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为探究 EXO1 在多种癌症中的作用，研究人员开展泛癌分析，发现其可作生物标志物，有潜在治疗价值。
在全球范围内，癌症如同一场无情的 “健康风暴”，持续威胁着人类的生命。据预测，到 2050 年，新增癌症病例可能高达 3500 万。面对这一严峻挑战，传统的癌症治疗手段，如手术、放疗和化疗，遭遇诸多困境，像治疗耐药、肿瘤复发以及对新疗法反应不佳等问题层出不穷。因此，寻找新的治疗靶点和有效的生物标志物迫在眉睫。
人类外切核酸酶 1（EXO11）作为 DNA 修复和损伤反应通路中的关键 “成员”，对基因组稳定性和肿瘤演化意义重大。过往研究虽已揭示 EXO1 在某些癌症中的潜在作用，但缺乏全面的泛癌分析。西南医科大学附属医院等机构的研究人员敏锐地捕捉到这一研究空白，开展了一项极具意义的研究，相关成果发表于《Discover Oncology》。
在此次研究中，研究人员运用了多种关键技术方法。他们借助多个公共数据库，如癌症基因组图谱（TCGA）、基因型 - 组织表达（GTEx）数据库等获取数据；利用 R 软件及相关的 ggplot2、pROC 等软件包进行统计分析与数据可视化；通过构建蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络，挖掘 EXO1 相关基因的潜在联系；运用基因集富集分析（GSEA）探索 EXO1 参与的生物通路。
研究结果具体如下：
- EXO1 的表达与亚细胞定位：通过对人类蛋白质图谱（HPA）、TCGA 和 GTEx 数据集的分析，发现 EXO1 在胸腺、阑尾、睾丸和扁桃体等正常组织中表达较高。在多种癌症中，如肾上腺皮质癌（ACC）、乳腺癌（BRCA）等 27 种癌症，EXO1 表达显著上调，且在肿瘤组织中的表达高于配对的正常组织，其主要定位于细胞核。
- 诊断价值：借助 ROC 曲线评估，结果显示 EXO1 对 30 种癌症具有诊断价值，部分癌症的曲线下面积（AUC）超过 0.7，像胆管癌（CHOL）的 AUC 达到 1.000，这表明 EXO1 在癌症诊断方面潜力巨大。
- 预后价值：对 TCGA 的 RNA - seq 和临床数据进行单变量 Cox 比例风险回归分析，发现 EXO1 高表达与 ACC、BRCA 等多种癌症的不良预后显著相关。进一步对疾病特异性生存（DSS）分析，结果也支持这一结论，凸显了 EXO1 在预测癌症预后方面的重要性。
- 免疫和分子亚型分析：利用 TISIDB 数据库研究发现，EXO1 表达与多种癌症的免疫和分子亚型存在显著关联。例如在膀胱癌（BLCA）中，C2 免疫亚型的 EXO1 表达较高；在乳腺癌中，基底分子亚型的 EXO1 表达高于管腔亚型，这提示 EXO1 可能影响肿瘤的发生发展及治疗反应。
- 基因改变：通过 cBioPortal 数据库分析，发现 4% 的患者存在 EXO1 基因改变，不同癌症类型的改变模式各异。在肺癌（LUSC）中，EXO1 突变与无进展生存期改善相关；在肺腺癌（LUAD）中，则与疾病特异性生存期降低有关，体现了其对癌症预后的不同影响。
- 表观遗传改变：运用 UALCAN 数据库分析发现，多种癌症中 EXO1 的 DNA 启动子区域存在低甲基化现象。同时，EXO1 的 mRNA 表达与 m1A、m5C 和 m6A 等 mRNA 修饰相关的甲基转移酶呈正相关，表明其在癌症发生发展中的复杂调控机制。
- EXO1 相关基因富集分析：从 STRING 数据库筛选出 50 个与 EXO1 相关的基因构建 PPI 网络，确定了 10 个关键枢纽基因。GO 和 KEGG 富集分析表明，这些基因主要参与 DNA 重组、复制和修复等过程，同时 EXO1 还激活细胞凋亡和细胞周期等通路，抑制激素和 RAS/MAPK 等通路。
- 免疫基因组分析：利用 TISIDB 数据库研究发现，EXO1 与 30 种癌症中活化的 CD4+T 细胞和 Th2 细胞浸润水平呈正相关，与大多数其他免疫细胞类型呈负相关。此外，EXO1 与肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI）也存在显著相关性，在某些癌症中，如肾嫌色细胞癌（KICH），EXO1 与 TMB 呈强正相关，这意味着 EXO1 可能作为免疫治疗反应的预测生物标志物。
综合研究结论和讨论部分，此次研究全面且系统地揭示了 EXO1 在泛癌中的多面角色。它不仅在多种癌症中表达异常，还具有显著的诊断和预后价值，有望成为新的泛癌生物标志物。同时，EXO1 与肿瘤的免疫微环境密切相关，可能参与肿瘤的免疫逃逸和免疫激活过程，这为其作为潜在治疗靶点提供了理论依据。不过，研究也存在一定局限性，如数据库数据的差异可能影响结果的可比性，样本的代表性有限等。未来，还需通过更多的生物学研究，如体外和体内实验等，进一步验证和深入探索 EXO1 在癌症中的作用机制，为癌症的精准治疗开辟新的道路。
