创新 eDNA 检测法:高敏低成本,精准识别水生生物物种
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时间:2025年03月06日
来源:Limnology 1.4
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研究人员为普及 eDNA 物种鉴定法,开发新检测法,其灵敏度与 qPCR 相当且成本低。
环境 DNA(eDNA)已在水生大型生物调查中有效用于物种鉴定。为推广该方法,需要一种经济高效且灵敏度高的分析方法。在这项研究中,研究人员开发了一种 eDNA 检测方法,其灵敏度与传统定量实时 PCR(qPCR)相当,且无需昂贵设备。该方法通过引入错配引物设计和巢式 PCR(Nested PCR)提高了灵敏度。实验对象为黑鲈(Micropterus nigricans)。使用无错配引物的标准 PCR 不仅能在黑鲈中检测到扩增子,在小口黑鲈(M. dolomieu)和日本花鲈(Lateolabrax japonicus)中也能检测到。然而,错配引物仅能扩增黑鲈的 DNA,对非目标物种则无扩增条带。终点 PCR(Endpoint PCR)的灵敏度虽低于 qPCR,但能在环境样本中特异性地检测目标物种。类似方法应用于鳑鲏鱼类(该鱼类有许多近缘物种)时,能特异性检测到中华鳑鲏(Acheilognathus cyanostigma)的 eDNA。这种 eDNA 分析方法经济高效,因为其灵敏度与传统 qPCR 方法相当,且无需昂贵设备。
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