中国云南 5 岁以下住院患儿经典人星状病毒的流行特征与基因多样性研究:为防控和疫苗研发提供关键依据

【字体: 时间:2025年03月10日 来源:BMC Infectious Diseases 3.4

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  为探究经典人星状病毒(HAstV)在 5 岁以下急性胃肠炎(AGE)住院患儿中的流行特征及基因多样性,研究发现其多种特征,为防控和疫苗研发提供依据。

  在病毒的微观世界里,有一种名为经典人星状病毒(HAstV)的 “小怪兽”,它自 1975 年被发现以来,一直活跃在全球范围内,成为引起儿童急性胃肠炎(AGE)的重要 “幕后黑手” 之一。HAstV 属于星状病毒科,其基因组是约 7kb 长的单链正义 RNA,根据衣壳蛋白编码基因可分为经典 HAstV、墨尔本(MLB)和弗吉尼亚(VA)三大类,其中经典 HAstV 又包含 8 种不同血清型。全球儿童中 HAstV 的感染率差异较大,从 0 到超过 20% 不等,疾病负担沉重。然而,在我国云南地区,关于 HAstV 的系统流行病学研究却极为匮乏,其真实的流行情况和基因多样性犹如迷雾,亟待揭开。
为了驱散这片迷雾,云南省疾病预防控制中心的研究人员开展了一项意义重大的研究。他们的研究成果发表在《BMC Infectious Diseases》上,为后续的疾病防控和疫苗研发带来了曙光。

在研究过程中,研究人员运用了多种关键技术方法。首先,进行了临床粪便样本收集,从 2015 年 1 月至 2023 年 12 月,收集了云南省 5 岁以下 AGE 住院患儿的 2501 份粪便样本,这些样本均来自常规检测后的剩余样本,并在采集后储存于 - 70°C。接着是 RNA 提取和 HAstV 检测,使用特定试剂盒从样本中提取 HAstV RNA,然后通过实时荧光定量 PCR(RT-PCR)检测经典 HAstV,Ct 值 < 38 判定为阳性,Ct 值 < 25 的阳性样本送去进行下一代测序(NGS)。最后,利用 NGS 技术对符合条件的样本核酸进行富集、测序和分析,并通过构建系统发育树对 HAstV 进行基因分型。

研究结果主要从以下几个方面展开:

  1. 人口统计学特征:对 2501 份粪便样本分析发现,HAstV RNA 阳性率为 4.88%(122/2501)。男性患者样本占 59.33%(1484/2501),女性占 40.66%(1017/2501),男性患者数量是女性的 1.46 倍,但 HAstV 检测率在男女间无显著差异(男性 4.58%,女性 5.31%,)。患儿平均年龄为 12±17 个月,2 - 4 岁儿童更易感染 HAstV,其中 24 - 35 个月年龄组阳性检测率最高(7.56%,17/225)。
  2. 流行特征:从时间分布来看,2019 年 HAstV 检测率高达 17.79%(45/253),显著高于其他监测年份() 。这可能与当时云南旅游业的快速发展,人员流动增加有关。而在 COVID-19 疫情期间,由于防控措施实施,HAstV 传播受到抑制。从季节分布上,云南地区 HAstV 在夏季的流行率最高,达到 10.04%(50/498),显著高于其他季节()。
  3. 系统发育分析:研究人员仅获得 2022 - 2023 年的 17 个 HAstV 完整基因组序列。分析发现,云南地区流行的 HAstV 基因型包括 HAstV - 1 至 HAstV - 4,其中 HAstV - 1 是优势基因型,占比 64.70%(11/17),且所有 HAstV - 1 毒株均属于 1a 亚型;HAstV - 4 次之,占 23.53%(4/17);此外还有 1 株 HAstV - 2 和 1 株 HAstV - 3。不同地区的优势基因型存在差异,保山主要流行 HAstV - 1,而西双版纳则以 HAstV - 4 为主。

研究结论和讨论部分指出,该研究首次系统地揭示了云南地区 5 岁以下 AGE 住院患儿中 HAstV 的流行病学和基因多样性特征。研究发现 HAstV 感染率不受性别影响,24 - 35 个月年龄组儿童最为易感,且具有明显的季节性和年度差异。同时,明确了云南地区流行的 HAstV 主要基因型为 HAstV - 1 和 HAstV - 4,这为疫苗研发提供了重要的靶点参考。不过,研究也存在一定局限性,如仅获得 17 个 HAstV 序列,可能遗漏其他潜在流行的基因型,且监测范围仅覆盖部分地区。未来需要开展更广泛、更长期的监测,全面评估 HAstV 对云南地区人群健康的影响,为制定精准的防控策略和研发有效的疫苗奠定坚实基础。
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