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为治疗遗传性血管性水肿(HAE),研究人员通过噬菌体展示筛选 AATM358R变体,发现 7-FLEPS-3 对血浆激肽释放酶(Pka)抑制更优。
遗传性血管性水肿(Hereditary Angioedema,HAE)是一种令人困扰的常染色体显性遗传病,患者会反复出现急性肿胀,严重影响生活质量。HAE 主要分为三种类型,其中大部分与 C1 - 酯酶抑制剂(C1INH)的缺陷有关。C1INH 作为一种丝氨酸蛋白酶抑制剂(serpin),在调节补体、凝血和炎症途径中起着关键作用,它能够抑制多种蛋白酶,尤其是活化的血浆激肽释放酶(Plasma kallikrein,Pka)。Pka 就像一个 “小恶魔”,它能催化高分子量激肽原的裂解,释放出缓激肽,而缓激肽会导致血管扩张和通透性增加,引发炎症反应。
目前,虽然 C1INH 浓缩物替代疗法是治疗 HAE 的一种有效手段,但 C1INH 存在明显的局限性。它对多种蛋白酶的广谱抑制作用,使得其在抑制 Pka 时不够精准,而且抑制速度相对较慢,平均二级速率常数(k2?)仅约为 2.55×104M?1s?1 。此外,现有的用于控制 Pka 的药物也存在各种问题,有些药物半衰期短,不适合预防性给药;而新的预防性药物成本又很高。
在这样的背景下,来自加拿大麦克马斯特大学(McMaster University)和加拿大血液服务中心(Canadian Blood Services)的研究人员决心探索新的治疗方法。他们将目光聚焦在 α-1 抗胰蛋白酶(Alpha-1 Antitrypsin,AAT)上。AAT 是血浆中含量最丰富的 serpin,正常情况下主要抑制中性粒细胞弹性蛋白酶,但当 AAT 的反应中心环(Reactive center loop,RCL)的 P1 位置发生 M358R 突变后,它的抑制目标就会发生改变,开始抑制多种凝血和接触系统蛋白酶,包括 Pka。
研究人员开展了一系列研究,旨在提高 AATM358R对 Pka 的特异性,使其成为治疗 HAE 的潜在新型治疗剂。相关研究成果发表在《BMC Biotechnology》上。
为了实现这一目标,研究人员运用了多种关键技术方法。首先是噬菌体展示技术(phage display),他们构建了两个 AATM358R的噬菌体展示文库,分别在 RCL 的 P7 - P3 和 P2 - P3' 位置进行随机化,然后用 Pka 对文库进行迭代筛选。接着,对筛选出的变体进行表达、纯化和动力学表征,通过测定抑制 Pka 和凝血因子 XIa(FXIa)的二级速率常数(k2?)以及抑制化学计量(Stoichiometry of inhibition,SI)来评估变体的性能。此外,还利用了蛋白质建模技术,借助 PyMOL Molecular Graphics System 2.5 和 ClusPro 2.0 对 AATM358R变体与 Pka/FXIa 的相互作用进行建模分析。
研究结果如下:
- 噬菌体展示筛选及变体表征:经过五轮生物淘选,确定了最丰富的 Pka 抑制基序。P7 - P3 位置的基序为 QLIPS,P2 - P3' 位置的基序为 VRRAY。表达并纯化了携带这些基序的 AAT 变体,如 7 - QLIPS - 3 和 2 - VRRAY - 3'。对这些变体的动力学分析表明,7 - QLIPS - 3 对 Pka 的抑制速度比 AATM358R快 2.2 倍,且选择性提高了 9.2 倍;2 - VRRAY - 3' 虽然抑制 Pka 的速度较慢,但选择性也有所增加。
- 回复突变及组合突变研究:对 7 - QLIPS - 3 和 2 - VRRAY - 3' 进行回复突变,产生了多个回复突变体,并构建了组合变体 7 - QLIPSVRRAY - 3'。研究发现,7 - QLIPS - 3 的回复突变体中,7 - FLEPS - 3 对 Pka 的抑制效果最佳,其抑制速度比 AATM358R快 4.5 倍,选择性提高了 9.2 倍,且 SI 没有显著增加。而组合变体 7 - QLIPSVRRAY - 3' 在抑制 Pka 和 FXIa 方面表现不佳,未进一步研究。
- 分子建模分析:通过分子建模,研究人员发现 AATM358R变体与 Pka/FXIa 相互作用时,RCL 与蛋白酶之间的距离与抑制活性相关。例如,7 - FLEPS - 3 与 Pka 的距离缩短,抑制速度加快;而 2 - VRRAY - 3' 及部分回复突变体与 Pka/FXIa 的距离增加,抑制速度减慢。
研究结论和讨论部分指出,7 - FLEPS - 3 作为 AATM358R的变体,具有成为治疗 HAE 的潜在药物的潜力。它对 Pka 的抑制速度比现有治疗药物 C1INH 快得多,为 HAE 的治疗提供了新的希望。然而,研究也发现,噬菌体展示筛选出的 RCL 基序在实际应用中存在一些不确定性,如在噬菌体表面和可溶性蛋白环境中的行为差异等。此外,虽然分子建模为理解变体的抑制活性提供了一定的依据,但仍存在局限性。
总的来说,这项研究通过噬菌体展示和部分回复突变技术,成功筛选出对 Pka 具有更高特异性和抑制活性的 AATM358R变体,为 HAE 的治疗开辟了新的方向,有望为患者带来更有效的治疗方案。
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