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为解决班巴拉花生遗传改良难题,研究人员用 4399 个 SNP 标记研究其遗传多样性等,成果意义重大。
班巴拉花生(Bambara groundnut)是一种原产于非洲的耐旱豆类作物。在肯尼亚,这种作物由女性种植,但其种植品种的多样性尚不明确。由于缺乏关于该作物多样性和种群结构的信息,其遗传改良工作面临困难。本研究旨在:(i)利用 4399 个单核苷酸多态性(SNP)标记,确定来自肯尼亚的 86 个班巴拉花生品种的遗传多样性和种群结构;(ii)识别与班巴拉花生种子重量相关的 SNP 标记。研究采用了多样性阵列技术(DArT)复杂度降低方法结合 Illumina 短读长测序(HiSeq 2000)。种群结构分析表明存在三个遗传簇。除了来自基利菲(Kilifi)的品种明显归为同一簇外,来自同一县的品种被分到了不同的簇。分子方差分析显示,0.16% 的变异是由种群间的遗传分化造成的,19% 的变异源于种群内个体间的差异,81% 的变异存在于种群内个体中。研究发现,分布在班巴拉花生重叠群 1、2、3 和 5 上的由 DArTseq 衍生的 SNP 标记(
p?!--?0.05)与百粒重显著相关,不过这些已识别的 SNP 标记尚未经过验证。本研究为了解肯尼亚传统种植区班巴拉花生的遗传多样性提供了重要依据,这些发现可作为进一步验证和应用于班巴拉花生育种计划的起点。
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