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研究人员通过宏基因组测序,探究珊瑚白化对古菌的影响,发现其显著改变古菌群落及代谢功能。
本研究致力于探究珊瑚白化(Coral bleaching)如何影响古菌(Archaea)的结构与功能。研究人员借助宏基因组测序分析(Metagenomic sequencing analysis),深入细致地研究了蜂巢珊瑚属(Favites sp.)珊瑚中,古菌的群落结构以及碳代谢通路。研究结果显示,珊瑚白化会显著降低古菌群落的多样性与丰度,其功能也会受到显著影响(p<0.05)。维恩图(Venn diagrams)和非度量多维缩放(NMDS,non-metric multidimensional scaling)分析表明,白化珊瑚中的古菌物种和酶的数量大幅减少,群落结构也发生了明显变化。主要的分类群包括奇古菌门(Thaumarchaeota)、广古菌门(Euryarchaeota)和候选门 Ca. 太阳古菌门(Candidatus Helarchaeota),在白化情况下,这些分类群均出现了显著变化。京都基因与基因组百科全书(KEGG,Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes )功能注释结果显示,白化珊瑚中的碳固定通路有所增强,而糖酵解、磷酸戊糖途径以及甲烷代谢的功能则有所减弱。在白化珊瑚内部,多条代谢通路中,部分优势酶的丰度有所增加,但大多数优势酶的丰度是下降的。这些研究发现凸显了珊瑚白化对古菌群落和代谢功能的重大影响,为理解珊瑚生态系统如何应对环境压力提供了全新的视角。