土耳其首次在肉鸡和火鸡群中检测到鸡形查帕马细小病毒：分子特征与流行病学新发现

为了解鸡形查帕马细小病毒（GaChpV）在土耳其家禽中的情况，研究人员检测分析后发现其分布情况、基因特征，为相关研究提供数据。

　　在全球的家禽养殖领域，小小的病毒却可能引发大大的问题。家禽养殖对于许多国家，包括土耳其来说，不仅是满足蛋白质需求的关键产业，更是经济发展的重要支柱。然而，家禽的健康问题一直是困扰养殖户的难题，其中肠道健康问题尤为突出。一旦家禽肠道出现问题，就像汽车发动机出了故障，会影响饲料的消化吸收，进而影响生长和免疫力。

肠道问题的 “肇事者” 众多，细菌、病毒、真菌、寄生虫等都可能是罪魁祸首，而病毒引起的肠炎更是研究的重点对象。近年来，随着病毒宏基因组学和下一代测序技术的发展，越来越多的新型病毒被发现。鸡形查帕马细小病毒（Chaphamaparvovirus galliform，GaChpV）就是其中之一，它属于细小病毒科（Parvoviridae），在不同动物体内都有发现，但关于它在家禽中的研究还很有限，特别是在土耳其，几乎没有相关研究。这就好比在黑暗中摸索，我们对这个 “小家伙” 在家禽身上的所作所为知之甚少。

为了揭开 GaChpV 在家禽身上的神秘面纱，来自土耳其菲拉特大学兽医学院病毒学系、微生物学系，以及安卡拉大学兽医学院微生物学系等机构的研究人员 Ahsen Nisa Aslan、Hasan Abayli 等人开展了一项研究，该研究成果发表在《BMC Veterinary Research》杂志上。

研究人员首先从土耳其不同地区的 76 个肉鸡养殖场和 30 个火鸡养殖场收集了 1060 份粪便样本，这些样本有的来自健康家禽，有的来自患有肠炎的家禽。接下来，研究人员运用了一系列技术手段来深入研究 GaChpV。

在检测和测序方面，研究人员采用了巢式 PCR（Nested PCR）技术，使用特定的引物对样本进行扩增，成功在部分肉鸡和火鸡样本中检测到了 GaChpV。随后，对部分 PCR 产物进行测序，并与 GenBank 中的序列进行比对，确定了临床样本中的 GaChpV。研究发现，肉鸡群中 GaChpV 的阳性率为 47.3%，火鸡群中为 6.6%，但 GaChpV 与肠炎病例之间没有统计学上的显著关联（p = 0.617）。

为了更全面了解 GaChpV 的基因特征，研究人员对一株来自肉鸡的 GaChpV 进行了全基因组测序。他们通过设计引物，扩增目标区域，然后进行测序和序列比对，成功构建了病毒基因组。该基因组由 4229 个核苷酸组成，与其他 GaChpV 菌株的核苷酸同一性在 78.93% - 98.82% 之间。

研究人员还进行了系统发育分析和氨基酸替换研究。通过构建系统发育树，他们发现来自肉鸡的 CkChPV/2023/UN - 2 - TR 菌株与 GaChpV - 2 菌株聚类在一起，并且该菌株与巴西、中国等国家的菌株在基因上有较高的相似性，但也存在一些氨基酸替换位点。

此外，研究人员对 CkChPV/2023/UN - 2 - TR 菌株进行了遗传重组分析，虽然在某些方法中检测到了重组信号，但未得到 SimPlot 分析的证实。同时，利用 Bepipred Linear Epitope Prediction 3.0 预测了该菌株衣壳蛋白的潜在 B 细胞线性表位，发现一些氨基酸替换可能会影响病毒的抗原特性。

综合来看，这项研究首次在土耳其的火鸡和肉鸡群中检测到了 GaChpV，为我们了解该病毒的分子流行病学和进化动态提供了重要数据。虽然目前还不能确定 GaChpV 是否会导致家禽疾病，但这些发现为后续研究指明了方向，就像在黑暗中点亮了一盏明灯，让我们朝着揭开 GaChpV 神秘面纱的目标又迈进了一步。未来，还需要进一步开展实验感染研究，以明确 GaChpV 在家禽疾病中的作用。