探秘复发 / 难治经典霍奇金淋巴瘤:基因突变图景与动态变化的关键发现

【字体: 时间:2025年03月08日 来源:Annals of Hematology 3

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  为探究原发性难治 / 复发经典霍奇金淋巴瘤(cHL)的基因组特征,研究人员测序分析,发现相关突变特征及治疗靶点。

  经典霍奇金淋巴瘤(classical Hodgkin lymphoma,cHL)是一种源于 B 细胞系的恶性淋巴瘤,在现代医学的积极治疗下,大部分患者都能被治愈。然而,仍有部分患者会面临疾病复发或一开始就对标准治疗方案不敏感(原发性难治)的困境。对于这些治疗效果不佳的病例,背后的基因组特征一直以来都不为人所熟知。这就好比在黑暗中摸索,医生们面对这些棘手的病例,却缺乏关键的 “地图” 来指引治疗方向。
为了打破这一困境,来自 University Cancer Center Schleswig-Holstein 等多个机构的研究人员展开了深入研究。他们的研究成果发表在《Annals of Hematology》上,为我们理解 cHL 的发病机制和治疗策略提供了新的视角。

在这项研究中,研究人员采用了多种关键技术方法。首先,从 44 例 cHL 患者中收集了 59 份福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本,包括 20 例对化疗有反应(无复发且随访至少 12 个月)的样本、26 例复发样本和 13 例原发性难治样本。接着,利用靶向杂交捕获测序技术,对 484 个基因的编码外显子及相关变异进行检测,平均测序深度达 8,698。之后,通过一系列数据处理和分析方法,包括序列比对、变异检测和筛选,以及网络传播分析、正选择评估等,来深入探究样本的基因组特征。

研究结果主要体现在以下几个方面:

  1. cHL 的突变谱:对 59 个样本分析发现,所有 cHL 病例都存在致癌相关突变,中位肿瘤突变负荷(TMB)为 50.50 个突变 / MB。突变类型多样,涵盖错义突变、无义突变、剪接位点突变等。同时,样本中霍奇金细胞含量与检测到的变异的中位变异等位基因频率(VAF)显著相关,这表明所发现的突变确实与 cHL 相关。
  2. 原发性难治、复发 cHL 和反应者的突变景观比较:KMT2D 是最常突变的基因,且突变与临床病程无关。TP53、ARID1A 等多个基因的突变也在 cHL 中被检测到。此外,EBV 阳性和阴性的 cHL 病例在突变基因上存在差异,如 AKT3 和 C8orf34 突变在 EBV 阳性病例中显著富集,而 FAT3 等基因的突变在 EBV 阴性病例中更常见。对比反应者和 rHL/prHL 样本,发现 rHL/prHL 样本中 PMS2、PDGFRB 等基因的突变显著富集,而 EGFR 和 NOTCH3 突变在反应者中富集。
  3. 复发 / 难治 cHL 的纵向动态和克隆进化:分析 rHL/prHL 患者的原发性诊断样本和后续活检样本发现,疾病进展后,BARD1 和 CIC 突变显著增加,而 ABCC2、ETV1 等多个基因的突变显著减少。同时,NOTCH 通路突变明显增加,而其他通路突变总体减少。通过网络传播分析还发现,不利临床病程的病例突变显著富集在细胞周期调节、粘着斑等信号通路,而反应者中影响肝细胞色素 P450 复合物的基因突变积累。
  4. 正选择分析:研究发现,与一线治疗的反应者相比,prHL 和 rHL 患者中非同义变异显著富集。在 prHL 患者疾病进展过程中,非同义变异进一步显著富集。对具有显著增加的 dN/dS比值的基因进行分析发现,NOTCH 信号通路基因存在正选择过程,而河马(hippo)通路基因中的非同义变异似乎经历负选择。
  5. 生存分析:对临床和分子数据的综合分析表明,BRCA1 突变在初始诊断时对无进展生存期(PFS)和总生存期(OS)有显著不良预测作用;BRIP1 突变可预测不良 OS;ERBB2 和 BRAF 突变在复发 / 进展样本中可预测良好的 PFS。

在讨论部分,研究人员指出,该研究全面分析了 prHL 和 rHL 的突变景观,发现其与反应者存在差异,并且确定了多个潜在的治疗靶点,这为未来治疗方案的拓展提供了方向。同时,研究还强调了 BARD1 突变在化疗耐药中的潜在作用,以及 NOTCH 通路突变在疾病进展中的重要意义。不过,研究也存在一定局限性,如回顾性研究设计、样本量有限等,未来需要在更大队列中进行前瞻性验证。但总体而言,这项研究为 cHL 的个体化治疗策略提供了重要的理论基础和研究方向,有望在未来帮助更多患者战胜疾病。

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