IER3 在 NB 中起抑癌基因作用:研究人员在临床数据中观察到,在 NB 患者中,IER3 高表达预示着良好的预后,低表达则与较差的预后相关,且 IER3 与 MYCN 表达呈负相关。为深入探究 IER3 在 NB 中的作用,他们构建了 IER3 功能缺失(shRNA)的稳定细胞系。功能实验表明,IER3 敲低后,NB 细胞系的增殖、集落形成和侵袭能力显著增强,细胞周期在 S 期发生阻滞,肿瘤体积和重量增加。这一系列实验结果表明,IER3 在 NB 细胞中具有抑癌特性。
IER3 介导的促生存途径的特征:对 IER3 敲低细胞的 RNA 测序数据进行功能富集和基因本体(GO)通路分析,发现不同细胞系存在特异性通路。例如,SH-SY5Y 细胞系主要涉及 DNA 复制起始通路,而 SK-N-BE (2) 和 KELLY 细胞系则与血管成熟通路相关。研究人员进一步验证了相关基因的作用,结果表明 IER3 参与了 SH-SY5Y 细胞的 DNA 复制和修复功能。
IER3 依赖的致癌和抑癌通路的特征:研究人员对比分析了宫颈癌和 NB 癌症模型中差异调节的基因,发现 EGR2 和 ADAM19 基因在两种模型中的表达模式相反。在 HeLa 细胞中,IER3 敲低后 EGR2 表达降低,ADAM19 表达升高;在 NB 细胞系中则相反。通过染色质免疫沉淀(ChIP)实验发现,IER3 敲低后,EGR2 和 ADAM19 启动子区域的染色质修饰发生改变,这与它们的表达变化一致。ChIP 测序和 ChIP-qPCR 实验证实,IER3 能够结合到 EGR2 和 ADAM19 的启动子区域,调控它们的功能。临床数据显示,EGR2 高表达与 NB 和宫颈癌患者的不良预后相关,ADAM19 高表达则与良好预后相关。这表明 EGR2 和 ADAM19 是 IER3 的真正靶基因,IER3 通过差异调控它们的表达,发挥致癌或抑癌功能。