编辑推荐:
研究人员探究 YTHDC1 在结直肠癌中的作用,发现其调控 RAD51 泛素化影响细胞凋亡,为治疗提供新方向。
在生命的微观世界里,癌症一直是威胁人类健康的 “恶魔”,其中结直肠癌(colorectal cancer,CRC)更是让人谈之色变。随着对癌症研究的不断深入,科学家们发现,细胞内的各种分子机制如同精密的齿轮,相互协作又相互制约,共同维持着细胞的正常功能。一旦这些齿轮出现故障,就可能导致癌症的发生和发展。在众多与癌症相关的分子机制中,N
6- 甲基腺苷(m
6A)修饰这一表观遗传修饰引起了科学家们的广泛关注。m
6A 修饰在 RNA 的代谢过程中扮演着重要角色,它可以影响 RNA 的稳定性、翻译效率以及定位等。YTHDC1 作为 m
6A 相关调控网络中的关键蛋白,参与了染色质相关调控、RNA 剪接和核输出等多个细胞过程。然而,它在结直肠癌发展和 DNA 损伤修复中的作用却一直是个谜。为了揭开这个谜团,来自深圳北京大学 - 香港科技大学医学中心癌症研究所、北京大学深圳医院肿瘤科以及山西医科大学病理学系等机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Scientific Reports》上,为结直肠癌的治疗带来了新的希望。
研究人员在此次研究中运用了多种关键技术方法。通过分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,结合组织芯片免疫组化实验,探究 YTHDC1 在患者中的表达与预后关系;利用小干扰 RNA(siRNA)转染技术,在 HCT116 和 SW480 两种结直肠癌细胞系中敲低 YTHDC1,观察细胞变化;借助蛋白质免疫印迹(Western blot)实验,检测蛋白表达水平;运用 RNA 测序(RNA-seq)技术,分析基因转录水平变化;采用免疫共沉淀(co-IP)实验,验证蛋白间的相互作用;还通过体内动物实验,进一步验证研究结果 。
下面来看看具体的研究结果。
- YTHDC1 在结直肠癌中起促癌作用:研究人员分析 TCGA 数据库发现,YTHDC1 高表达的结直肠癌患者总生存率(Overall Survival,OS)和无复发生存率(Relapse-Free Survival,RFS)较低。对 80 例结直肠癌患者的组织芯片进行免疫组化分析后发现,YTHDC1 在高恶性组织中的表达明显高于低恶性组织,且浸润肿瘤组织中 YTHDC1 阳性细胞数量更多。这表明 YTHDC1 可能是结直肠癌的致癌因子。
- YTHDC1 缺失抑制结直肠癌细胞增殖并促进凋亡:研究人员使用 siRNA 在 HCT116 和 SW480 细胞中敲低 YTHDC1,CCK8 实验和单细胞集落形成实验结果显示,YTHDC1 敲低显著抑制了细胞的生长和集落形成。此外,通过对敲低 YTHDC1 的细胞进行 Annexin V 染色和流式细胞术分析,发现细胞凋亡明显增加。在体内实验中,将 YTHDC1 敲低的结直肠癌细胞皮下注射到免疫缺陷小鼠体内,结果显示肿瘤生长明显受阻。这些结果表明,YTHDC1 在促进结直肠癌细胞增殖和抑制细胞凋亡中起着关键作用。
- 敲低 YTHDC1 通过泛素 - 蛋白酶体途径下调 RAD51 蛋白表达:研究发现,敲低 YTHDC1 后,同源重组修复酶 RAD51 的水平显著降低。敲低 RAD51 也会抑制细胞增殖和单细胞集落形成,这与敲低 YTHDC1 后的表型一致,说明 RAD51 是 YTHDC1 的下游靶点。RNA 测序结果显示,敲低 YTHDC1 后,RAD51 的转录水平并未下降。进一步研究发现,敲低 YTHDC1 会增加 RAD51 的泛素化水平,这表明 YTHDC1 的缺失不影响 RAD51 转录,但会促进其泛素化水平增加。
- YTHDC1 负调控 UBE3A 表达,RAD51 是 UBE3A 的底物:由于 YTHDC1 本身不具有泛素化活性,研究人员推测存在一种未知的 E3 泛素连接酶受 YTHDC1 负调控,进而负责 RAD51 的泛素化。通过分析敲低 YTHDC1 后的 RNA 测序数据,发现泛素蛋白连接酶 UBE3A 的表达显著上调,Western blot 结果也证实了这一点。co-IP 实验表明 RAD51 与 UBE3A 相互作用,泛素化实验显示过表达 UBE3A 会导致 RAD51 的泛素化水平增加,这说明 RAD51 是 UBE3A 的泛素化底物之一。
研究人员提出了一个工作模型:当 YTHDC1 表达受到抑制时,UBE3A 水平会因 YTHDC1 的调控影响而增加,进而增强 RAD51 的泛素化,导致 RAD51 蛋白表达显著下降。这种下降会严重损害 DNA 复制和修复过程,最终引发癌细胞凋亡。
在讨论部分,研究人员指出,他们发现了 YTHDC1 - UBE3A - RAD51 这一在结直肠癌中的新调控轴。YTHDC1 对 UBE3A 的负调控及其对 RAD51 泛素化和细胞凋亡的影响是一种全新的机制,为理解 YTHDC1 在肿瘤发展,尤其是 DNA 修复相关过程中的作用提供了新视角。此外,研究还揭示了 UBE3A 在 RAD51 泛素化中的新功能,表明它可能是 DNA 损伤修复中重要且多功能的 E3 泛素蛋白连接酶。从治疗角度来看,由于 YTHDC1 高表达与预后不良相关且促进肿瘤细胞增殖,靶向 YTHDC1 可能是一种有前景的治疗策略。抑制 YTHDC1 表达可能会导致 UBE3A 上调,进而增加 RAD51 的泛素化和降解。已知 RAD51 在许多癌症中高表达,会使肿瘤细胞对放化疗产生抗性,而敲低 YTHDC1 可破坏肿瘤细胞的 DNA 修复能力,使其对化疗药物和放疗更敏感。因此,该研究为结直肠癌治疗提供了新的分子靶点和理论依据,有望推动更有效的治疗方法的开发 。