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为解决 NSCLC 样本量受限问题,研究人员开展 RNA-NGS 技术检测研究,结果良好助力临床。
在肿瘤诊断、靶向治疗和免疫治疗中,与诊断相关的生物标志物数量不断增加,获取合适大小的临床病理样本进行分析成为难题。传统非小细胞肺癌(NSCLC)高通量测序检测通常需要分别提取 DNA 和 RNA 样本,以精确检测各种突变类型。本研究旨在利用 RNA 下一代测序(RNA-NGS)技术,同时检测 NSCLC 样本中的不同类型突变,包括单核苷酸变异、插入和缺失、融合 / 重排以及外显子跳跃,从而解决样本可获得性有限的问题。
研究人员回顾性纳入 220 例福尔马林固定石蜡包埋的 NSCLC 临床标本,基于探针杂交捕获原理进行靶向 RNA 测序。比较不同储存时间的肺癌组织样本在 DNA-NGS 和 RNA-NGS 检测中的成功率。通过将 RNA-NGS 结果与 DNA-NGS 及临床检测结果进行对比,评估 RNA-NGS 的临床检测性能。对结果不一致的样本,进一步采用免疫组化、扩增受阻突变系统 - 聚合酶链反应或微滴数字聚合酶链反应进行验证。
结果显示,DNA-NGS 在所有样本中的总体成功率为 91.82%,RNA-NGS 的总体成功率为 92.73%,但成功率会随样本储存时间延长而下降。与 DNA-NGS 相比,靶向 RNA 测序在单核苷酸变异 / 插入和缺失检测中的灵敏度为 93.75%,特异性为 100%,总体一致性为 97.86%。在融合 / 重排和 Met 外显子跳跃检测中,与验证结果相比,其灵敏度为 97.96%,特异性为 99.28%,总体一致性为 98.93%,优于 DNA-NGS。与临床检测相比,该检测的灵敏度为 93.33%,特异性为 100%,总体符合率为 97.93%。
综上所述,本研究证实基于探针杂交捕获的靶向 RNA 测序检测是一种卓越的药物靶向应用检测技术平台。它能在单样本检测流程中快速、可靠地提供当前 NSCLC 靶向治疗所需的所有生物标志物,有助于临床医生快速做出诊断并制定合理的治疗方案。