开发叶绿体分子标记助力越橘属物种鉴别研究

为解决越橘属物种分类及鉴别问题，研究人员开发叶绿体 HRM 标记，可区分部分物种。

　　越橘属（Vaccinium）是一个庞大的属，包含蓝莓、蔓越莓、欧洲越橘和越橘等具有重要经济价值的作物。这些物种的野生近缘种常被用于育种计划，通过基因渗入引入理想性状。在此背景下，准确的分类学分类对于预测杂交亲和性、支持种质特征描述和谱系分析具有重要意义。此外，食品行业中存在浆果掺假和误认的情况，尤其是高价值野生浆果被栽培变种替代。因此，开发用于区分越橘属物种的分子标记对于遗传分析至关重要。本研究旨在开发基于叶绿体的分子标记（HRM），并评估其在代表 18 种越橘属物种 / 杂交种的 66 个基因型中的鉴别能力。研究人员对公开的叶绿体基因组中的完整叶绿体 DNA 序列进行比对，以识别单核苷酸多态性（SNP）和插入缺失（InDel）。从这些序列中设计了 25 对引物，针对多态性区域进行高分辨率熔解（HRM）基因分型。层次聚类分析表明，主要的经济重要性浆果作物之间有明显的区分，其中一个标记被认为信息尤为丰富。然而，蓝果越橘组（Cyanococcus section）内的物种，包括栽培和野生蓝莓，聚类模式更为复杂，这可能反映了它们的亲缘关系较近以及驯化过程中杂交事件的影响。值得注意的是，北高丛蓝莓和南高丛蓝莓与矮丛蓝莓、兔眼蓝莓和野生蓝莓混合在一起，限制了所报道标记对蓝果越橘组中某些物种的鉴别能力。本研究开发的基于叶绿体的 HRM 标记为区分越橘属物种提供了一种新颖、高通量、经济高效的方法。其高灵敏度对于阐明越橘属复杂的系统发育具有重要价值，并支持其在谱系分析、种质特征描述以及为育种和工业目的识别错误标记的基因型等方面的应用。