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研究人员针对阿尔茨海默病(AD),研究积雪草化合物对 BACE-1 的作用,发现其或可成 AD 新疗法。
阿尔茨海默病治疗困境与新探索
在全球范围内,阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)正成为日益严峻的健康挑战。这种复杂的神经退行性疾病,无情地侵蚀着患者的认知和记忆能力,不仅给患者带来身心痛苦,也让无数家庭背负沉重负担。AD 的主要病理特征是大脑中出现大量 Aβ 斑块和神经纤维缠结,它们如同大脑中的 “毒瘤”,不断破坏神经元和突触,导致大脑萎缩,功能衰退。
目前,AD 的治疗面临诸多困境。尽管科研人员付出了巨大努力,但仍没有一款药物能够真正阻止疾病的进展。在众多治疗靶点中,β- 分泌酶 1(beta site cleaving enzyme-1,BACE-1)因其在 Aβ 生成过程中的关键作用,成为治疗 AD 的热门靶点。然而,此前开发的一些 BACE-1 抑制剂,如 Verubecestat、Lanabecestat 等,在临床试验中纷纷折戟,因严重的副作用和毒性,无法顺利进入临床应用,这让 AD 的治疗陷入僵局。
在此背景下,来自韩国东国大学(Dongguk University)的研究人员另辟蹊径,将目光投向了传统药用植物积雪草(Centella asiatica,CA)。积雪草在传统医学中应用广泛,具有多种药用功效,其在改善认知方面的作用尤其引人关注。研究人员推测,积雪草中或许蕴含着能够调节 BACE-1 活性的成分,有望为 AD 治疗带来新的曙光。他们的研究成果发表在《Heliyon》杂志上,为 AD 治疗领域注入了新的活力。
研究方法:多技术探寻潜在药物
为了寻找积雪草中潜在的 BACE-1 调节剂,研究人员运用了一系列先进的技术手段。首先,他们通过文献查阅和 IMPPAT 数据库收集了 165 种 CA 化合物。随后,利用 Schr?dinger 套件中的 LigPrep 模块对这些化合物进行处理,将其转化为三维结构,并进行能量优化。
接着,研究人员借助 QIKProp 模块开展吸收、分布、代谢和排泄(ADME)分析,评估化合物的药代动力学特性,筛选出具有良好药物特性且能穿越血脑屏障的化合物。这一步至关重要,因为只有能够进入大脑的药物,才有可能对 AD 发挥治疗作用。
在筛选潜在调节剂时,研究人员采用了分子对接技术。他们运用标准精度(SP)和额外精度(XP)对接方法,对经过 ADME 筛选的化合物进行虚拟筛选,寻找与 BACE-1 具有高结合亲和力的分子。之后,通过 MM-GBSA 计算确定化合物的实际结合自由能,进一步筛选出最具潜力的化合物。
为了更精确地研究配体与受体的结合模式,研究人员对筛选出的化合物进行诱导契合对接(IFD)。最后,利用分子动力学(MD)模拟,在微秒时间尺度上观察蛋白质 - 配体复合物的稳定性和构象变化,并通过主成分分析(PCA)和动态交叉相关图分析(DCCM)等方法深入研究蛋白质的动态行为。
研究结果:积雪草化合物展现潜力
- BACE-1 的结构特征与药物相似性预测:BACE-1 是一种跨膜蛋白,包含多个功能区域,其活性位点的结构和功能对 Aβ 的生成至关重要。ADME 分析显示,约 64.84% 的 CA 化合物具有药物样特性,且能穿越血脑屏障,这为后续研究提供了良好的基础。
- 筛选潜在的 BACE-1 调节剂:通过分子对接和 MM-GBSA 计算,研究人员从众多 CA 化合物中筛选出了具有高结合亲和力的分子,杨梅素(myricetin)、槲皮素(quercetin)和维地利宁(vedelianin)脱颖而出,它们的结合能甚至超过了对照化合物 Verubecestat。
- 结合模式与稳定性分析:IFD 分析详细揭示了这些化合物与 BACE-1 的结合模式。它们与 BACE-1 的关键催化残基 Asp93和 Asp289形成了稳定的相互作用,包括氢键和疏水相互作用。MD 模拟结果显示,在 1 微秒的模拟时间内,杨梅素和维地利宁与 BACE-1 结合后,蛋白构象变化较小,稳定性较高;槲皮素虽然在模拟前期波动较大,但后期也能保持稳定。
- 蛋白质 - 配体相互作用与动态分析:进一步的分析表明,这些化合物与 BACE-1 的相互作用涉及多种氨基酸残基。PCA 和 DCCM 分析显示,维地利宁和槲皮素能使 BACE-1 结构更稳定,构象变化更小,这意味着它们在调节 BACE-1 活性方面具有潜在优势。
研究结论与意义:开启 AD 治疗新方向
综合上述研究结果,研究人员得出结论:积雪草中的杨梅素、槲皮素和维地利宁具有调节 BACE-1 活性的潜力,它们能够与 BACE-1 稳定结合,且对蛋白构象影响较小。这一发现为 AD 治疗提供了新的潜在药物靶点和治疗策略。
此前,虽然有研究表明某些天然化合物对 AD 有一定作用,但对于积雪草中这些化合物与 BACE-1 的结合机制和相互作用了解甚少。本研究首次深入揭示了它们之间的关系,为后续开发基于这些化合物的 AD 治疗药物奠定了理论基础。
不过,研究人员也指出,目前的研究仅在计算机模拟和体外实验层面进行,这些化合物在体内的效果、安全性和选择性仍需进一步的体内和体外实验验证。尽管如此,这项研究依然为 AD 治疗领域带来了新的希望,为科研人员指明了新的研究方向,有望推动 AD 治疗药物的研发进程,让更多 AD 患者受益。