探秘周氏吻虾虎鱼(Rhinogobius zhoui)线粒体 DNA:结构、亲缘关系与鱼类演化新解

【字体: 时间:2025年03月16日 来源:Biochemical Genetics 2.1

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  为研究Rhinogobius zhoui线粒体 DNA(mtDNA),研究人员测序分析,发现其 mtDNA 长 16,491bp,与Rhinogobius duospilus亲缘近。

  周氏吻虾虎鱼(Rhinogobius zhoui)仅在中国广东省莲花山的溪流中被发现。在人工环境中繁育的周氏吻虾虎鱼幼鱼没有浮游阶段,具有陆封型生活史。目前,关于该物种的已发表文献并不多。为了探究周氏吻虾虎鱼线粒体 DNA(mtDNA)的结构特征和系统发育信息,研究人员通过下一代测序技术获取了周氏吻虾虎鱼的 mtDNA。随后,运用生物信息学方法对 mtDNA 进行组装、注释和分析,并进行 mtDNA 比对和序列差异分析。研究人员利用从美国国立生物技术信息中心(NCBI,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ )下载的 48 种鲈形目(Gobiiformes )鱼类和 2 种鲤形目(Cypriniformes )鱼类的数据,对周氏吻虾虎鱼进行系统发育分析,并使用最大似然法和贝叶斯推断法构建系统发育树。分析结果显示:(1)经下一代测序,周氏吻虾虎鱼的 mtDNA 长度为 16,491bp,其线粒体结构包含 13 个蛋白质编码基因、22 个转运 RNA(tRNA)基因、2 个核糖体 RNA(rRNA)基因和 1 个非编码区;(2)从构建的系统发育树中可以看出,周氏吻虾虎鱼与双斑吻虾虎鱼(Rhinogobius duospilus)亲缘关系密切。这项研究将重新审视鲈形目主要谱系的系统发育树。
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