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基于类固醇生成途径的深度神经网络模型精准预测生物年龄
【字体: 大 中 小 】 时间:2025年03月16日 来源:SCIENCE ADVANCES 11.7
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为解决生物年龄(BA)预测难题,研究人员构建基于类固醇生成途径的 DNN 模型,可精准预测 BA,意义重大。
在时光的长河中,衰老悄然而至,它可不只是岁月流逝那么简单,而是细胞和分子层面的 “大动荡”。随着年龄增长,细胞损伤不断积累,像阿尔茨海默病、帕金森病、骨质疏松等与衰老密切相关的疾病也纷纷找上门,给老年人的健康带来极大挑战。虽然现代医学不断进步,但这些疾病依旧难以治愈,目前主要通过早期诊断和管理来延缓病情发展。在这个过程中,准确评估个体的生物年龄(BA)就显得尤为关键,它能反映人体的生理状态,对理解衰老进程和制定有效干预措施至关重要。然而,BA 的测定十分复杂,受遗传和非遗传因素共同影响,而且目前还没有统一的测量标准。早期依靠肺容量、握力等表型指标的方法既不精确也不规范,预测衰老相关疾病的能力有限。近年来,研究人员开始转向更内在的测量方法,如利用全血细胞计数、生化测试等,但这些方法仍无法直接洞察驱动衰老的生理或代谢途径。于是,组学技术应运而生,其中,类固醇激素作为生理衰老的关键指标,其代谢途径与衰老密切相关,为 BA 预测带来了新希望。
在这样的背景下,国外研究人员开展了一项极具意义的研究,相关成果发表在《SCIENCE ADVANCES》上。研究人员旨在开发一种基于类固醇生成途径的深度神经网络(DNN)模型,以提高 BA 预测的准确性。
为了实现这一目标,研究人员运用了多种关键技术方法。样本方面,从 150 名 20 - 73 岁健康个体中获取血清样本,其中 100 名用于建模,50 名用于验证,且验证集中包含吸烟习惯信息。检测技术上,采用液相色谱 - 串联质谱(LC - MS/MS)法定量分析 22 种类固醇激素。数据处理时,运用基于累积分布函数(CDF)的比例缩放方法对数据进行预处理,以减少批次效应和个体生理差异带来的影响。同时,利用主成分分析(PCA)评估性别对类固醇浓度的影响,为构建性别特异性模型提供依据。
研究结果如下:
DNN 数据集生成:通过 LC - MS/MS 对 150 名个体的 22 种类固醇进行定量分析,排除 2 个异常样本后,将剩余样本按性别分为训练集和验证集。PCA 分析发现性别对类固醇浓度影响显著,不同性别类固醇谱存在差异,支持构建性别特异性模型。此外,研究还发现个体间类固醇浓度存在高度同步性,但也有细微差异。
数据缩放效果:基于 CDF 的比例缩放方法有效保留了类固醇浓度的相对比例,减少了样本间的变异性,且该方法不受 ABO 血型、Rh 血型和种族的影响,增强了数据的一致性和模型的稳健性。
DNN 设计:构建的 DNN 模型架构反映了类固醇生物合成的顺序阶段,从孕烯醇酮(P5)开始,到压力指数(PI)、性指数(SI)及最终的 BA 预测。模型初始化时根据类固醇间及类固醇与实际年龄(CA)的 Spearman 相关性设置边缘权重,并使用自定义的加权对称反正切损失(WSATL)函数,通过五折交叉验证优化超参数,有效捕捉了衰老的异质性。训练后的模型显示,皮质类固醇和性激素途径对 BA 预测有显著贡献,且存在性别特异性差异。
DNN 模型性能:分析预测 BA 与实际 CA 的散点分布发现,多数预测结果在实际值两倍变化范围内,不同组间预测损失无显著差异,表明模型性能稳定。对吸烟习惯的分析显示,男性吸烟者的生物年龄加速趋势明显,而女性吸烟者无显著差异。
敏感性分析:敏感性分析表明,皮质醇(COL)对 BA 预测的敏感性影响超过 40%,在女性模型中,17α - 羟基孕酮(17 - OH - P4)等类固醇也有稳定的正向影响;在男性模型中,P5 和睾酮(TE)有类似趋势。方差分析(ANOVA)显示,22 种类固醇的输入值对 BA 预测模型解释能力较强,且 COL 与 BA 存在强线性相关性,可作为反映 BA 的可靠标记。
研究结论和讨论部分指出,该研究构建的基于类固醇代谢途径的 DNN 模型,有效捕捉了衰老的异质性和类固醇生成影响的复杂生物过程,揭示了性别特异性差异,突出了类固醇代谢在衰老研究中的重要性。基于 CDF 的比例缩放方法提升了模型的预测能力,但模型在外部数据集的应用受限于完整的类固醇检测。研究还确定了 COL 等与衰老相关的类固醇标记,不过吸烟对生物年龄的影响在不同性别中存在差异,且研究存在样本量小、缺乏详细生活方式数据等局限性。未来研究可通过纵向研究、扩大数据集和对比分析等方式,进一步提升模型的预测能力和临床相关性,有望为个性化衰老干预提供有力支持,帮助人们更好地理解和应对衰老过程。
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