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为探究低 pH 如何诱导 Prdx6 形成寡聚体,研究人员对 Asp42 和 His79 进行定点突变,发现其影响 aiPLA2 活性和寡聚化,对理解 Prdx6 功能意义重大。
在细胞的 “小宇宙” 里,有一群被称为过氧化物还原酶(Prdx)的 “抗氧化卫士”,它们奋力清除活性氧物种(ROS),保护细胞免受氧化应激的侵害。Prdx 家族包含多种成员,其中 Prdx6 是个 “多面手”,它不仅在 pH 7.4 时具有谷胱甘肽过氧化物酶(GSH peroxidase)活性,还能在 pH 4.0 时展现出非依赖钙的磷脂酶 A
2 (aiPLA
2 )活性。
然而,就像神秘的宝藏被迷雾笼罩,pH 究竟如何调控 Prdx6 的这些功能,一直是个未解之谜。尤其是在低 pH 环境下,Prdx6 是怎样从单体 “变身” 为更高阶的寡聚体,进而获得 aiPLA2 活性的,科学界对此知之甚少。为了揭开这层神秘的面纱,来自曼 ipur 大学(Manipur University)生物技术系等多个研究机构的研究人员踏上了探索之旅,相关研究成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员巧妙地运用定点突变技术,对 Prdx6 中两个保守的氨基酸残基 —— 天冬氨酸 42(Asp42)和组氨酸 79(His79)进行改造,将它们分别突变为丙氨酸(Ala),从而深入探究这两个氨基酸在 Prdx6 功能调控中的关键作用。
在研究过程中,他们运用了多种先进的技术方法。通过动态光散射(DLS)测量蛋白质的流体动力学直径,以此来分析蛋白质的寡聚状态;利用尺寸排阻色谱(SEC)分离不同大小的蛋白质分子,进一步确定蛋白质的寡聚形式;采用圆二色谱(CD)研究蛋白质的二级结构变化;借助荧光光谱技术,如色氨酸荧光和 ANS 荧光测量,来探测蛋白质局部环境的变化 。
研究结果令人眼前一亮。在酶活性方面,突变后的 Prdx6(D42A 和 H79A)在 pH 7.4 时仍具有过氧化物酶活性,但在 pH 4.0 时,aiPLA2 活性却显著下降。这表明 Asp42 和 His79 对于 Prdx6 在低 pH 下发挥 aiPLA2 功能至关重要。
从蛋白质的寡聚状态来看,野生型(Wt)Prdx6 在 pH 7.4 时以二聚体形式存在,当环境 pH 降至 4.0 时,它会形成更高阶的寡聚体。然而,突变体 Prdx6 在 pH 7.4 和 4.0 时都保持二聚体状态,不受 pH 变化的影响。这充分说明 Asp42 和 His79 在 Prdx6 响应 pH 变化进行寡聚化的过程中扮演着不可或缺的角色。
在热力学稳定性上,野生型 Prdx6 在低 pH 下表现出高度的稳定性,难以发生热变性。而突变体蛋白在低 pH 下却能发生完全的热转变,且其解链温度(Tm )与野生型在 pH 7.4 时相近。这暗示着由 Asp42 和 His79 形成的静电相互作用可能是野生型 Prdx6 在低 pH 下获得热耐受性的关键因素。
从结构研究的角度,在中性 pH 条件下,突变体蛋白与野生型 Prdx6 的二级结构差异并不明显,但突变体中色氨酸(Trp)残基的微环境发生了改变,这影响了蛋白质的局部结构。在低 pH 环境下,突变体蛋白的二级结构内容发生了显著变化,α- 螺旋含量降低,且不存在溶剂暴露的疏水簇,无法与 ANS 结合。而野生型 Prdx6 在低 pH 时能与 ANS 大量结合,表明其存在大量溶剂暴露的疏水基团,这些疏水基团的暴露可能有助于蛋白质的寡聚化。
综合研究结论与讨论部分,研究人员证实了 Asp42 和 His79 之间形成的静电相互作用,不仅是 Prdx6 获得 aiPLA2 功能的关键,还在低 pH 下帮助 Prdx6 形成寡聚体、获得热耐受性的过程中发挥着重要作用。从结构层面来看,这种静电相互作用引发了蛋白质结构的重排,使得疏水基团暴露,促进了疏水接触的形成,最终推动了蛋白质的寡聚化。
这项研究为我们深入理解 Prdx6 的功能调控机制提供了新的视角,犹如在黑暗中点亮了一盏明灯,照亮了我们对蛋白质在不同 pH 环境下功能变化的认知之路,对后续相关领域的研究具有重要的指导意义,也为探索更多蛋白质的奥秘奠定了坚实的基础。
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