Epstein-Barr 病毒如何 “操纵” 组蛋白修饰促进上皮恶性肿瘤进展?关键因子 KDM5B 揭示重要机制

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:Signal Transduction and Targeted Therapy

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  为探究 EBV 致上皮肿瘤机制,研究人员聚焦 KDM5B,发现其被 EBV 上调促肿瘤,为治疗提供新策略。

  Epstein-Barr 病毒(EBV),这个在全球超 90% 人口体内 “潜伏” 的人类疱疹病毒,一直以来都是科学界重点关注的对象。它与多种恶性肿瘤的发生密切相关,尤其是上皮起源的鼻咽癌(NPC)和胃癌(GC),这两种癌症占 EBV 相关恶性肿瘤的约 80%。尽管人们早已知道 EBV 与这些癌症有关,但 EBV 究竟是如何驱动癌症发展的,特别是它引发的组蛋白修饰相关机制,却如同迷雾一般,让科研人员困惑不已。
组蛋白修饰在癌症的发生和发展过程中起着关键作用,它就像一把 “分子开关”,通过对染色质结构和基因转录的调控,影响着细胞的各种行为。EBV 感染会引起组蛋白修饰的改变,然而,在 EBV 相关的上皮肿瘤中,具体涉及哪些组蛋白修饰因子以及它们的致癌机制,依旧是未解之谜。

为了揭开这些谜团,中山大学肿瘤防治中心的研究人员开展了一项深入的研究。他们的研究成果发表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》杂志上,为我们理解 EBV 相关上皮肿瘤的发病机制带来了新的曙光。

在这项研究中,研究人员运用了多种关键技术方法。他们整合分析了 NPC 活检样本的单细胞转录组数据以及 EBV 感染细胞模型的批量 RNA 测序数据,以此来筛选相关因子。同时,通过构建体外 EBV 感染模型,对细胞进行感染和处理。另外,免疫组化(IHC)、蛋白质免疫印迹(Western blot)、实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、荧光素酶报告基因检测等实验技术也被广泛应用,用于检测蛋白表达、基因转录活性等指标。在动物实验方面,研究人员建立了体内小鼠异种移植模型,以探究相关基因和蛋白在体内的功能。此外,还进行了染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)和染色质免疫沉淀定量聚合酶链反应(ChIP-qPCR)分析,来研究蛋白与 DNA 的相互作用以及组蛋白修饰情况。

