 基质将提取的沉淀重复点样到一次性 MBT Biotarget 96 孔板上,手动校准后在负离子模式下获取质谱图,并用 FlexAnalysis v.3.4 软件进行处理分析。

研究结果如下:

  • 实验菌株情况:研究共纳入了 98 株菌株,其中包括 58 株大肠杆菌(32 株对粘菌素耐药,26 株敏感,14 株为超广谱 β - 内酰胺酶(ESBL)产生菌,无 CR/CPE 菌株)和 40 株肺炎克雷伯菌(16 株对粘菌素耐药,24 株敏感,17 株为 ESBL 产生菌,8 株为 CR 菌株,其中 6 株为 CPE)。
  • MBT LipidART 模块对大肠杆菌的检测结果:对于大肠杆菌,MBT LipidART 模块的分类一致性(CA)达到了 98.3%。26 株敏感菌株全部被正确识别为 ColS - N;32 株耐药菌株中,31 株被成功检测出来,仅有 1 株因结果不一致需要重新检测。在 31 株确认的耐药菌株中,16 株染色体编码的耐药菌株在区分质粒和染色体耐药方面表现不佳;14 株 mcr - 1 介导的耐药菌株被准确鉴定为 ColR - P,而唯一的 1 株 mcr - 2 分离株虽被识别为耐药,但在耐药机制分类上存在偏差。
  • MBT LipidART 模块对肺炎克雷伯菌的检测结果:肺炎克雷伯菌的检测结果则更具挑战性。40 株菌株中有 12 株需要重新检测,原因包括结果无效(7 株)、不一致(2 株)或结果不符(3 株)。重新检测后,仍有 5 株菌株无法获得有效结果。最终,CA 为 85.0%,部分菌株因粘液样和贴壁特性影响了样本制备,导致检测困难。

研究结论和讨论部分指出,MBT LipidART 模块在快速检测粘菌素耐药性方面具有一定潜力,操作时间仅需 30 分钟,大大提高了工作效率。然而,该检测方法目前仅用于研究用途(RUO),尚未适用于临床应用。一方面,手动校准在技术上要求较高;另一方面,肺炎克雷伯菌样本制备问题以及可能存在的其他耐药机制,影响了其检测性能。不过,对于大肠杆菌的检测性能表现优异。未来,进一步开发 LipidART 软件和优化样本制备方案,有望提高其可靠性,使其在临床应用中发挥更大作用。这项研究为后续更深入地探索粘菌素耐药性检测方法,以及优化抗菌治疗策略,提供了重要的参考依据。

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