编辑推荐:
为探究物种功能性状种内差异,研究人员构建全球蚓螈性状数据库,助力多领域研究。
# 全球蚓螈形态特征数据库:解锁蚓螈研究的新钥匙
在神秘的两栖动物世界里,蚓螈(Caecilians)宛如一群隐藏在黑暗中的 “神秘客”。它们多数时间栖息在地下或森林落叶层中,独特的生活习性使得人类对它们的了解少之又少。在生物多样性研究的大拼图中,功能性状(Functional traits)是至关重要的一块。功能性状不仅决定了物种在生态系统中占据的生态位,还影响着物种对环境的适应能力。然而,目前多数动物数据库仅停留在物种层面,提供连续形态性状数据的更是凤毛麟角,这对于深入探究生物多样性、生态和进化关系形成了巨大阻碍。尤其是在全球气候变化和人类活动干扰加剧的当下,了解物种功能性状在个体水平的差异,对于预测物种的生存和适应能力变得极为迫切。
为了填补这些知识空白,兰州大学、西南大学、西南林业大学、安徽师范大学等研究机构的研究人员展开了一项极具意义的研究。他们构建了全球首个涵盖物种和个体水平的蚓螈形态性状数据库(CaecilianTraits),这一成果发表在《Scientific Data》上,为蚓螈研究乃至整个生物多样性研究领域带来了新的曙光。
在研究方法上,研究人员进行了大量细致且繁杂的工作。他们依据分类数据库,全面整理了所有蚓螈物种的文献资料。由于蚓螈物种存在诸多分类修订,同一物种可能有多个学名,给文献检索带来了极大困难,但研究人员通过综合参考《Amphibian Species of the World》和《AmphibiaWeb》等权威资料,成功克服了这一难题。对于每个物种,他们尽可能收集每一个标本的数据;若无法获取单个标本数据,则记录性状的平均值和标准差。同时,他们还整合了物种层面的形态、生态和生活史数据,涵盖栖息地、繁殖方式等多方面信息,为后续研究提供了丰富的数据基础。
数据记录与成果
该数据库成果斐然,涵盖了全球已知 222 种蚓螈中的 218 种,其中 215 种有个体水平数据。在个体水平数据集里,共记录了 1523 条数据条目,涉及 215 个物种的 1482 条个体数据、6 个物种的 35 条种群数据以及 4 个物种的 6 条物种数据。个体水平数据的平均完整性为 26.11%,部分性状如总长度的覆盖率高达 99.3%。在物种水平数据集方面,栖息地信息的完整性最高,达到 96%,但繁殖模式和幼虫是否依赖水等信息的完整性相对较低。
技术验证保障数据质量
为确保数据库的准确性,研究人员采用了两种策略。一方面,运用箱线图(boxplots)或频率直方图等方法,对数据进行可视化检测,能快速识别如小数点错位等潜在错误;另一方面,随机抽取 10% 的物种,重新核对原始资料,进一步保障了数据的可靠性。