下面来具体看看研究结果。

  1. KDM5B 是 EBV 诱导上皮肿瘤进展的关键表观遗传因子:研究人员分析了 10 个 NPC 组织中 EBVhigh和 EBVlow恶性上皮细胞的单细胞转录组数据,结合体外 EBV 感染模型的转录组测序分析,发现赖氨酸去甲基化酶 5B(KDM5B)在 EBV 感染后显著上调。通过 Western blot 分析进一步证实,在 EBV 阳性的 NPC 和 GC 细胞系中,KDM5B 蛋白水平明显增加。免疫组化染色实验表明,KDM5B 高表达与 NPC 患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)缩短以及转移相关,这意味着 KDM5B 在 EBV 诱导的上皮肿瘤进展中起着重要作用。
  2. EBNA1 与 CEBPB 协同促进 KDM5B 转录:考虑到 EBV 在相关上皮肿瘤中的潜伏特性,研究人员探究了 EBV 感染对 KDM5B 表达的影响。通过分析 NPC 肿瘤活检样本的转录组数据,发现 KDM5B 与 EBV 核抗原 1(EBNA1)呈正相关。进一步实验表明,EBNA1 过表达能显著增加 KDM5B 的表达,而 EBNA1 敲低则导致 KDM5B 表达下降。研究人员通过多种实验手段发现,EBNA1 通过与转录因子 CEBPB 相互作用,间接促进 KDM5B 转录,且这种调节作用依赖于 EBV 的存在。
  3. BZLF1 直接激活 KDM5B 转录:鉴于 EBV 裂解周期在肿瘤进展中的作用,研究人员研究了 EBV 裂解复制过程中 KDM5B 的激活情况。用佛波酯 12 - 肉豆蔻酸 13 - 乙酸酯(TPA)和丁酸钠(NaB)诱导 EBV 阳性细胞系的裂解再激活,发现 KDM5B 表达显著上调,且这种上调与早期裂解基因的激活相关,独立于 DNA 复制阶段。研究还发现,立即早期裂解基因 BZLF1 能直接结合到 KDM5B 启动子上的 Zta 反应元件(ZREs),激活 KDM5B 转录,并且 EBNA1 和 BZLF1 对 KDM5B 的转录激活作用相互独立。
  4. KDM5B 在 EBV 相关上皮肿瘤中发挥致癌作用:为了探究 KDM5B 在 EBV 相关上皮肿瘤中的功能,研究人员进行了一系列实验。在体外,通过 shRNA 介导的 KDM5B 敲低实验表明,KDM5B 敲低会抑制 EBV 阳性 NPC 和 GC 细胞的增殖、集落形成和球体形成能力,而过表达 KDM5B 则会增强这些能力。在体内,小鼠异种移植模型实验显示,KDM5B 敲低的细胞形成的异种移植瘤生长明显减缓,而过表达 KDM5B 的细胞形成的肿瘤则具有更强的致瘤能力,这充分证明了 KDM5B 在促进 EBV 阳性上皮肿瘤进展中的关键致癌作用。
  5. KDM5B 通过 H3K4me3去甲基化抑制 PLK2 表达:为了深入了解 KDM5B 促进肿瘤进展的分子机制,研究人员进行了 ChIP-seq 分析,发现 KDM5B 在全基因组启动子区域广泛存在。通过转录组分析和一系列验证实验,确定了丝氨酸 / 苏氨酸蛋白激酶 2(PLK2)是 KDM5B 的主要靶基因。KDM5B 通过降低 PLK2 启动子区域的 H3K4me3修饰水平,下调 PLK2 表达,进而影响肿瘤的发展。
  6. KDM5B 通过抑制 PLK2 促进 EBV 相关上皮肿瘤进展:研究人员发现,PLK2 在 EBV 相关癌症中发挥肿瘤抑制作用,其过表达能抑制 NPC 和 GC 细胞的生长和集落形成,而敲低则会促进这些过程。同时,PLK2 能显著削弱 KDM5B 过表达导致的细胞增殖和致瘤能力增强,并且 KDM5B 对 PLK2 的调节依赖于 EBV 的存在。体内实验也证实,PLK2 过表达能抑制因 KDM5B 过表达而促进的肿瘤生长,这表明 KDM5B 可能通过抑制 PLK2 来促进 EBV 相关上皮肿瘤的进展。
  7. KDM5B/PLK2 轴介导 EBV 诱导的 PI3K/AKT/mTOR 通路激活:由于 PI3K/AKT/mTOR 信号通路在 EBV 相关上皮癌症的进展中起着关键作用,研究人员探究了 KDM5B 和 PLK2 对该通路的影响。Western blot 分析表明,EBV 感染导致 KDM5B 上调和 PLK2 下调,同时激活 PI3K/AKT/mTOR 通路。KDM5B 敲低会抑制该通路的激活,而 KDM5B 过表达则会激活该通路,PLK2 过表达能减弱 KDM5B 过表达对该通路的激活作用,这说明 EBV 诱导的 KDM5B 上调通过抑制 PLK2 来促进 PI3K/AKT/mTOR 信号通路的激活。
  8. 抑制 KDM5B 可减缓 EBV 阳性肿瘤细胞的进展:鉴于 KDM5B 在肿瘤发生中的作用,研究人员使用 KDM5B 小分子抑制剂 AS-8351 处理 EBV 阳性上皮肿瘤细胞。实验结果显示,AS-8351 能显著抑制肿瘤细胞的增殖、集落形成和球体形成能力,且在体内实验中,能有效抑制 NPC 患者来源的异种移植瘤(PDX)和 AGS-EBV 细胞形成的肿瘤生长,同时上调 H3K4me3和 PLK2 的表达,抑制 PI3K/AKT/mTOR 通路,这表明抑制 KDM5B 是治疗 EBV 相关上皮肿瘤的一种有前景的策略。

综上所述,研究人员通过一系列实验,首次揭示了 EBV 在潜伏期和裂解期均能通过劫持宿主的组蛋白修饰机制,分别由 EBNA1 和 BZLF1 介导,上调 KDM5B 的表达。KDM5B 通过对 H3K4me3去甲基化抑制肿瘤抑制基因 PLK2 的表达,从而激活 PI3K/AKT/mTOR 通路,促进肿瘤进展。这项研究为我们深入理解 EBV 相关上皮肿瘤的发病机制提供了新的视角,也为开发针对 EBV 相关癌症的治疗策略提供了潜在的靶点,具有重要的理论和临床意义。虽然研究存在一定局限性,如可能存在其他下游因子参与 KDM5B 诱导的肿瘤进展,还有其他组蛋白修饰酶的作用有待探索,但这并不影响该研究成果的重要价值,为后续的研究指明了方向。
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