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为探究肿瘤细胞在 3D 环境下的代谢表型及调控因素,研究人员聚焦 Cxcl5,发现其对肿瘤代谢重编程等至关重要,为靶向治疗提供依据。
肿瘤,这个医学界的 “头号难题”,一直以来都让科研人员和医生们绞尽脑汁。肿瘤的发生发展是一个极其复杂的过程,其中肿瘤微环境(Tumor Microenvironment,TME)起着关键作用。TME 就像一个 “大染缸”,里面不仅有癌细胞,还有免疫细胞、成纤维细胞、内皮细胞等各种细胞,以及细胞外基质(Extracellular Matrix,ECM)、缺氧、营养物质等非细胞因素。这些因素相互作用,共同影响着肿瘤的生长、转移和对治疗的反应。
在肿瘤微环境中,癌细胞的代谢方式会发生改变,这一现象被称为代谢重编程(Metabolic Reprogramming)。代谢重编程就像是癌细胞的 “生存秘籍”,它能让癌细胞在恶劣的环境中获取足够的能量和物质,维持自身的生长和增殖。然而,目前对于肿瘤细胞在三维(3D)环境下的代谢表型,以及调控这些代谢变化的内在因素,我们知之甚少。这就好比在黑暗中摸索,我们虽然知道前方有宝藏(攻克肿瘤的方法),但却找不到路。
为了揭开这些谜团,韩国科学技术院(KAIST)等机构的研究人员开展了一项深入的研究。他们的研究成果发表在《Cell Death & Differentiation》杂志上,为我们理解肿瘤的发生发展机制提供了新的视角,也为肿瘤治疗开辟了新的方向。
研究人员在本次研究中用到了多个关键技术方法。在细胞培养方面,构建了 3D 肿瘤球 - 基质胶(Matrigel)培养系统模拟肿瘤微环境。通过 CRISPR/Cas9 技术对 Cxcl5 基因进行编辑,构建基因敲除细胞系。运用 RNA 测序技术分析基因表达谱,结合基因本体论(GO)分析和基因集富集分析(GSEA)探究基因功能和相关通路。利用蛋白质免疫印迹(Western blotting)、实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测蛋白和基因表达水平。采用代谢组学技术分析细胞代谢物变化。
下面来看看具体的研究结果:
- Cancer-derived CXCL5 is necessary for tumor spheroid growth:研究人员建立了 3D 肿瘤球 - 基质胶培养系统,用 M0 或 M1 巨噬细胞条件培养基处理胰腺癌细胞系 Panc02 和结肠癌细胞系 MC38。发现 M1 条件培养基能显著增加 Panc02 肿瘤球面积,但不影响细胞增殖。进一步研究发现,M1 条件培养基处理后,趋化因子 Cxcl5 表达显著上调,且在 3D 培养中更为明显。敲除 Cxcl5 基因后,肿瘤球生长受限,细胞数量减少,而在 2D 培养中,野生型和 Cxcl5 敲除细胞的增殖率没有差异。这表明 Cxcl5 是肿瘤在 3D 环境下生存和生长的必需因子。
- Cxcl5 deletion impaired global metabolic reprogramming in 3D:对野生型和 Cxcl5 敲除细胞进行 RNA 测序,主成分分析(PCA)显示,2D 培养时两者基因表达谱相似,3D 培养时则明显不同。GO 分析发现,3D 培养的野生型细胞中,与细胞黏附、ECM 组织、缺氧反应和代谢过程相关的基因表达上调,而 Cxcl5 敲除后,这些基因的表达发生逆转。GSEA 分析表明,Cxcl5 缺失阻碍了 3D 环境下对肿瘤生长至关重要的代谢途径的重编程。
- Cancer cells lacking Cxcl5 are more sensitive to hypoxic cell death:在缺氧条件下,细胞会从氧化磷酸化转变为糖酵解以维持能量产生和生物量合成。研究发现,3D 培养的野生型细胞中许多缺氧相关基因上调,但 3D 培养的 Cxcl5 敲除细胞中这些基因的诱导受损,包括缺氧诱导因子 1α(Hif1α)。通过实验证实,Cxcl5 敲除的肿瘤球对缺氧诱导的细胞死亡更敏感,过表达 Hif1α 可使 Cxcl5 敲除细胞对缺氧细胞死亡的抗性恢复到野生型水平。
- 3D-cultured Cxc15 cells exhibit increased mitochondrial ROS and ferroptosis:代谢组学分析显示,3D 培养的野生型细胞糖酵解中间产物水平显著增加,而 Cxcl5 敲除细胞中这些代谢物减少,且还原型谷胱甘肽(GSH)、L - 胱硫醚和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)等抗氧化代谢物也减少。这导致 Cxcl5 敲除细胞线粒体活性氧(ROS)水平升高,线粒体膜电位(MMP)超极化,脂质过氧化增加,最终引发铁死亡(Ferroptosis)。
- Hif1α or Myc overexpression restricted ferroptosis and restored growth of 3D-cultured Cxcls cells:丝氨酸 / 甘氨酸生物合成和一碳代谢受多种转录因子调节,包括 HIF-1A、MYC 等。研究发现,3D 培养的野生型细胞中 Myc 表达高于 2D 培养,Cxcl5 缺失会阻断 Myc 的上调。过表达 Hif1α 或 Myc 可逆转 3D 培养的 Cxcl5 敲除细胞的氧化损伤,恢复其代谢途径和肿瘤球生长。其中,Myc 过表达对丝氨酸 / 甘氨酸生物合成和一碳代谢的挽救作用更强。
- PAAD patients expressing higher levels of CXCL5-correlated genes associated with hypoxia and metabolism have poorer prognosis:研究人员分析胰腺癌(PAAD)患者数据发现,CXCL5 表达与许多与缺氧、糖酵解相关代谢途径、单糖代谢、氮代谢和甾醇生物合成相关的基因呈正相关。PAAD 患者中,这些与 CXCL5 相关基因表达水平较高的患者总体生存率较差。
- HIF1A or MYC overexpression may restrict the efficacy of drug targeting CXCR2:CXCL5 通过与趋化因子受体 CXCR2 结合促进肿瘤进展。研究发现,敲除 Cxcr2 基因可抑制肿瘤球生长,且 3D 培养的 Cxcr2 敲除细胞无法诱导 Hif1α 和 Myc 表达。此外,HIF1A 或 MYC 过表达与胰腺癌细胞系对 CXCR2 靶向药物 AZD5069 的敏感性降低相关。
研究结论和讨论部分,本次研究揭示了肿瘤来源的 Cxcl5 在肿瘤细胞适应 3D 肿瘤微环境的代谢重编程中起着关键作用。Cxcl5 缺陷的癌细胞在糖酵解、丝氨酸 / 甘氨酸生物合成和一碳代谢方面存在缺陷,导致能量、生物量和抗氧化剂产生不足,从而使肿瘤球生长受限,并增加对铁死亡的敏感性。此外,研究还发现 Hif1α 和 Myc 在调节肿瘤细胞代谢和对缺氧的反应中起重要作用,且它们的过表达可能影响靶向 CXCR2 药物的疗效。这些发现为肿瘤治疗提供了新的潜在靶点和理论依据,尤其是针对胰腺癌的治疗。同时,研究中发现的与 CXCL5 相关的基因可作为潜在的生物标志物,用于预测患者预后和指导个性化治疗。然而,目前对于 Hif1α 和 Myc 转录调控的机制仍有待进一步研究,未来的研究可以朝着这个方向深入探索,以更全面地了解肿瘤代谢的调控网络,为攻克肿瘤这一难题提供更多的思路和方法。