转录因子 ELF-1:维持肠道稳态,对抗结肠炎的关键 “卫士”

【字体: 时间:2025年03月09日 来源:Communications Biology 5.2

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  研究人员针对炎症性肠病(IBD)病因不明问题,研究转录因子 ELF-1 在结肠炎中的作用,发现其可维持肠道上皮稳态,或为 IBD 潜在风险基因。

  炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD),就像是肠道里的一场 “持久战”,它慢性、反复,让患者苦不堪言。一直以来,IBD 的具体病因和发病机制都如同迷雾,难以捉摸。虽然大家知道转录因子 ELF-1(E74-Like Factor 1)在上皮细胞中高表达,但它在上皮细胞以及和上皮相关的 IBD 中到底扮演什么角色,却无人知晓。为了揭开这些谜团,郑州大学的研究人员开展了一项关于转录因子 ELF-1 在结肠炎发展中作用的研究。最终他们发现,ELF-1 在结肠炎中起着关键的保护作用,这一成果发表在《Communications Biology》上,为 IBD 的研究开辟了新的方向。
研究人员主要采用了以下几种关键技术方法:一是构建了 DSS 诱导的结肠炎小鼠模型,模拟 IBD 的病理特征;二是运用单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)技术,对结肠组织细胞进行转录分析,描绘细胞景观;三是开展骨髓移植实验,探究 ELF-1 缺乏导致结肠炎加重的细胞来源;四是通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)分析,确定 ELF-1 直接调控的基因。

下面来看具体的研究结果:

  • ELF-1 缺陷小鼠患严重 DSS 结肠炎:研究人员利用 DSS 诱导的结肠炎小鼠模型研究 ELF-1 的作用。实验中,Elf-1-/-小鼠在后期体重下降更明显,死亡率更高,疾病活动指数(DAI)评分也更高。它们的结肠更短,脾脏肿大更严重,结肠组织有更多炎症细胞浸润和更严重的肠道损伤,炎症细胞因子(Il1b 和 Il6)和趋化因子(Cxcl1、Cxcl2、Ccl2 和 Ccl3)表达显著上调。这表明 ELF-1 缺陷会加重 DSS 诱导的结肠炎,ELF-1 在抑制肠道炎症方面起保护作用。
  • ELF-1 缺陷导致以中性粒细胞浸润为主的炎症状态:为探究 ELF-1 缺陷加重结肠炎的机制,研究人员用 scRNA-seq 分析 Elf-1-/-和野生型(WT)小鼠结肠组织。结果发现,Elf-1-/-小鼠结肠组织中中性粒细胞比例大幅增加,基因本体(GO)富集分析显示,中性粒细胞上调的差异表达基因(DEGs)与粒细胞迁移有关,京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析表明其在 IL-17 信号通路和 TNF 信号通路显著富集。这说明 ELF-1 缺陷在 DSS 诱导的结肠炎中引发了以中性粒细胞浸润为主的炎症。
  • 非造血细胞中 ELF-1 缺陷加重 DSS 诱导的结肠炎:通过在 WT 和 Elf-1-/-小鼠间进行骨髓移植实验,研究人员发现,接受 WT 或 Elf-1-/-骨髓细胞的 Elf-1-/-受体小鼠,体重下降更多,DAI 评分更高,结肠更短,脾脏肿大更严重,结肠组织炎症浸润和肠道损伤更严重。这表明在 DSS 诱导的结肠炎模型中,ELF-1 缺陷加重结肠炎是因为非造血细胞中 ELF-1 缺乏,而非造血起源的免疫细胞。
  • ELF-1 缺陷增加结肠上皮细胞炎症趋化因子的产生:已知 ELF-1 缺陷对非造血细胞有影响,且肠道上皮对维持肠道稳态很重要,研究人员进一步研究肠道上皮细胞。他们发现,DSS 处理后,Elf-1-/-小鼠结肠组织中杯状细胞亚群缺失,KEGG 分析显示,DSS 处理的 Elf-1-/-小鼠结肠上皮细胞中上调的 DEGs 在细胞因子 - 细胞因子受体相互作用通路高度富集,多种炎症趋化因子表达显著升高。这意味着 ELF-1 缺陷可能增加结肠上皮细胞炎症趋化因子的产生,导致炎症状态。
  • ELF-1 直接调节 Rack1 的表达:作为转录因子,ELF-1 直接调控的基因可能在结肠炎中起关键作用。ChIP-seq 分析发现 Rack1 是 ELF-1 结合基因(在启动子区域)与 Elf-1-/-小鼠上皮细胞中下调的 DEGs 的唯一重叠基因,且 Elf-1-/-小鼠上皮细胞和结肠上皮组织中 Rack1 表达显著下调。鉴于 Rack1 对维持肠道稳态很关键,所以 ELF-1 可能通过直接调节 Rack1 基因的表达来预防结肠炎。

综合研究结论和讨论部分,本次研究意义重大。研究人员首次明确了转录因子 ELF-1 是结肠炎发展过程中的新型保护性调节因子。一方面,ELF-1 缺陷会使结肠上皮细胞中促炎趋化因子和细胞因子产生增加,引发中性粒细胞和其他免疫细胞广泛浸润的炎症状态,同时激活 Th17、ILC3、γδT 和 NKT 细胞中的 IL-17 信号通路;另一方面,ELF-1 可直接调节 Rack1 基因的表达,维持结肠上皮细胞的肠道稳态。这一发现表明 ELF-1 在结肠炎中起着至关重要的保护作用,很可能是结肠炎的潜在候选风险基因,为深入了解 IBD 的发病机制提供了新视角,也为未来 IBD 的治疗提供了潜在的新靶点 。

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