形态学与分子方法双剑合璧:全面解析丛枝菌根真菌(AMF)群落

【字体: 时间:2025年03月11日 来源:Mycorrhiza 3.3

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  为探究形态学和分子方法对 AMF 群落分析的效果,研究得出需结合两种方法全面解析,且比较时模式可比。

  传统上,土壤中丛枝菌根真菌(Arbuscular Mycorrhizal Fungi,AMF)群落的特征描述和比较是通过对土壤中的无性孢子进行形态学鉴定来完成的。在近几十年里,像土壤宏条形码(soil metabarcoding)这样的分子方法比孢子的形态学鉴定更受欢迎,但对这两种方法效率的直接比较却很少见。在这项研究中,研究人员使用形态学和分子方法(内转录间隔区,ITS,标记)对来自蔬菜农场的土壤样本中的 AMF 群落进行了比较。此外,研究人员还进行了系统的文献检索,找到了 9 项在相同土壤样本(主要是在农业生态系统中)中使用这两种方法分析 AMF 群落的研究。研究结果表明,通过基于形态学孢子鉴定确定的 AMF 群落与通过分子遗传标记确定的有所不同,但并不像人们常说的那么频繁。在某些情况下,基于形态学孢子的特征描述揭示出更具多样性的球囊菌(glomeromycotan)群落。而且,在一些情况下,基于孢子的方法能检测到分子方法未检测到的分类群,而在另一些情况下则观察到相反的结果。这项研究基于实地和文献的结果表明,为了全面详尽地描述 AMF 群落,有必要将这两种方法结合起来。然而,如果目的是比较不同环境条件下的群落,这两种方法提供的模式具有可比性。

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