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为探究 Luminal B 型乳腺癌（LBBC），研究人员分析其磷酸化蛋白组和代谢组，发现关键通路和代谢调控，助力研究。
乳腺癌是一种具有 4 种主要分子亚型的异质性肿瘤。激素受体（HR）阳性且 HER2 阴性的乳腺癌占浸润性乳腺癌的 70%。在该项研究中，研究人员收集了 15 例原发性 Luminal B 型乳腺癌组织（LBBC）及其配对的癌旁正常组织（NATs），并进行了基于液相色谱 - 串联质谱（LC-MS/MS）的非标记定量磷酸化蛋白质组学分析。同时，利用非靶向代谢组学分析来确定 LBBC 和 NATs 之间的代谢模式差异。此外，还对磷酸化蛋白质组学和代谢组学数据进行整合分析，以探究调控代谢通路，并通过蛋白质免疫印迹法（western blot）验证主要的调控蛋白。
磷酸化蛋白质组学分析在 785 种蛋白质中鉴定出 1385 个差异磷酸化位点。蛋白激酶 A（PKA）、蛋白激酶 C（PKC）家族以及 p70 核糖体 S6 激酶（RPS6K）在 LBBC 中被强烈激活，而细胞周期蛋白依赖性激酶（CDKs）则受到显著抑制。磷脂酰肌醇 3 - 激酶 - 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物 1（PI3K-mTORC）和 Hippo 信号通路在癌症中特异性激活也备受关注。
代谢组学分析显示，有 223 种代谢物显著差异积累，包括脂肪酸（3 - 羟基癸酸、十二烷酸、亚油酸、硬脂酸）、甘油磷脂、甘油磷脂酰胆碱和鞘脂等，这些代谢物主要参与脂肪酸氧化代谢、鞘脂代谢、嘌呤代谢和氨基酸代谢途径。经过整合分析发现，鞘脂代谢途径发挥主要调控作用。研究人员还分别对 PI3K-mTORC 通路、Hippo 信号通路和鞘脂代谢途径中的 3 种磷酸化蛋白（p-YAP、p-SGK1 和 p-SGPP2）进行了验证。
该研究首次提供了 LBBC 的磷酸化蛋白质组和代谢组整合图谱，主要涉及由 PI3K-mTORC 和 Hippo 信号通路介导的鞘脂稳态失调。这项研究描述了两条磷酸化通路和鞘脂代谢调控模块，有助于更好地理解 LBBC 的致癌机制和治疗方法。
