编辑推荐:
为了解决坦桑尼亚乙肝病毒(HBV)感染分子特征研究稀缺问题,研究人员开展 HBV 基因多样性研究,发现 HBV/A 和 HBV/D 为主,出现新基因型 HBV/G,对防控有重要意义。
乙肝病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染是一个全球性的公共卫生问题,严重威胁人类健康。HBV 属于嗜肝 DNA 病毒科正嗜肝 DNA 病毒属,其基因组为部分双链环状 DNA,可通过多种复杂机制进行复制。HBV 具有多种基因型和亚型,不同基因型在全球的分布存在差异,并且对病毒的传播、发病机制、治疗反应以及疫苗效果等都有着重要影响。
在全球范围内,不同地区的 HBV 基因型分布各有特点,比如亚洲以 HBV/C 为主,欧洲则以 HBV/D 为主。然而,在坦桑尼亚,以往对 HBV 感染的分子特征研究相对较少,这使得在防控 HBV 感染方面缺乏关键信息,难以实现到 2030 年消除 HBV 感染的目标。此前,坦桑尼亚虽有一些关于 HBV 基因型的报道,但大多局限于献血者,且研究不够全面深入,对 HBV 逃逸突变(HBV-escape mutations)和抗病毒药物耐药相关突变的研究也较为匮乏。
为了填补这些知识空白,来自坦桑尼亚和德国多所机构的研究人员开展了一项研究。他们以位于坦桑尼亚西北部的布甘多医疗中心(Bugando Medical Centre)的慢性乙肝患者为研究对象,旨在通过对 HBV 聚合酶(Pol)基因的部分扩增,对 HBV 病毒进行常规分子特征分析。该研究成果发表在《Scientific Reports》上。
在研究方法上,研究人员首先从 2023 年 5 月至 10 月的另一项研究中获取了存档的血浆样本。这些样本来自反复确诊乙肝表面抗原(HBsAg)阳性超过六个月、HBV 脱氧核糖核酸(DNA)水平>300,000 IU/mL 且血浆体积>300 μL 的患者。研究人员收集了患者的人口统计学数据和临床数据,包括 HBV-DNA、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)和全血细胞计数(FBP)参数等。
接着,研究人员使用 Qiagen DNA Blood Mini Kit 提取血浆样本中的 DNA,并将提取的 DNA 送至德国进行扩增、测序和序列分析。他们通过多种数据库和工具,如 HIV/HBV Stanford 数据库、GenoPheno2hbv 2.0、NCBI HBV 基因分型工具和乙肝数据库(HBVdb)工具等,来确定 HBV 的基因型、亚型和突变模式。同时,运用系统发育分析和比较系统发育分析,探究 HBV 毒株之间的亲缘关系。
在研究结果方面,患者的社会人口统计学和临床数据显示,22 个高 HBV-DNA 水平的样本中,21 个成功扩增并测序。患者平均年龄为 41±11 岁,多数为男性(85.7%),来自姆万扎地区的患者占比最多(38.1%) 。患者的 HBV-DNA 中位数为 979 [185.5–8457.5] IU/mL,ALT 和 AST 水平多数高于正常范围,APRI 评分显示多数患者肝脏存在一定损伤。
分子特征分析发现,HBV/A 是最主要的基因型,占比 76.2%(16/21),且均为 A1 亚型;其次是 HBV/D,占 19%(4/21);首次在坦桑尼亚发现 HBV/G,占 4.8%(1/21) 。HBV/A1 的血清型以 Adw2 为主,占 81.3%(13/16),HBV/D 的血清型均为 Ayw2。
在乙肝逃逸突变方面,21 个测序样本中,4 个(19%)存在 HBV 逃逸突变,突变类型包括 T123V、Y134N、P120T 和 T123A。有逃逸突变的患者年龄中位数为 48 [44 - 52.5] 岁,均为男性,且 HBV DNA 水平较高。与之前的研究相比,HBV/A 和 HBV/D 中逃逸突变的比例显著增加。
系统发育分析表明,所有测序的 HBV 毒株根据各自基因型密切相关。HBV/A 分离株与坦桑尼亚其他地区的先前分离株随机聚类,但与国外分离株混合较少;HBV/D 分离株与坦桑尼亚北部和湖区的先前分离株聚类,未与国外分离株混合;HBV/G 分离株在系统发育分析中与 HBV/A 分离株聚类,可能是由于基因分型工具的局限性。
综合来看,研究人员得出结论,HBV/A(HBV/A1)和 HBV/D 在坦桑尼亚西北部长期占主导地位,多数 HBV/A 和所有 HBV/D 具有坦桑尼亚特异性。然而,该地区 HBV 基因多样性正在发生变化,新出现的 HBV/G 基因型值得关注。HBV 逃逸突变比例的增加可能威胁该国血清学诊断技术和乙肝疫苗的未来效力。
该研究意义重大,首次在坦桑尼亚发现 HBV/G 基因型,为 HBV 的传播和进化研究提供了新线索。同时,研究结果强调了在该地区进行频繁 HBV 分子评估的必要性,有助于制定更有效的 HBV 感染防控策略,对实现全球消除 HBV 感染的目标具有重要推动作用。不过,研究也存在一定局限性,如样本量较小、单中心研究、测序方法的局限性等,未来需要更大规模、多中心的研究来进一步验证和深入探究。
閹垫捁绁�
娑撳娴囩€瑰宓庢导锔炬暩鐎涙劒鍔熼妴濠団偓姘崇箖缂佸棜鍎禒锝堥樋閹活厾銇氶弬鎵畱閼筋垳澧块棃鍓佸仯閵嗗甯扮槐銏狀洤娴f洟鈧俺绻冩禒锝堥樋閸掑棙鐎芥穱鍐箻閹劎娈戦懡顖滃⒖閸欐垹骞囬惍鏃傗敀
10x Genomics閺傛澘鎼isium HD 瀵偓閸氼垰宕熺紒鍡氬劒閸掑棜椴搁悳鍥╂畱閸忋劏娴嗚ぐ鏇犵矋缁屾椽妫块崚鍡樼€介敍锟�
濞嗐垼绻嬫稉瀣祰Twist閵嗗﹣绗夐弬顓炲綁閸栨牜娈慍RISPR缁涙盯鈧鐗哥仦鈧妴瀣暩鐎涙劒鍔�
閸楁洜绮忛懗鐐寸ゴ鎼村繐鍙嗛梻銊ャ亣鐠佹彃鐖� - 濞e崬鍙嗘禍鍡毿掓禒搴n儑娑撯偓娑擃亜宕熺紒鍡氬劒鐎圭偤鐛欑拋鎹愵吀閸掔増鏆熼幑顔垮窛閹貉傜瑢閸欘垵顫嬮崠鏍掗弸锟�
娑撳娴囬妴濠勭矎閼崇偛鍞撮摂瀣鐠愩劋绨版担婊冨瀻閺嬫劖鏌熷▔鏇犳暩鐎涙劒鍔熼妴锟