研究结论与意义非凡
这一全球蚓螈形态性状数据库的建立意义重大。从生态研究角度看,它为探究蚓螈的生态位和种内生态差异提供了有力的数据支持,有助于深入理解蚓螈在生态系统中的角色和功能。在进化生物学领域,通过分析个体水平的性状差异,能够更好地揭示蚓螈的进化历程和适应机制。对于保护生物学而言,该数据库可助力预测蚓螈面临的潜在威胁,为制定科学合理的保护策略提供依据。在分类学方面,也为蚓螈新物种的发现和分类修订提供了丰富的参考资料。
总体而言,这一研究成果打破了蚓螈研究的数据瓶颈,为多个相关领域的深入研究搭建了坚实的数据平台。随着未来研究的不断深入,借助这一数据库,科研人员有望解锁更多关于蚓螈的奥秘,在生物多样性保护和生态系统研究等方面取得更多突破,为地球生物多样性的保护和可持续发展贡献重要力量。
闂佺懓鐏氶幑浣虹矈閿燂拷
婵炴垶鎸搁鍫澝归崶鈹惧亾閻熼偊妲圭€规挸瀛╃€靛ジ鏁傞悙顒佹瘎闁诲孩绋掗崝鎺楀礉閻旂厧违濠电姴娲犻崑鎾愁潩瀹曞洨鐣虹紓鍌欑濡粓宕曢鍛浄闁挎繂鐗撳Ο瀣煙濞茶骞橀柕鍥ㄥ哺瀵剟骞嶉鐣屾殸闂佽偐鐡旈崹铏櫠閸ф顥堥柛鎾茬娴狀垶鏌曢崱妤婂剱閻㈩垱澹嗗Σ鎰板閻欌偓濞层倕霉閿濆棙绀嬮柍褜鍓氭穱铏规崲閸愨晝顩烽柨婵嗙墦濡鏌涢幒鎴烆棡闁诲氦濮ょ粚閬嶅礃椤撶姷顔掗梺璇″枔閸斿骸鈻撻幋锔藉殥妞ゆ牗绮岄埛鏍煕濞嗘劕鐏╂鐐叉喘閹秹寮崒妤佹櫃
10x Genomics闂佸搫鍊瑰姗€骞栭—娓媠ium HD 閻庢鍠掗崑鎾绘煕濮樼厧鐏犵€规洜鍠撶槐鎺楀幢濮橆剙濮冮梺鍛婂笒濡粍銇旈幖浣瑰仢闁搞儮鏅滈悾閬嶆煕韫囧濮€婵炴潙妫滈妵鎰板即閻樼數鐓佺紓浣告湰濡炶棄螞閸ф绀嗛柛鈩冡缚閳ь兛绮欓弫宥夋晸閿燂拷
濠电偛妫庨崹鑲╂崲鐎n偆鈻旈悗锝庡幗缁佺櫉wist闂侀潧妫楅敃锝囩箔婢舵劕妫樻い鎾跺仜缂嶄線鏌涢弽銊у⒈婵炲牊鍘ISPR缂備焦绋掗惄顖炲焵椤掆偓椤︿即鎮ч崫銉ゆ勃闁逞屽墴婵″鈧綆鍓氶弳鈺呮倵濞戞瑥濮冮柛鏃撴嫹
闂佸憡顨嗗ú婊呭垝韫囨稒鍤勯柣鎰嚟閵堟挳骞栭弶鎴犵闁告瑥妫濆濠氬Ω閵夛絼娴烽柣鐘辩劍瑜板啴鎮ラ敓锟� - 濠电儑绲藉畷顒勫矗閸℃ḿ顩查柛鈩冾嚧閹烘挾顩烽幖杈剧秵閸庢垵鈽夐幘顖氫壕婵炴垶鎼╂禍婊冪暦閻旇櫣纾奸柛鈩冭壘閸旀帡鎮楅崷顓炰槐闁绘稒鐟ч幏瀣箲閹伴潧鎮侀梺鍛婂笧婢ф寮抽悢鐓庣妞ゆ柨鐏濈粣娑㈡煙鐠ㄥ鍊婚悷銏ゆ煕濞嗘ê鐏ユい顐㈩儔瀹曠娀寮介顐e浮瀵悂鏁撻敓锟�
婵炴垶鎸搁鍫澝归崶顒€违濠电姴瀚惌搴ㄦ煠瀹曞洤浠滈柛鐐存尦閹藉倻鈧綆鍓氶銈夋偣閹扳晛濡虹紒銊у閹峰懎饪伴崘銊р偓濠氭煛鐎n偄濮堥柡宀€鍠庨埢鏃堝即閻樿櫕姣勯柣搴㈢⊕閸旀帡宕濋悢鐓幬ラ柨鐕傛嫹